ＳＮＰおよびＳＣＡＲマーカーを用いたザオウカラマツ子供群の純系鑑定

• 能勢 美峰

  九州大学大学院生物資源環境科学府

• 白石 進

  九州大学大学院農学研究院

• 河合（宗原） 慶恵

  独立行政法人森林総合研究所林木育種センター

• 河崎 久男

  独立行政法人森林総合研究所林木育種センター

• 川崎 圭造

  信州大学農学部

書誌事項

タイトル別名

• Identification of the Genuineness of Zao Larch Progenies by Using SNP and SCAR Markers.
• SNP オヨビ SCAR マーカー オ モチイタ ザオウカラマツ コドモグン ノ ジュンケイ カンテイ

抄録

ザオウカラマツの純系保存を行うにあたって, 信頼性の高い管理技術としてSNPマーカーの開発を行った。これまでの研究で得られたザオウカラマツあるいはニホンカラマツのいずれかで特異的に増幅される17のRAPDフラグメントのシークエンス情報をもとに, プライマー対を設計した。これらを用いてザオウカラマツとニホンカラマツのフラグメントを増幅, シークエンスを行った。得られた塩基配列情報から, ザオウカラマツに特異性の高いSNPを探索し, これらをSNPマーカーとした。本研究において開発した二つのSNPマーカーと既往の三つのSCARマーカーを用いた場合, 危険率 (誤識別の可能性) 2.28×10⁻⁴で純系ザオウカラマツと雑種 (ザオウカラマツ×ニホンカラマツ) を識別することが可能になった。これら五つのDNAマーカーを用いて現地外保存されている現地ザオウカラマツ由来の子供群294個体の純系鑑定を行ったところ, すべての個体が純粋なザオウカラマツであった。

収録刊行物

• 日本森林学会誌

  日本森林学会誌 91 (5), 360-365, 2009

  日本森林学会

キーワード

• 遺伝資源
• ザオウカラマツ
• <I>Larix kaempferi</I>
• SCAR
• SNP

詳細情報

• CRID: 1390282680205398528
• NII論文ID: 110007466446
• NII書誌ID: AA12003078
• DOI: 10.4005/jjfs.91.360
• COI: 1:CAS:528:DC%2BD1MXhsFaht7vL
• ISSN: 1882398X
• ISSN: 13498509
• NDL書誌ID: 10479669
• Web Site: https://agriknowledge.affrc.go.jp/RN/2010782165
• Web Site: http://id.ndl.go.jp/bib/10479669
• Web Site: https://ndlsearch.ndl.go.jp/books/R000000004-I10479669
• Web Site: http://www.jstage.jst.go.jp/article/jjfs/91/5/91_5_360/_pdf
• 本文言語コード: ja
• データソース種別:
  • JaLC
  • IRDB
  • NDL
  • Crossref
  • CiNii Articles
  • KAKEN
• 抄録ライセンスフラグ: 使用不可