有用細菌(乳酸菌等)の全ゲノム塩基配列決定,比較ゲノム解析および有用遺伝子の機能解明 : 第5報

• 森田, 英利

• 大島, 健志朗

• 藤, 英博

• 政岡, 俊夫

• 茅根, 士郎

• 和田, 恭則

• 有嶋, 和義

• 木内, 明男

• 坂田, 亮一

• 紫野, 正雄

• 内藤, 博之

• 斉藤, 康秀

• 西田, 利穂

• 印牧, 信行

• 滝沢, 達也

• 加藤, 行男

• 村上, 賢

• 福山, 正文

• 岸川, 正剛

• 久松, 伸

• 吉村, 哲彦

• 柴, 忠義

• 服部, 正平

• Morita, Hidetoshi

• Oshima, Kenshiro

• Toh, Hidehiro

• Masaoka, Toshio

• Chinone, Shiro

• Wada, Yasunori

• Arishima, Kazuyoshi

• Kiuchi, Akio

• Sakata, Ryoichi

• Shino, Masao

• Naito, Hiroyuki

• Saito, Yasuhide

• Nishita, Toshiho

• Kanemaki, Nobuyuki

• Takizawa, Tatsuya

• Kato, Yukio

• Murakami, Masaru

• Fukuyama, Masafumi

• Kishikawa, Seigo

• Hisamatsu, Shin

• Yoshimura, Tetsuhiko

• Shiba, Tadayoshi

• Hattori, Masahira

書誌事項

タイトル別名

• Complete genomic, comparative genomic and post-genomic analysis of lactic acid bacteria : No. 5
• ガクジュツ フロンティア ユウヨウ サイキン ニュウサンキン トウ ノ ゼンゲノム エンキ ハイレツ ケッテイ ヒカク ゲノム カイセキ オヨビ ユウヨウ イデンシ ノ キノウ カイメイ ダイ5ホウ

抄録

Bifidobacterium属は,高いプロバイオティクス効果および細菌の分類学のモデルケースとして興味深い状況にある。(独)理化学研究所バイオリソースセンター微生物材料開発室(JCM)に保存されているBifidobacterium属およびその近縁種で,ヒトを分解源とする基準株を検索したところ,9菌種(菌株)が候補としてあげられ,その全ゲノム解析を開始した。その菌種は,Table 1に示したとおりであるが,B. bifidum, B. breveおよびB. catenulatumの3菌種は全ゲノム配列を決定し,B. dentium, P. denticolens, S. inopinataおよびG. vaginalisの3菌種は,コンティグが15前後になっており,B. longumおよびb. scarcoviiについては,ショットガンライブラリの作製を完了した。各菌株について引き続きシークエンス作業を進め,全ゲノム解析後は,大規模なBifidobacterium属の比較ゲノム解析を行う予定である。

It is interested in Genus Bifidobacterium shows the probiotic effects and as the model case of taxonomy. The nine species of Bifidobacterium and the closest related species of the type strains isolated from human origin were obtained from the Microbe Division, Japan Collection of Microorganisms (JCM), RIKEN BioResource Center. We have started sequencing of the complete genome of nine species. We have done the complete genome sequencing of B. bifidum, B. breve and B. catenulatum. The contigs of Parascardovia denticolens, Scardovia inopinata and Gardnerella vaginalis is less than fifteen. The draft sequences of B. dentium genomes have been obtained, and the shotgun library of the B. scardovii and B. longum genomes were prepared. We are going to widely comparative genomics in the Family Bifidobacteriaceae, when all the genomes will be finished.

P(論文)

特集

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FEATURE ARTICLES

収録刊行物

• 麻布大学雑誌

  麻布大学雑誌 15/16 305-308, 2008-03-31

  麻布大学

詳細情報

• CRID: 1050282813006889472
• NII論文ID: 110006977970
• NII論文ID: 120006334470
• NII書誌ID: AA11561563
• ISSN: 13465880
• NDL書誌ID: 9600374
• Web Site: https://az.repo.nii.ac.jp/records/5075
• Web Site: https://ndlsearch.ndl.go.jp/books/R000000004-I9600374
• Web Site: https://search.jamas.or.jp/link/ui/2008333632
• 本文言語コード: ja
• 資料種別: departmental bulletin paper
• データソース種別:
  • IRDB
  • NDL
  • CiNii Articles