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  • ALC1/CHD1L, chromatin-remodeling enzyme, is required for efficient base excision repair

    Tsuda Masataka , Cho Kosai , Ooka Masato , Shimizu Naoto , Watanabe Reiko , Yasui Akira , Nakazawa Yuka , Ogi Tomoo , Harada Hiroshi , Agama Keli , Nakamura Jun , Asada Ryuta , Fujiike Haruna , Sakuma Tetsushi , Yamamoto Takashi , Murai Junko , Hiraoka Masahiro , Koike Kaoru , Pommier Yves , Takeda Shunichi , Hirota Kouji

    … Poly(ADP-ribose) polymerase (PARP) 1 and 2 synthesize poly(ADP-ribose) at DNA-strand cleavage sites, promoting base excision repair (BER). … Following pulse-exposure to H2O2, PARP1-/- and ALC1-/-/PARP1-/- cells showed similarly delayed kinetics in the repair of single-strand breaks, which arise as BER intermediates. …

    PLoS ONE 12(11), e0188320, 2017-11-17

    IR 

  • ALC1/CHD1L, a chromatin-remodeling enzyme, is required for efficient base excision repair

    Tsuda Masataka , Cho Kosai , Ooka Masato , Shimizu Naoto , Watanabe Reiko , Yasui Akira , Nakazawa Yuka , Ogi Tomoo , Harada Hiroshi , Agama Keli , Nakamura Jun , Asada Ryuta , Fujiike Haruna , Sakuma Tetsushi , Yamamoto Takashi , Murai Junko , Hiraoka Masahiro , Koike Kaoru , Pommier Yves , Takeda Shunichi , Hirota Kouji

    … Poly(ADP-ribose) polymerase (PARP) 1 and 2 synthesize poly(ADP-ribose) at DNA-strand cleavage sites, promoting base excision repair (BER). … Following pulse-exposure to H₂O₂, PARP1⁻/⁻ and ALC1⁻/⁻/PARP1⁻/⁻ cells showed similarly delayed kinetics in the repair of single-strand breaks, which arise as BER intermediates. …

    PloS one 12(11), 2017-11-17

    IR 

  • The role of the Mre11-Rad50-Nbs1 complex in double-strand break repair - Facts and myths

    Takeda Shunichi , Hoa Nguyen Ngoc , Sasanuma Hiroyuki

    … Homologous recombination (HR) initiates double-strand break (DSB) repair by digesting 5′-termini at DSBs, the biochemical reaction called DSB resection, during which DSBs are processed by nucleases to generate 3′ single-strand DNA. …

    Journal of Radiation Research 57(S1), i25-i32, 2016-08-16

    IR 

  • GCN5-deficiency remarkably enhances the sensitivity of B cells in response to 4-nitroquinoline 1-oxide

    Kikuchi Hidehiko , Kuribayashi Futoshi , Mimuro Hitomi , Imajoh-Ohmi Shinobu

    … Although 4NQO was initially characterized as a UV-mimetic agent, it shows more complex effects inducing production of various covalent adducts, oxidative damage and DNA single strand break in DNA. … To understand roles of histone acetyltransferase GCN5, which protects cells against UV-irradiation, on repair of 4NQO-induced DNA damage, we studied the sensitivity of chicken homozygous DT40 mutants, ∆GCN5, against 4NQO. …

    Fundamental Toxicological Sciences 3(3), 137-142, 2016

    J-STAGE  Ichushi Web 

  • Smarcal1 promotes double-strand-break repair by nonhomologous end-joining.

    Keka Islam Shamima , Mohiuddin , Maede Yuko , Rahman Md Maminur , Sakuma Tetsushi , Honma Masamitsu , Yamamoto Takashi , Takeda Shunichi , Sasanuma Hiroyuki

    シムケ免疫不全・骨形成不全症の原因遺伝子SMARCAL1は、DNA二重鎖切断損傷からゲノムを守る. 京都大学プレスリリース. 2015-06-23.

    Nucleic acids research, 2015-06-18

    IR 

  • The distinctive cellular responses to DNA strand breaks caused by a DNA topoisomerase I poison in conjunction with DNA replication and RNA transcription

    Sakasai Ryo , Iwabuchi Kuniyoshi

    … Camptothecin (CPT) inhibits DNA topoisomerase I (Top1) through a non-catalytic mechanism that stabilizes the Top1-DNA cleavage complex (Top1cc) and blocks the DNA re-ligation step, resulting in the accumulation in the genome of DNA single-strand breaks (SSBs), which are converted to secondary strand breaks when they collide with the DNA replication and RNA transcription machinery. …

    Genes & Genetic Systems 90(4), 187-194, 2015

    J-STAGE  Ichushi Web 

  • Analysis for Clinical Features and Molecular Mechanism of Early onset Ataxia with Ocular Motor Apraxia and Hypoalbuminemia  [in Japanese]

    横関 明男

    脊髄小脳変性症は, 小脳の神経細胞の変性, 脱落による運動失調を呈する神経変性疾患の一群であり, 弧発性, 遺伝性のものに分類できる. 劣性遺伝性の脊髄小脳変性症では, 欧米ではフリードライヒ失調症が最も頻度が高いが, 本邦ではフリードライヒ失調症は存在せず, フリードライヒ失調症と類似の運動症状を示し, 眼球運動失行と低アルブミン血症を伴う早発型失調症(EAOH)が最も頻度が高い. EAOHは, …

    新潟医学会雑誌 128(1), 1-6, 2014-01

    IR  Ichushi Web 

  • Characterization of chromosomal damage accumulated in freeze-dried mouse spermatozoa preserved under ambient and heat stress conditions

    KUSAKABE H , 立野 裕幸

    … Chromosome break of the chromosome-type aberrations was the most common type of structural chromosome aberrations observed in all freeze-dried samples. … The frequency of chromatid-type aberrations (break and exchange) gradually increased in freeze-dried spermatozoa preserved at 25℃ for up to 2 months. … However, no DNA damage was detected using the same sperm samples by neutral comet assay, which can detect mostly DNA double-strand breaks in cellular DNA. …

    Mutagenesis 26(3), 447-453, 2011-05

    IR  Cited by (1)

  • The role of PolI in processing clustered DNA damage  [in Japanese]

    SHIKAZONO Naoya , NOGUCHI Miho , URUSHIBARA Ayumi , YOKOYA Akinari

    クラスターDNA損傷は、電離放射線によってDNAへリックス二回転中に二つ以上の損傷が生じるものである。クラスターDNA損傷がどの程度、また、どのように生物影響を及ぼすのかに関しては不明な点が多い。本研究では、鎖切断と脱塩基部位や8-oxo-7,8-dihydroguanine (8-oxoG)を含むクラスターDNA損傷を用い、大腸菌に形質転換し、形質転換効率及び突然変異頻度を調べた。鎖切断が脱塩基 …

    The Japan Radiation Research Society Annual Meeting Abstracts 2011(0), 212-212, 2011

    J-STAGE 

  • Dependence of the yields of AP sites and AP clusters produced in pUC18 plasmid DNA on scavenging capacity and radiation quality and LET  [in Japanese]

    SHIINA TAKUYA , SUGAYA YUKI , SHIRAISHI IYO , WATANABE RITSUKO , YOKOYA AKINARI , TSURUOKA CHIZURU , SUZUKI MASAO

    本研究では電離放射線によって生じるDNA損傷のうちAPサイト(脱塩基部位)に着目し、難修復性のクラスターDNA損傷を構成する要素としてのAPサイトの収率の放射線の線質および依存性を明らかにすることを目的としている。Sutherland等(2002)は、X線が照射されたヒト細胞中に生じるAPサイトを含むクラスターDNA損傷(数ヘリカルターン以内に2個以上の損傷が生じる複雑な損傷形態)が、ピリミジン塩 …

    The Japan Radiation Research Society Annual Meeting Abstracts 2011(0), 191-191, 2011

    J-STAGE 

  • Neurodegenerative diseases caused by defects in DNA single-strand break repair  [in Japanese]

    他田 正義 , 辻 省次 , 西澤 正豊 [他]

    Cell technology 29(1), 60-66, 2010

  • Gamma-ray irradiation to dilute aqueous solution of plasmid DNA: Chemical repair of radiation-induced lesions on DNA by antioxidant edaravone  [in Japanese]

    HATA Kuniki , URUSHIBARA Ayumi , YAMASHITA Shinichi , SHIKAZONO Naoya , YOKOYA Akinari , KATSUMURA Yosuke

    一般的に、抗酸化物質に期待される照射直後の防護メカニズムはラジカルを除去する化学的プロセスであり、これまでにOHラジカルの捕捉やdGMPラジカルに対する還元作用(化学回復)が報告されている(O'Neill, 1983)。生体内でも、抗酸化物質により、同様な化学的プロセスが起こるものと予測される。エダラボンは脳梗塞時に発生する活性酸素による障害を抑制する薬剤である。同様に活性酸素が生じるX線照射環境 …

    The Japan Radiation Research Society Annual Meeting Abstracts 2010(0), 296-296, 2010

    J-STAGE 

  • Dependence of the yields of AP sites and AP clusters produced in pUC18 plasmid DNA on scavenging capacity and radiation quality  [in Japanese]

    SHIINA Takuya , SUGAYA Yuki , SHIRAISHI Iyo , WATANABE Ritsuko , YOKOYA Akinari , TURUOKA Chizuru , SUZUKI Masao

    AP site及びこれを含むクラスターDNA損傷収率の放射線の線質及びスキャベンジャー能に対する依存性椎名卓也1,2)、菅谷雄基1,2)、白石伊世1,2)、渡辺立子3)、横谷明徳1,2,3)、鶴岡千鶴4)、鈴木雅雄4)1)茨城大学 理学部2)日本原子力研究開発機構 先端基礎研究センター3)日本原子力研究開発機構 放射線影響解析グループ4)放射線医学総合研究所 粒子線生物研究グループ本研究では電離放 …

    The Japan Radiation Research Society Annual Meeting Abstracts 2010(0), 201-201, 2010

    J-STAGE 

  • Molecular mechanism for spinocerebellar ataxias  [in Japanese]

    ONODERA Osamu

    神経細胞の機能を維持するために,神経細胞の内部環境を維持する品質管理機構が重要である.とくに蛋白質と核酸の品質管理機構と神経変性疾患との関係が注目されている.代表的な優性遺伝性脊髄小脳変性症であるポリグルタミン病では,蛋白質の品質管理機構の異常が推察されている.一方,劣性遺伝性脊髄小脳変性症では核酸品質管理機構の異常が推察されている.神経細胞のDNAは活性酸素などにより常に障害をうけ損傷している. …

    Rinsho Shinkeigaku 49(11), 750-752, 2009-11-01

    J-STAGE  Ichushi Web  References (9)

  • Localization of X-ray cross complementing gene 1 protein in the nuclear matrix is controlled by casein kinase II-dependent phosphorylation in response to oxidative damage.

    Kubota Yoshiko , Takanami Takako , Higashitani Atsushi , Horiuchi Saburo

    DNA repair = DNA repair 8(8), 953-960, 2009-08-06

    IR 

  • The Yield, Processing, and Biological Consequences of Clustered DNA Damage Induced by Ionizing Radiation

    SHIKAZONO Naoya , NOGUCHI Miho , FUJII Kentaro , URUSHIBARA Ayumi , YOKOYA Akinari

    … The DNA lesions include single strand breaks (SSB), base lesions, sugar damage, and apurinic/apyrimidinic sites (AP sites). … Clustered DNA damage, which is defined as two or more of such lesions within one to two helical turns of DNA induced by a single radiation track, is considered to be a unique feature of ionizing radiation. …

    Journal of Radiation Research 50(1), 27-36, 2009-01-16

    J-STAGE  NDL Digital Collections  Ichushi Web  References (85) Cited by (1)

  • DNA repair diseases for UV-induced DNA damage and their molecular pathogenesis

    IKEHATA Hironobu , HIDEMA Jun

    紫外線主要DNA損傷(ピリミジン二量体)の修復機構であるヌクレオチド除去修復を欠損する遺伝病は、色素性乾皮症、コケイン症候群および硫黄欠乏性毛髪発育異常症など合併症も含めて8種類が存在し、紫外線感受性の亢進以外に様々な臨床症状を呈する。また、紫外線損傷の一つであるDNA1本鎖切断の修復を欠損する遺伝病として、アプラタキシン遺伝子に変異をもつ小脳失調症(EAOH/AOA1)が知られる。さらに、AAA …

    The Japan Radiation Research Society Annual Meeting Abstracts 2009(0), 68-68, 2009

    J-STAGE 

  • DNA single strand break repair protein aprataxin is associated with neurological diseases:—autosomal dominant and recessive ataxia and triple A syndrome—

    HIRANO Makito , MORI Toshio , IKEDA Masanori , ASAI Hirohide , KIRIYAMA Takao , FURIYA Yoshiko , UENO Satoshi

    アプラタキシンは本邦で最も多い常染色体劣性小脳失調症の原因遺伝子として同定され、本邦においてFriedreich失調症とされてきた大部分が、このアプラタキシン関連小脳失調症であることが判明した。私たちは、アプラタキシンが酵素活性を有し、病的変異蛋白が活性を失うこと、さらにDNA単鎖切断修復にin vivoで関与することを、アプラタキシンのノックダウン細胞、患者線維芽細胞、さらに患者小脳組織を用いて …

    The Japan Radiation Research Society Annual Meeting Abstracts 2009(0), 69-69, 2009

    J-STAGE  Ichushi Web 

  • Molecular mechanism for spinocerebellar ataxias  [in Japanese]

    Onodera Osamu

    神経細胞の機能を維持するために,神経細胞の内部環境を維持する品質管理機構の重要性が明らかとなってきている.とくに蛋白質と核酸の品質管理機構と神経変性疾患との関係が注目されている.優性遺伝性脊髄小脳変性症の代表的な疾患であるポリグルタミン病では,蛋白質の品質管理機構の異常が推察されている.本症では,増大したポリグルタミン鎖が原因となるが,増大ポリグルタミン鎖の細胞傷害性を持つ構造体は明らかではなかっ …

    Rinsho Shinkeigaku 49(1), 1-8, 2009

    J-STAGE 

  • The Cerebella and Peripheral Nerves Symptoms of Patients with Ataxia-Oculomotor Apraxia Type 1 (Aprataxin Gene Frameshift 689 insT Mutation)  [in Japanese]

    HORIMOTO Yoshitaka , KIKUCHI Shin , OSUDA Yusuke , TACHI Nobutada , KOZUKA Naoki

    【目的】常染色体劣性遺伝性脊髄小脳変性症のひとつである眼球運動失行を伴う失調症(Ataxia-oculomotor apraxia;AOA1)はaprataxin遺伝子の変異により起こる疾患である。AOA1患者の理学療法を行う上で,小脳症状の重症度は進行初期に決定されるが,末梢神経障害は進行とともに経年的に悪化することを考慮すると,末梢神経障害の変性状態の臨床症状を知ることは重要である。【方法】慢 …

    Physical Therapy Japan 36(6), 317-323, 2009

    J-STAGE  Ichushi Web  References (25)

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