大腸菌HU蛋白質のDNA結合様式の研究 : スーパーHUの作製と各種HU二量体のDNA結合性
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Bibliographic Information
- Title
-
大腸菌HU蛋白質のDNA結合様式の研究 : スーパーHUの作製と各種HU二量体のDNA結合性
- Author
-
田中, 宏光
- Author(Another name)
-
タナカ, ヒロミツ
- University
-
京都薬科大学
- Types of degree
-
博士 (薬学)
- Grant ID
-
甲第16号
- Degree year
-
1993-03-20
Note and Description
博士論文
Table of Contents
- 目次 / p1 (0003.jp2)
- 序論 / p4 (0006.jp2)
- 略語表 / p7 (0009.jp2)
- 第一章 スーパーHUの構築 / p9 (0011.jp2)
- 緒言 / p9 (0011.jp2)
- 第一節 実験材料と方法 / p10 (0012.jp2)
- (1)実験に用いた菌株､プラスミド､ファージ､及び培地, / p10 (0012.jp2)
- (2)DNAの調製, / p10 (0012.jp2)
- (3)形質導入､形質転換, / p10 (0012.jp2)
- (4)酵素処理, / p10 (0012.jp2)
- (5)ダイデオキシ法による塩基配列の決定, / p11 (0013.jp2)
- (6)カセット変異法(hupAN遺伝子の作成), / p11 (0013.jp2)
- (7)スーパーHU遺伝子の構築と変異株の作成, / p12 (0014.jp2)
- (8)DNAセルロースカラムクロマトグラフィー / p12 (0014.jp2)
- 第二節 実験結果 / p13 (0015.jp2)
- 第三節 考察 / p13 (0015.jp2)
- 要約 / p14 (0016.jp2)
- 第二章 ゲルシフト分析法による各種HU蛋白質のDNA結合性の解析 / p15 (0017.jp2)
- 緒言 / p15 (0017.jp2)
- 第一節 実験材料と方法 / p15 (0017.jp2)
- (1)HUの精製, / (0017.jp2)
- (2)DNAフラグメントの調製, / p16 (0018.jp2)
- (3)ゲルシフト分析法, / p17 (0019.jp2)
- (4)ポリアクリルアミドゲルの調製, / p17 (0019.jp2)
- (5)イムノブロッティング / p18 (0020.jp2)
- 第二節 実験結果 / p18 (0020.jp2)
- (1)HUによるゲルシフト分析法, / p18 (0020.jp2)
- (2)HU-DNA複合体のストイキオメトリー, / p19 (0021.jp2)
- (3)HUヘテロ二量体､ホモ二量体の結合力の比較, / p19 (0021.jp2)
- (4)HUと結合しやすいDNA配列および構造 / p19 (0021.jp2)
- 第三節 考察 / p20 (0022.jp2)
- 要約 / p21 (0023.jp2)
- 第三章 フィルター結合法による各種HU蛋白質二量体のDNA結合力の測定 / p22 (0024.jp2)
- 緒言 / p22 (0024.jp2)
- 第一節 実験方法 / p22 (0024.jp2)
- (1)DNA断片, / p22 (0024.jp2)
- (2)フィルター結合法 / p22 (0024.jp2)
- 第二節 実験結果と考察 / p22 (0024.jp2)
- 要約 / p23 (0025.jp2)
- 第四章 HUによるDNAの負超ラセン形成 / p24 (0026.jp2)
- 緒言 / p24 (0026.jp2)
- 第一節 実験方法 / p24 (0026.jp2)
- (1)弛緩型環状プラスミドDNAの調製, / p24 (0026.jp2)
- (2)IHFの精製, / p25 (0027.jp2)
- (3)負超ラセンの形成 / p25 (0027.jp2)
- 第二節 実験結果 / p25 (0027.jp2)
- 第三節 考察 / p26 (0028.jp2)
- 要約 / p27 (0029.jp2)
- 第五章 考察及び結論 / p28 (0030.jp2)
- 図表 / p30 (0033.jp2)
- プロトコール(P) / p52 (0056.jp2)
- (1)Composition of buffer for HU purification / p52 (0056.jp2)
- (2)Cross-linking by DMS / p53 (0057.jp2)
- (3)Electroporation for E.coli system / p54 (0058.jp2)
- (4)Enzyme buffers and solutions / p55 (0059.jp2)
- (5)Filter-binding assay / p59 (0063.jp2)
- (6)Gel-shift assay / p60 (0064.jp2)
- (7)Isolation of DNA fragment from agarose gel by phenol / p61 (0065.jp2)
- (8)Isolation of DNA fragment from gel of electrophoresis / p62 (0066.jp2)
- (9)Isolation of DNA fragment from PA-gel / p63 (0067.jp2)
- (10)Medium / p64 (0068.jp2)
- (11)OPC column chromatography / p65 (0069.jp2)
- (12)Purification of HU / p66 (0070.jp2)
- (13)Purification of IHF / p67 (0071.jp2)
- (14)Rapid isolation of Plasmid (Alkaline lysis methods) / p68 (0072.jp2)
- (15)Preparation of ssDNA / p70 (0074.jp2)
- (16)Purification of plasmid DNA / p72 (0076.jp2)
- (17)Site-directed mutagenesis / p75 (0079.jp2)
- (18)Southern hybridization / p76 (0080.jp2)
- (19)Southern transfer / p77 (0081.jp2)
- (20)Supercoiling assay / p79 (0083.jp2)
- (21)Transformation / p81 (0085.jp2)
- (22)Western blotting / p82 (0086.jp2)
- 参考文献 / p84 (0088.jp2)
- 後記 / p91 (0095.jp2)