クリニカルシーケンスとしての院内完結型網羅的がん遺伝子解析（CLHURC検査）の実際

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  • Clinical sequencing for comprehensive genomic profiling for cancer called “CLHURC”

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抄録

<p>北海道大学病院では2016年4月に「がん遺伝子診断部」を設置し，業務を開始した。がん遺伝子外来，診療，患者採血，核酸抽出，ライブラリー構築，シークエンス，遺伝子解析，チームカンファレンス（cancer board），遺伝カウンセリング，結果報告をすべてインハウスで行っている，院内完結型網羅的がん遺伝子解析（Clinical Sequence System in Hokkaido University Hospital for Cancer Individualized Medicine：CLHURC検査）を目的とするクリニカルシーケンスを実施する専門部署としては，国内初となった。次世代シーケンサー（next generation sequencer; NGS）を用いて独自でパネル化したがんドライバー遺伝子変異のうち最大160種類を網羅的に解析している。CLHURC検査では，患者の血液と病理組織検体から核酸を抽出し，NGSで遺伝子解析を行っている。検体は検者血液からの正常DNAと腫瘍細胞を含むホルマリン固定パラフィン包埋切片から腫瘍細胞DNAを対象としているため，検体の取扱いが重要ポイントの一つである。従来，ホルマリン固定検体からの核酸抽出は，ホルマリンの影響によりDNAの断片化が進むため，良質なDNA抽出は困難であるとされてきた。また，遺伝子解析の解釈や，遺伝子情報の取り扱いなど，様々な管理や体制が必要となる。今後，クリニカルシーケンスが導入されていく中で起こり得る課題を見据えながら，現在，運用しているクリニカルシーケンス「CLHURC検査」の取り組みを報告する。</p>

収録刊行物

  • 医学検査

    医学検査 67 (1), 131-141, 2018

    一般社団法人 日本臨床衛生検査技師会

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