タバコモザイクウイルスの増殖に関与するシロイヌナズナTOMI遺伝子のクローニングならびにTMV-Cg株の全塩基配列の決定
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Bibliographic Information
- Title
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タバコモザイクウイルスの増殖に関与するシロイヌナズナTOMI遺伝子のクローニングならびにTMV-Cg株の全塩基配列の決定
- Author
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山中拓哉
- Author(Another name)
-
ヤマナカ, タクヤ
- University
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北海道大学
- Types of degree
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博士(農学)
- Grant ID
-
甲第4819号
- Degree year
-
1999-03-25
Note and Description
博士論文
Table of Contents
- 目次 (3コマ目)
- 要約/p1 (5コマ目)
- 第1章 緒論/p2 (6コマ目)
- 第一部 シロイヌナズナナTOM1遺伝子のクローニング/p8 (12コマ目)
- 第2章 実験材料および方法/p8 (12コマ目)
- 2-1 使用したウイルス/p8 (12コマ目)
- 2-2 使用した植物/p8 (12コマ目)
- 2-3 使用した菌株/p8 (12コマ目)
- 2-4 シロイヌナズナの播種及び生育条件/p8 (12コマ目)
- 2-5 バクテリアのエレクトロポレーション法による形質転換/p9 (13コマ目)
- 2-6 シロイヌナズナのゲノムDNAの抽出/p10 (14コマ目)
- 2-7 酵母DNAの抽出/p12 (16コマ目)
- 2-8 プラスミドDNAの調製/p12 (16コマ目)
- 2-9 サザンブロッティング/p14 (18コマ目)
- 2-10 シロイヌナズナ全RNAの抽出/p15 (19コマ目)
- 2-11 ノザンブロッティング/p15 (19コマ目)
- 2-12 cDNAライブラリーのスクリーニング/p16 (20コマ目)
- 2-13 各種PCRによるDNA断片の増幅/p16 (20コマ目)
- 2-14 シロイヌナズナ植物体へのウイルス接種/p18 (22コマ目)
- 2-15 SDS-ポリアクリルアミド電気泳動/p18 (22コマ目)
- 2-16 ウエスタンブロッティング/p19 (23コマ目)
- 2-17 減圧浸潤法による植物の形質転換/p19 (23コマ目)
- 2-18 シロイヌナズナカルス培養細胞に対するエレクトロポレーション法によるプラスミドDNAの導人と細胞内局在性の観察/p21 (25コマ目)
- 2-19 蛍光サイクルシークエンシングによる塩基配列の決定/p23 (27コマ目)
- 第3章 実験結果/p24 (28コマ目)
- 3-1 TOM1遺伝子座のマッピング/p24 (28コマ目)
- 3-2 TOM1遺伝子座近傍領域の各種DNAクローンによるコンティグの作製/p33 (37コマ目)
- 3-3 T-DNAによるtoml-1変異の相補/p37 (41コマ目)
- 3-4 TOM1遺伝子領域のcDNAクローンの分離とその解析/p40 (44コマ目)
- 3-5 TOM1転写産物の解析/p48 (52コマ目)
- 3-6 TOM1遺伝子産物の推定アミノ配列に基づいた解析/p50 (54コマ目)
- 3-7 TOM1タンパク質の機能解析/p55 (59コマ目)
- 3-8 シロイヌナズナにおけるTOM1ホモログの解析/p59 (63コマ目)
- 第4章 考察/p61 (65コマ目)
- 4-1 TOM1遺伝子のポジショナルクローニング/p61 (65コマ目)
- 4-2 tom1変異の同定/p65 (69コマ目)
- 4-3 TOM1 ORFの予測とウエスタン解析/p66 (70コマ目)
- 4-4 TOM1タンパク質の構造予測/p67 (71コマ目)
- 4-5 TOM1-GFP融合タンパク質を用いた細胞内局在性の解析/p68 (72コマ目)
- 4-6 シロイヌナズナにおけるTOM1ホモログ-TOM3/p70 (74コマ目)
- 4-7 TOM1の機能は何であろうか?/p70 (74コマ目)
- 第二部 TMV-Cg株の全塩基配列の決定/p75 (79コマ目)
- 第5章 実験材料および方法/p75 (79コマ目)
- 5-1 使用したウイルス/p75 (79コマ目)
- 5-2 ウイルスRNAの抽出/p75 (79コマ目)
- 5-3 ラジオアイソトープを用いたDNAシークエンシング/p75 (79コマ目)
- 5-4 逆転写酵素を用いたダイデオキシ法によるRNAシークエンシンブ/p76 (80コマ目)
- 5-5 配列特異的伸長停止法/p76 (80コマ目)
- 5-6 脱キャップ反応/p77 (81コマ目)
- 第6章 実験結果/p78 (82コマ目)
- 6-1 TMV-CgのcDNAクローニングならびにシークエンシング/p78 (82コマ目)
- 6-2 TMV-Cgの塩基配列の不確定部分の決定/p80 (84コマ目)
- 6-3 5'付近230塩基の領域に対応するcDNAのDNAシークエンスの確認/p81 (85コマ目)
- 6-4 配列未決定部分のRNAシークエンシング/p81 (85コマ目)
- 6-5 配列特異的停止法を用いた5'末端付近の塩基配列の決定/p82 (86コマ目)
- 6-6 脱キャップ反応によるTMV-Cg RNA5'末端部分の確認/p83 (87コマ目)
- 6-7 TMV-CgのORFの推定/p85 (89コマ目)
- 第7章 考察/p86 (90コマ目)
- 7-1 TMV-Cgゲノムの遺伝子構造/p86 (90コマ目)
- 7-2 アブラナ科系統のトバモウイルス間でのアミノ酸配列の比較/p86 (90コマ目)
- 謝辞/p94 (98コマ目)
- 参考文献/p95 (99コマ目)