実験室内分子進化過程の熱力学的および情報論的解釈

• 相田 拓洋

  産業技術総合研究所 生命情報科学研究センター （現在）埼玉県中小企業振興公社，埼玉バイオグループ（JST）

• 伏見 譲

  埼玉大学工学部機能材料工学科

書誌事項

タイトル別名

• An Interpretation of Evolutionary Dynamics in in vitro Molecular Evolution from Thermodynamical and Informational View Point
• ジッケン シツナイ ブンシ シンカ カテイ ノ ネツリキガクテキ オヨビ ジョウホウロンテキ カイシャク

抄録

In vitro protein evolution is comprehended as a hill-climbing process on a fitness landscape in sequence space, just like the protein folding is comprehended as a valley-descending process on an energy landscape in comformation space. In this review, based on a mathematical model for in vitro molecular evolution, we demonstrated an analogy between evolutionary dynamics and thermodynamics and then many concepts in evolutionary dynamics became comprehensible. By introducing thermodynamics-like concepts such as “free fitness”, it is interpreted that evolution is driven in the direction in which free fitness increases. In this process, the evolving population climbs the fitness landscape by absorbing “fitness information” as the negative entropy from the surroundings as an experimental set-up.<br>

収録刊行物

• 生物物理

  生物物理 46 (3), 137-143, 2006

  一般社団法人 日本生物物理学会

キーワード

• <i>in vitro</i> evolution
• fitness landscape
• information
• thermodynamics
• sequence space

詳細情報

• CRID: 1390001206536030464
• NII論文ID: 120006385826
• NII論文ID: 110004750167
• NII書誌ID: AN00129693
• DOI: 10.2142/biophys.46.137
• ISSN: 13474219
• ISSN: 05824052
• NDL書誌ID: 7976473
• Web Site: http://id.nii.ac.jp/1586/00013334/
• Web Site: https://ndlsearch.ndl.go.jp/books/R000000004-I7976473
• Web Site: http://www.jstage.jst.go.jp/article/biophys/46/3/46_3_137/_pdf
• 本文言語コード: ja
• データソース種別:
  • JaLC
  • IRDB
  • NDL
  • Crossref
  • CiNii Articles
  • KAKEN
• 抄録ライセンスフラグ: 使用不可