二本鎖RNA結合タンパク質が結合するマイクロRNA初期転写産物の構造的特徴の解析

DOI Web Site 参考文献8件
  • 樋口 琢磨
    高知大学総合研究センター実験実習機器施設・RI実験施設・分子生物学教室
  • Kiernan Rosemary
    Institute of Human Genetics, University of Montpellier
  • 坂本 修士
    高知大学総合研究センター実験実習機器施設・RI実験施設・分子生物学教室

書誌事項

タイトル別名
  • Characteristic analysis of a secondary structure of primary microRNA bound to a double-strand RNA-binding protein, NF90

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抄録

<p>二本鎖RNA結合タンパク質であるNuclear Factor 90（NF90）は結合パートナーであるNF45と複合体を形成し，機能性小分子RNAであるマイクロRNA（miRNA）の初期転写産物（pri-miRNA）に結合することで当該miRNAの生合成を抑制する．一方，NF90が結合するpri-miRNAの構造的特徴は不明であった．我々は，ENCODEに登録されたeCLIP-seqの結果からNF90が結合しプロセッシングを抑制する候補pri-miRNAを探索し，当該pri-miRNAに「自由エネルギーが低くミスマッチの少ない安定なステム構造を有する」という特徴を見出した．この結果をもとにRNA-EMSAを実施し，pri-miRNAのステム構造にミスマッチ変異を導入することで，NF90の結合性が低下することを実証した．本研究から，NF90が結合するpri-miRNAの構造的特徴が明らかとなった．</p>

収録刊行物

  • 電気泳動

    電気泳動 65 (1), 13-16, 2021

    日本電気泳動学会

参考文献 (8)*注記

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