遺伝子調節系モデルにおける決定論的手法と確率論的手法の比較  [in Japanese] Deterministic versus Stochastic Models for Gene Regulation  [in Japanese]

Author(s)

Abstract

ゲノムの機能を探るために,コンピュータ上(in silico)での遺伝情報から細胞のダイナミックな振る舞いを予測する細胞内分子シミュレーションが有効な手段となりうる.本研究では,ファージにおける遺伝子発現の制御機構のモデルをもとに遺伝子調節タンパク質の濃度の時間変化をシミュレーションした.分子シミュレーションの方法は決定論的な手法と確率論的な手法に大別される.それぞれの手法の結果を比較し,シミュレーション結果に差異が出る場合があることが分かった.そして,どのような場合に差異が出るのかを数学的に解析した.

In order to elucidate the mechanism of the genetic system, it is an effective approach to simulate the dynamics of cellular molecules. We first simulated the gene regulation in bacteriophage using the stochastic method and deterministic method to calculate concentration of repressers , and found out these results did not correspond in certain case. Finally, we analyzed system mathematically so as to know when computation results are different with these method.

Journal

  • IEICE technical report. ME and bio cybernetics

    IEICE technical report. ME and bio cybernetics 104(54), 33-36, 2004-05-12

    The Institute of Electronics, Information and Communication Engineers

References:  5

Codes

  • NII Article ID (NAID)
    110003286700
  • NII NACSIS-CAT ID (NCID)
    AN1001320X
  • Text Lang
    JPN
  • Article Type
    ART
  • ISSN
    09135685
  • NDL Article ID
    6996313
  • NDL Source Classification
    ZN33(科学技術--電気工学・電気機械工業--電子工学・電気通信)
  • NDL Call No.
    Z16-940
  • Data Source
    CJP  NDL  NII-ELS 
Page Top