レトロトランスポゾンを利用したサツマイモ加工品の原料品種判定

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タイトル別名
  • Cultivar Identification Technique Applied for Hoshi-imo, Steamed and Dried Sweetpotato Slices, Based on Retrotransposon Insertion Polymorphisms
  • レトロトランスポゾン オ リヨウ シタ サツマイモ カコウヒン ノ ゲンリョウ ヒンシュ ハンテイ

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抄録

蒸切干し用に開発されるサツマイモ新品種の不正使用や海外流出に対抗する手段を確立するため，加工品である蒸切干し製品から，その原料となった品種を，DNAの多型を基に高精度に判定する技術を開発することとした．転移因子であるレトロトランスポゾンは，植物のゲノムに多数の複製配列が散在している．サツマイモのレトロトランスポゾン Rtsp-1のゲノム挿入部位を，葉から抽出したDNAを用い，蒸切干し用新品種候補を含む12品種についてS-SAP（Sequence-Specific Amplification Polymorphism）法により分析した結果，多数の複製配列の挿入と挿入部位の品種間の多型が検出された．品種間で違いが見られた Rtsp-1挿入部位の塩基配列を調べ，挿入を受けた宿主側の配列とRtsp-1の末端反復配列間のPCRによって，それぞれの品種について様々な挿入部位における挿入の有無を調べた．その結果，最少5カ所の挿入部位のPCRにより，上記12品種の区別が可能であった．蒸切干しイモのDNAは，イオン交換樹脂カラムを用いて抽出することができたが，加工による断片化が進んでいた．断片化した蒸切干しイモのDNAを鋳型にしたPCRにおいても，明瞭な結果が得られ，原料品種の識別が可能であった．染色体の特定部位におけるレトロトランスポゾン挿入の品種間多型をPCRにより判定し品種識別を行う方法は，DNAが断片化した加工品の分析に適する，再現性が高く操作が容易，マーカー数の確保が容易などの利点があり，高次倍数性の作物や加工品などにおける優れた品種識別マーカーとなる．<br>

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