Dock4.0を用いた非ステロイド性抗炎症剤のCOX1およびCOX2に対する結合モードに関する研究 A Study on Binding Modes of Nonsteroidal Anti-inflammatory Drugs to COX1 and COX2 as Obtained by Dock4.0

この論文にアクセスする

この論文をさがす

著者

抄録

COX1の酵素活性に影響を与えることなくCOX2 を選択的に阻害する薬物が理想的な非ステロイド性抗炎症剤(NSAID)であるといわれている。そこで、Dock4.0を用いて、NSAIDのCOX1とCOX2に対する阻害モードの研究を水素結合と結合エネルギーの点から試みた。COX2に選択性の有るNSAIDの阻害モードは、R.S. Spangler (Seminars in Arthritis and Rheumatism, 26, 435-446 (1996)の報告しているin vitroのパターンと類似していることがわかった。従って、Dock4.0と報告されているin vitro研究の結果の間にはかなり良い相関性があるといえる。COX1の阻害モードに関しては1種類が類似、他の1種類が類似せず、3番目は中間であったnabumetone, meclofenamate, niflumic acid, indomethacin, sulindac, および flurbiprofenのごときNSAIDがCOX2に結合する場合、1から3種類(延べ少なくとも12種類)の水素結合が存在することがわかった。 このような水素結合の形成に関与するアミノ酸残基は、phe A518, Arg A120, Tyr A385, His A90, および Tyr A355 であった。Phe A518, およびHis A90 はすでにR. G. Kurumbail et al. (Nature, 384, 644-648 (1996)) によって報告されているが、それ以外のアミノ酸残基についてはいまだ報告されていなくCOX2と阻害剤の結合様式は想像以上に複雑であるといえる。

Nonsteroidal anti-inflammatory drugs (NSAIDs) which selectively inhibit COX2 without affecting an enzyme activity of COX 1 would be an ideal anti-inflammatory drug. Thus an attempt was made to examine those binding modes of NSAIDs against COX1 and COX2 in terms of hydrogen bond and binding energy by utilizing Dock4.0. It was shown that binding mode to COX2 selective NSAIDs coincided with the result reported in the in vitro study by R.S. Spangler (Seminars in Arthritis and Rheumatism, 26, 435-446 (1996)). Thus, it can be said that there is a fairly good correlation between the Dock4.0 results and those reported in the in vitro study. As far as the binding mode of COX1 selective NSAIDs is concerned one corresponded to the in vitro study reported by R.S. Spangler, another did not and a third presented a mediocre conformity. It was also shown that there existed one to three H-bonds with the net total being at least twelve when NSAIDs such as nabumetone, meclofenamate, niflumic acid, indomethacin, sulindac, and flurbiprofen were bound to COX2. Amino acid residues involved in such hydrogen bonds were Phe A518, Arg A120, Tyr A385, His A90, Tyr A355. Met A522, Ser A353, Gln A192, Leu A352, and Arg A513. Phe A518 and His A90 were reported by R. G. Kurumbail et al. (Nature, 384, 644-648 (1996)) but the rest of the amino acid residues were not.

収録刊行物

  • The Journal of chemical software  

    The Journal of chemical software 5(4), 147-162, 1999-12-15 

    SOCIETY OF COMPUTER CHEMISTRY, JAPAN

参考文献:  17件

参考文献を見るにはログインが必要です。ユーザIDをお持ちでない方は新規登録してください。

各種コード

  • NII論文ID(NAID)
    10004709279
  • NII書誌ID(NCID)
    AN10470405
  • 本文言語コード
    ENG
  • 資料種別
    ART
  • ISSN
    09180761
  • NDL 記事登録ID
    4976150
  • NDL 雑誌分類
    ZP1(科学技術--化学・化学工業) // ZM13(科学技術--科学技術一般--データ処理・計算機)
  • NDL 請求記号
    Z17-1611
  • データ提供元
    CJP書誌  NDL  J-STAGE 
ページトップへ