FTAカードを用いたフィールドでの植物DNA採集法  [in Japanese] Collection of plant DNA in the field by using FTA Cards  [in Japanese]

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Author(s)

    • 塚谷 裕一 Tsukaya Hirokazu
    • 自然科学研究機構・岡崎統合バイオサイエンスセンター 基礎生物学研究所:総合研究大学院大学先導科学研究科 生命科学研究科:京都大学大学院理学研究科 National Institute for Basic Science Okazaki Institute for Integrative Bioscience:The Graduate University for Advanced Studies:Graduate School of Science, Kyoto University
    • 池田 博 Ikeda Hiroshi
    • 岡山理科大学総合情報学部生物地球システム学科 Department of Biosphere-Geosphere System Science, Faculty of Informatics, Okayama University of Science

Abstract

植物分類学における分子系統学的解析が疑いなく重要となっている現在,すべての分類群を対象とした網羅的なDNAの収集がなされれば,系統分類学者にとって非常に有用なものになると考えられる.従来,遠隔地での植物DNAサンプルの採集法は,生の組織をシリカゲルで乾燥して持ち帰るというものであった.しかし,そのためには十分な量のシリカゲルを用意せねばならず,大量のサンプルを処理することは困難であった.最近,私たちはフィールド調査で植物のDNAを収集する際に, Whatman社製のFTA[○!R]カードを採用している. FTAカードにより収集されたDNAはPCR解析に向いており, DNA収集が容易で,しかもコンパクトであるという利点がある.ヒマラヤ植物研究会ではFTAカードを用いた植物DNAの収集を進めており,将来的にはこのDNAリソースを世界の研究者に提供することを目指している.具体的事例として,ロシアで行った収集について紹介する.

Since molecular phylogenetic analyses are undoubtedly important in studies of plant taxonomy, if separate DNA collections are made they can be quite useful and informative. However, many plant species have not yet been subjected to molecular phylogenic analysis, since, at least in part, they grow in remote areas that are difficult to access, such as the alpine region of the Himalayas. The most common way to collect DNA samples of plants during a botanical expedition to such areas is to dry fresh samples using silica gel. This method is simple and easy, and has been used for many researchers. However, adopting this method, we should carry vast amount of silica gel for unexpected amount of plants to be collected. Recently, we adopted FTA[○!R] Cards (Whatman Inc.) for collecting DNA in the field for subsequent PCR analysis, due to its easiness and compactness of the materials required for collection of DNA. The Society of Himalayan Botany, Tokyo has formerly adopted this system for general collection of plant DNA in the botanical expeditions from 2003, aiming of a goal to supply DNA resources of Himalayan plants to the world researchers. Usage of this system in the field of Russia in 2004 is introduced as an example.

Journal

  • BUNRUI

    BUNRUI 5(2), 127-135, 2005

    Japanese Society for Plant Systematics

Cited by:  1

Codes

  • NII Article ID (NAID)
    110006345212
  • NII NACSIS-CAT ID (NCID)
    AA11585830
  • Text Lang
    JPN
  • Article Type
    Journal Article
  • ISSN
    1346-6852
  • NDL Article ID
    7480961
  • NDL Source Classification
    ZR3(科学技術--生物学--植物)
  • NDL Call No.
    Z74-C609
  • Data Source
    CJPref  NDL  NII-ELS  J-STAGE 
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