ビリン還元酵素PcyAと基質ビリベルジン複合体の中性子結晶構造解析で見えてきたもの

DOI Web Site Web Site 参考文献9件
  • 海野 昌喜
    茨城大学 大学院理工学研究科 茨城大学 フロンティア応用原子科学研究センター
  • 日下 勝弘
    茨城大学 フロンティア応用原子科学研究センター
  • 玉田 太郎
    量子科学技術研究開発機構 量子ビーム科学研究部門
  • 杉島 正一
    久留米大学 医学部
  • 和田 啓
    宮崎大学 テニュアトラック推進機構
  • 萩原 義徳
    久留米工業高等専門学校 生物応用化学科
  • 福山 恵一
    大阪大学 大学院工学研究科

書誌事項

タイトル別名
  • Findings in the Neutron Crystal Structure Analysis of a Bilin Reductase PcyA Complexed with its Substrate Biliverdin
  • サイエンス記事 ビリン還元酵素PcyAと基質ビリベルジン複合体の中性子結晶構造解析で見えてきたもの
  • サイエンス キジ ビリン カンゲン コウソ PcyA ト キシツ ビリベルジン フクゴウタイ ノ チュウセイシ ケッショウ コウゾウ カイセキ デ ミエテ キタ モノ

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抄録

<p>Phycocyanobilin:ferredoxin oxidoreductase (PcyA) catalyzes the conversion of biliverdin (BV) to phycocyanobilin, a light harvesting pigment. This reaction consists of two sequential steps using two electrons and two protons in each step. Knowing the protonation states of the substrate BV and its surrounding residues is important to understand this unique reaction mechanism. To visualize the hydrogens (and protons) in this unique enzyme, we conducted neutron crystallography of the PcyA-BV complex. In the enzyme, BV bound to PcyA was in equilibrium between the neutral (BV) and the protonated (BVH+) forms. Both of the structures including the hydrogen atoms could be determined. The protonation of the nearby essential residue Asp105 was complemented with the BV protonation states. His88, an essential residue, was protonated to form a hydrogen bond to a lactam oxygen of the BV A-ring. His88 is also hydrogen-bonded to His74 via a hydronium ion. In this article, we also describe the story to grow the large crystals of the PcyA-BV complex and its neutron diffraction experiment.</p>

収録刊行物

  • 波紋

    波紋 26 (3), 130-134, 2016

    日本中性子科学会

参考文献 (9)*注記

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