プロテオーム解析における液体クロマトグラフィー３段階質量分析法（ＬＣ／ＭＳ｀３´）　の有用性について

• 藤井 清永

  北海道大学大学院薬学研究院

• 中野 智世

  エーエムアール株式会社

• 碓井 史彦

  エーエムアール株式会社

• 板東 泰彦

  エーエムアール株式会社

• 稲垣 冬彦

  北海道大学大学院薬学研究院

• 西村 俊秀

  東京医科大学外科第一講座

書誌事項

タイトル別名

• Utility of Application of Liquid Chromatography/Triple Stage Mass Spectrometry (LC/MS3) for Proteome Analysis
• プロテオーム解析における液体クロマトグラフィー3段階質量分析法(LC/MS[3]) の有用性について
• プロテオーム カイセキ ニ オケル エキタイ クロマトグラフィー 3 ダンカイ シツリョウ ブンセキホウ LC MS3 ノ ユウヨウセイ ニ ツイテ

抄録

Protein identification via mass spectrometry (MS) relies primarily on protein sequence databases. Identification resulting from a sequence database search in the tandem mass spectrometry (MS/MS) experiments for the digested peptides is derived from an algorithm based on statistical confidence, and therefore, it often pro- ides false-positive identifications. Although one can apply high-resolution MS such as Fourier-transform mass spectrometer (FT-MS) to obtain results with high confidence, the instrumentation is expensive and the results are still probability based. Therefore, we introduced data-dependent triple stage mass spectrometry (MS³) into our well-established liquid chromatography/tandem mass spectrometry (LC/MS/MS) analysis of linear ion trap MS to achieve evidence-based protein identification. Peptide sequencing by MS³ analysis can provide a direct evidence for a sequence elucidated by MS/MS data and help determine whether the search results are correct.

収録刊行物

• 質量分析

  質量分析 57 (4), 317-325, 2009

  一般社団法人 日本質量分析学会

キーワード

• MS³
• Ion trap MS
• Protein identification
• Proteome analysis

詳細情報

• CRID: 1390001206495166848
• NII論文ID: 10025571784
• NII書誌ID: AN0010555X
• DOI: 10.5702/massspec.57.317
• ISSN: 18804225
• ISSN: 18843271
• ISSN: 13408097
• NDL書誌ID: 10324162
• Web Site: https://ndlsearch.ndl.go.jp/books/R000000004-I10324162
• Web Site: http://www.jstage.jst.go.jp/article/massspec/57/4/57_4_317/_pdf
• 本文言語コード: ja
• データソース種別:
  • JaLC
  • NDL
  • Crossref
  • CiNii Articles
• 抄録ライセンスフラグ: 使用不可