形態的特性とRAPDマーカーによるアセロラ(Malpighia glabra Linn.)栽培品種の品種分類 Classification of Some Acerola (Malpighia glabra Linn.) Cultivars Using Morphometric Descriptors and RAPD Markers

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著者

    • 米本 仁巳 YONEMOTO Yoshimi
    • 国際農林水産業研究センター沖縄支所 Tropical Fruit Laboratory, Okinawa Subtropical Station, Japan International Research Center for Agricultural Sciences
    • 加藤 秀憲 [他] KATO Hidenori
    • 国際農林水産業研究センター沖縄支所 Tropical Fruit Laboratory, Okinawa Subtropical Station, Japan International Research Center for Agricultural Sciences
    • MACHA Mustad Malid
    • ソコイネ農業大学農学部 Faculty of Agriculture, Sokoine University of Agriculture

抄録

沖縄県と鹿児島県で栽培されているアセロラの栽培品種'Okinawa Sweet'と'Kagoshima Sweet'の品種同定を目的に, 形態的特性とRAPDマーカーを用いて国際農林水産業研究センター沖縄支所(JIRCAS)にハワイから導入されている7品種と比較した.形態的特性から全品種を識別することは出来なかったが, 24個のプライマーから増幅された57個のRAPDマーカーを用いることで全品種の識別が可能となった.全品種を2品種ごとに分け, 遺伝的類似性をJaccardの相関係数で検討した結果, 形態的特性での相関係数は0.00〜1.00(平均0.304), RAPDマーカーでは0.077〜0.967(平均0.406)で, 両マーカーでの類似性係数には1%水準で有意な相関がみられた.形態的特性およびRAPDマーカーによる系統樹は類似しており, RAPDマーカーによる系統樹で9品種は大きく2つのグループに分けられた.'Hawaiian Queen', 'Manoa Sweet', 'Kagoshima Sweet'および'Okinawa Sweet'の4品種間には形態的特性およびRAPDマーカーでの識別で遺伝的に非常に近い近縁関係がみられた.

Morphometric descriptors and random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers were used for the classification of acerola cultivars 'Okinawa Sweet' and 'Kagoshima Sweet' grown in Okinawa and Kagoshima Prefecture, respectively by comparison with seven cultivars introduced from Hawaii into the germplasm bank of Japan International Research Center for Agricultural Sciences (JIRCAS). Even though cultivar identification could not be achieved by using morphometric descriptors, all the genotypes were classified according to RAPD-based DNA analysis using 57 RAPD markers amplified by 24 primers. Genetic similarities between all the pairwise combinations of cultivars were calculated using Jaccard's coefficient, which ranged between 0.00 to 1.00 with a mean value of 0.304, and 0.077 to 0.967 with a mean value of 0.406 for the morphometric descriptors and RAPD markers, respectively. RAPD similarity coefficients were correlated with morphometric similarity coefficients (r=0.578, p<0.01). The relative position of different cultivars in a RAPD-based dendrogram was partly similar to that in a dendrogram between morphometric descriptors. The RAPD-based dendrograms revealed that the 9 cultivars could be classified into two groups. Four cultivars namely, 'Hawaiian Queen', 'Manoa Sweet', 'Kagoshima Sweet', and 'Okinawa Sweet', were clustered very closely, indicating the presence of a narrow genetic variability among them, based on both marker types.

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各種コード

  • NII論文ID(NAID)
    10021060451
  • NII書誌ID(NCID)
    AN00199779
  • 本文言語コード
    ENG
  • 資料種別
    ART
  • ISSN
    00215260
  • NDL 記事登録ID
    7922742
  • NDL 雑誌分類
    ZR7(科学技術--農林水産--農産)
  • NDL 請求記号
    Z18-327
  • データ提供元
    CJP書誌  NDL  NII-ELS 
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