チャ葉緑体rbcL-accD領域塩基配列の多様性 Intraspecific Sequence Variation in the rbcL-accD Region of the Chloroplast Genome in Tea (Camellia sinensis)

チャの遺伝的差異を明らかにするため、21の日本品種、22個体および7個体の中国およびベトナムで採集されたチャ、6つの中国品種について、葉緑体rbcL-accl)領域の塩基配列を決定した。この領域はよく保存されていた。日本品種および5つの中国品種は、一塩基多型に基づき2つのタイプに分類された。両タイプども日本固有ではなく、アジア大陸に起源し日本に導入されたと考えられた。中国南部で収集されたチャでは、近縁種のタリエンシスおよびイラワジエンシスに特異的な3つのIn/Del(insertion/deletion)のうち1つまたは2つを有するものが複数見出された。葉緑体の塩基配列の多様性を用いることにより、市販茶の原葉として使用された品種の遺伝的背景を判別することができる。

In order to reveal intraspecific variation in the tea (Camellia sinensis), the nucleotide sequence of the rbcL-accD region in the chloroplast genome of 21 Japanese tea cultivars, 22 and 7 tea clones collected in China and Vietnam, respectively, and 6 Chinese cultivars were determined. The nucleotide sequence was well conserved. Eighteen Japanese tea cultivars selected from local varieties were divided into 2 types based on 2 SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms). One of these types (Ia) was mainly distributed in Kyoto. Both types were also found in the Asian continent, indicating that they were derived from there to Japan. Twelve additional types were found in tea of the Asian continent. Some of the tea clones from south China had one or two of the three In/Dels (insertion/deletion polymorphism), which are unique in C. taliensis and C. irrawadiensis. Chloroplast DNA can be used in order to distinguish genetic background of the cultivars of tea leaves on the market.