細胞分化クロストークのモデル化と細胞分化クロストーク遺伝子の推定手法

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  • サイボウ ブンカ クロストーク ノ モデルカ ト サイボウ ブンカ クロストーク イデンシ ノ スイテイ シュホウ
  • A Crosstalk Model and an Estimation Method to Find Crosstalk Genes on Cell Differentiation

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本研究では細胞分化クロストークの数理モデル化を提案する.細胞分化は ES 細胞や iPS 細胞を代表に近年注目を浴びている研究対象である.細胞分化における重要な遺伝子制御ネットワークとして細胞分化クロストークがある.しかし細胞分化クロストークに対して生物学的実験による研究は行われているが,情報科学的アプローチによる推定手法は確立していない.そこで我々は細胞分化クロストークの数理モデル化を提案した.提案手法をマウスの細胞分化の過程を観測した遺伝子発現量データに対して適用し,有効性を検証した.

We propose a mathmatical model of crosstalks on cell differentiation. Cell differentiation is the process that a stem cell (such as an ES or iPS cell) changes to a specific type of cell, and attracts lots of attention from researchers of medicine and biology. Crosstalks on cell differentiation are a gene regulatory network that plays a role to determine the specialized cell type. To analyze the crosstalk, biological approaches have been adopted but information science approaches have not been established. In this study, we demonstrated the effectiveness of our model by applying it to a differentiation process to bone cell.

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