国際標準化糖鎖構造表記法WURCSの開発

• 山田 一作

  公益財団法人 野口研究所

• 木下 聖子

  創価大学 工学部 生命情報工学科 産業総合研究所 糖鎖創薬技術研究センター

• 松原 正陽

  公益財団法人 野口研究所

• 土屋 伸一郎

  創価大学 工学部 生命情報工学科

• 新町 大輔

  創価大学 工学部 生命情報工学科

• 藤田 晶大

  創価大学 工学部 生命情報工学科

• 青木 信幸

  創価大学 工学部 生命情報工学科

• 鹿内 俊秀

  産業総合研究所 糖鎖創薬技術研究センター

• 鈴木 芳典

  産業総合研究所 糖鎖創薬技術研究センター

• ソロビヨワ イェレナ

  産業総合研究所 糖鎖創薬技術研究センター

• 藤田 典昭

  産業総合研究所 糖鎖創薬技術研究センター

• 奥田 修二郎

  新潟大学大学院医歯学総合研究科

• 川嵜 敏祐

  立命館大学 糖鎖工学研究センター

• 成松 久

  産業総合研究所 糖鎖創薬技術研究センター

書誌事項

タイトル別名

• Development of Web3 Unique Representation of Carbohydrate Structures

抄録

糖鎖研究において産出された糖鎖データには様々な表現方法が存在しており、このことは近年のウェブ技術を利用したライフサイエンスデータベース間の連携の妨げとなっていた。そこで我々は、糖鎖構造に対する新たな表記法としてWURCS（Web3 Unique Representation of Carbohydrate Structures）を開発した。WURCSは、曖昧さを含むあらゆる糖鎖構造を一意に表せる線形表記法であり、URIとして利用可能である。併せて、糖鎖データベースの構造データからWURCSに変換するソフトウェアを開発した。これにより共通の糖鎖構造を含む分子の横断検索が可能となる。また、WURCS普及促進のためのWURCSWorkingGroupを組織し、国際標準化に向けた活動を行っている。

収録刊行物

• ケモインフォマティクス討論会予稿集

  ケモインフォマティクス討論会予稿集 2014 (0), O10-O10, 2014

  公益社団法人 日本化学会・情報化学部会

キーワード

• 糖鎖
• 炭水化物
• 糖鎖構造
• 表記法
• データベース
• セマンティックウェブ

詳細情報

• CRID: 1390282680713663104
• NII論文ID: 130005146263
• DOI: 10.11545/ciqs.2014.0_o10
• 本文言語コード: ja
• データソース種別:
  • JaLC
  • CiNii Articles
• 抄録ライセンスフラグ: 使用不可