海棲哺乳類ジュゴンの環境DNA を定量するためのプライマーセットの開発

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タイトル別名
  • A primer set for quantification of environmental DNA of a marine mammal, Dugong dugon
  • カイセイホニュウルイ ジュゴン ノ カンキョウ DNA オ テイリョウ スル タメ ノ プライマーセット ノ カイハツ

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抄録

<p>沖縄周辺での地域絶滅が危惧される中型海棲哺乳類ジュゴン（Dugong dugon）の環境 DNA分析による分布調査を可能にすべく、ジュゴン由来の DNAを特異的に検出する PCRプライマーセットの開発を試みた。データベース上の DNA配列情報をもとにジュゴンに特異的な配列にプライマーセットを設計し（チトクロム b領域、増幅産物長： 138 bp）、プライマーセットの有効性と特異性を鳥羽水族館の展示水槽で飼育されているジュゴンの組織片（毛根）、糞、飼育水、および近縁種アフリカマナティーの飼育水を用いて確認した。SYBR-Green法を用いた定量 PCRの結果、ジュゴン飼育個体の毛根、糞、飼育水から抽出した DNAは、設計したプライマーセットによって増幅が確認された。ジュゴンの人工合成 DNAは、ウェルあたり 1コピーの条件でも検出可能であった。一方、アフリカマナティーの飼育水から抽出した DNAおよびアフリカマナティーの人工合成 DNAは、増幅が見られなかった。すなわち、このプライマーセットを用いたジュゴンの DNA検出系が、ジュゴンの糞や生息場所の水に対して有効である一方、近縁種が共存していることで生じうる偽陽性は否定できた。これらの結果より、試料保存や多地点同時調査が容易な環境 DNA分析を従来の目視調査と効果的に組み合わせて、ジュゴンの生活範囲をより詳細に確認することが望まれる。</p>

収録刊行物

  • 保全生態学研究

    保全生態学研究 25 (1), n/a-, 2020-02-13

    一般社団法人 日本生態学会

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