造形樹及びその苗木から検出されたオオハリセンチュウのPCR診断用プライマーの作出

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  • Development of primers for PCR diagnosis of <i>Xiphinema</i> species associated with Japanese traditional ornamental trees
  • Development of primers for PCR diagnosis of Xiphinema species associated with Japanese traditional ornamental trees

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抄録

<p>造形樹及びその苗木の主要な生産県（千葉、埼玉、福岡）における現地調査の結果、9樹種の根圏土壌からオオハリセンチュウが検出された。これらのPCR診断のために、既知の塩基配列情報から6種オオハリセンチュウに対する種特異的PCRプライマー対を作出した。各プライマー対の種特異性は、標的または近縁のオオハリセンチュウ種のみがPCR増幅することで確認された。種特異的PCR及び28SリボソームRNA遺伝子D2–D3領域配列のBLAST検索の結果から、現地調査で検出されたオオハリセンチュウは、コーヒーオオハリセンチュウ、ヤマユリオオハリセンチュウ、Xiphinema parachambersiまたはX. hunanienseと推定された。これら4種及び現地調査では検出されなかった2種 (Xiphinema sp.、キイチゴオオハリセンチュウ) を網羅的に検出可能なマルチプレックスPCR 用プライマーセットを作出した。</p>

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