隠れマルコフモデルが明かす生物配列の情報

• 矢田 哲士

  理化学研究所ゲノム科学総合研究センター

書誌事項

タイトル別名

• Hidden Markov Model Reveals Biological Sequence Information.
• 解説 隠れマルコフモデルが明かす生物配列の情報
• カイセツ カクレ マルコフ モデル ガ アカス セイブツ ハイレツ ノ ジョウホウ

抄録

Biological sequence analysis based on hidden Markov models (HMMs) is no doubt one of the most successful endeavors in the field of bioninformatics. HMMs are widely used not only for motif search but also for gene finding and protein fold recognition nowadays. Compared with existing models, HMMs possess flexibility to describe complex structures of sequence information. Moreover, various kinds of computer algorithms based on HMMs which enable us to model and interpret biological sequence data have been developed. In this paper, we introduce recent research topics of biological sequence analysis using HMMs and discuss a future perspective of the research.

収録刊行物

• 生物物理

  生物物理 40 (1), 25-30, 2000

  一般社団法人 日本生物物理学会

キーワード

• biological sequence analysis
• hidden Markov model
• stochastic regular grammar
• profile
• gene finding

詳細情報

• CRID: 1390001206533181824
• NII論文ID: 110001153889
• NII書誌ID: AN00129693
• DOI: 10.2142/biophys.40.25
• COI: 1:CAS:528:DC%2BD3cXpsVeksA%3D%3D
• ISSN: 13474219
• ISSN: 05824052
• NDL書誌ID: 4968622
• Web Site: https://ndlsearch.ndl.go.jp/books/R000000004-I4968622
• Web Site: http://www.jstage.jst.go.jp/article/biophys/40/1/40_1_25/_pdf
• 本文言語コード: ja
• データソース種別:
  • JaLC
  • NDL
  • Crossref
  • CiNii Articles
• 抄録ライセンスフラグ: 使用不可