データベースを用いた脳・神経細胞データの管理と活用 Management and application of brain and neuronal data by database system

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抄録

 比較生理学生化学分野でも実験からデータ解析,論文執筆に至る研究活動を進めていく上でコンピュータおよびインターネットは必要不可欠なツールとなっている。論文をはじめとする様々な研究情報や日々の実験により得られるデータの管理,共有,活用を促進していくにはデータベースの利用が有効であり,研究室あるいは研究グループのレベルからインターネットによる研究情報の共有を目指すものまで数多くのシステムが開発,運用されている。我々は,神経細胞形態及び電気生理実験データに関するデータベース:BoND(<I>Bombyx</I> Neuron Database)を活用しカイコガにおけるフェロモン受容と行動制御に関する神経回路解析について研究を進めている。本稿では,比較生理学分野におけるデータベースの構築手法とそれらの活用方法の一例として神経細胞形態の標準脳へのレジストレーション技術を紹介する。

In this article, we introduce to construct and use a database system in the laboratory for research resource management and application. The combination of XAMPP package and XOOPS Cube is providing a web based data management environment easily. As an example of usage of database contents, it was shown that a method for register of neuron morphologies on the standard brain coordinate is documented. It was conducted by using free software, ITK-SNAP and Fiji, so this protocol would be applied for the integration of morphological data obtained by individuals.

収録刊行物

  • 比較生理生化学

    比較生理生化学 28(4), 326-333, 2011-12-20

    日本比較生理生化学会

参考文献:  13件中 1-13件 を表示

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各種コード

  • NII論文ID(NAID)
    10030754432
  • NII書誌ID(NCID)
    AN10391932
  • 本文言語コード
    JPN
  • 資料種別
    NOT
  • ISSN
    09163786
  • NDL 記事登録ID
    023456471
  • NDL 請求記号
    Z18-1651
  • データ提供元
    CJP書誌  CJP引用  NDL  J-STAGE 
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