対話的動作を考慮したタンパク質立体構造予測システム

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  • タイワテキ ドウサ オ コウリョ シタ タンパクシツ リッタイ コウゾウ ヨソク システム
  • A Computing System for Protein Structure Prediction with Trial-and-error Process

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抄録

本論文では，対話的動作を考慮したタンパク質立体構造予測システムとその適用事例について述べる．タンパク質立体構造予測の現場では，エキスパートの経験を導入した試行錯誤によるプログラムの実行が求められている．そこで，我々は試行錯誤によるプログラムの実行を実現するために，ワークフローを修正すると修正したワークの位置から再実行するといった，柔軟なワークフロー制御を導入した対話的動作を考慮した計算システムを提案する．そして，提案したシステムにROKKY と呼ばれるタンパク質立体構造予測システムを対話的動作を考慮した計算システムとして適用した．我々の提案するシステムを使うことにより，利用者は計算システムを意識することなくタンパク質立体構造予測を行えるようになった．

The paper describes a computing system for a protein structure prediction and a case study of its system. Scientists of protein structure prediction have to do execution applications for protein structure prediction by trial-and-error process. For the purpose of doing execution applications by trial-and-error process, we propose a computing system with a flexible workflow mechanism, and apply a protein structure prediction system called ROKKY. By using the system, scientists could be easily to do simulation of protein structure prediction.

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