北上 始 KITAKAMI Hajime

Articles:  1-20 of 78

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  • Method for High-Precision Motif Extraction based on Gibbs Sampler in Amino Acid Sequences  [in Japanese]

    高橋 誉文 , 北上 始 , 福本 翔平 , 森 康真 , 田村 慶一

    電子情報通信学会技術研究報告 = IEICE technical report : 信学技報 116(121), 75-84, 2016-07-04

  • Method for High-Precision Motif Extraction based on Gibbs Sampler in Amino Acid Sequences  [in Japanese]

    高橋 誉文 , 北上 始 , 福本 翔平 , 森 康真 , 田村 慶一

    電子情報通信学会技術研究報告 = IEICE technical report : 信学技報 116(120), 75-84, 2016-07-04

  • 密度に基づく適応的な時空間クラスタリング手法を用いたトピックの時空間分析手法  [in Japanese]

    酒井 達弘 , 田村 慶一 , 北上 始

    本研究では,気象や災害などの緊急性の高いトピックが話題として取り上げられている地域をTwitter上に投稿されているジオタグ付きツイートからリアルタイムに抽出し分析するための新しい時空間分析手法を提案する.提案手法では,最初に,分類器を用いてトピックに関連するジオタグ付きツイートを抽出する.次に,(ε,τ)-密度に基づく適応的な時空間クラスタリング手法を用い,時空間的な投稿数の差を考慮してトピック …

    第77回全国大会講演論文集 2015(1), 649-650, 2015-03-17

    IPSJ 

  • ネットワークデータベースにおける同型部分グラフの問合せ方式  [in Japanese]

    嘉本 貴彰 , 北上 始 , 森 康真

    ネットワークデータに対する同型部分グラフの問合せ処理にはUllmannの同型性判定アルゴリズムが利用可能である.しかし,このアルゴリズムは問合せ処理において探索不要な部分を探索し,多くの時間を要するという問題がある.本論文では,この問題点を解決するため,高速な問合せ処理方式を提案する.問合せグラフの中心とネットワークデータの頂点を次数により対応付け,参照範囲を問合せグラフと同じ半径の範囲に限定する …

    第77回全国大会講演論文集 2015(1), 579-580, 2015-03-17

    IPSJ 

  • 地域的なトピック抽出のための密度に基づく適応的な空間クラスタリング手法  [in Japanese]

    酒井 達弘 , 田村 慶一 , 北上 始 , 伊東 晴奈

    ソーシャルメディアサイト上に投稿されている位置情報付き文書データは,地域的なトピックと関連しており,それらを抽出することは重要な研究課題の一つである.本研究では,新しい地域的なトピック抽出手法として,位置情報付き文書データから (ε,σ)-密度に基づく適応的な空間クラスタリング手法を用いて地域的なトピックが話題となっている地域を空間クラスタとして抽出し,さらに,空間クラスタから代表文書データを空間 …

    IPSJ SIG Notes 2014-MPS-101(3), 1-6, 2014-12-02

  • D-009 Statistical method for extracting motifs based on multiple alignments  [in Japanese]

    Fukumoto Shouhei , Kitakami Hajime , Mori Yasuma

    情報科学技術フォーラム講演論文集 13(2), 91-94, 2014-08-19

    IPSJ 

  • Performance Evaluation of Parallel Processing for Geometric Suffix Tree  [in Japanese]

    Takahashi Yoshifumi , Tamura Keiichi , Kuroki Susumu , Kitakami Hajime

    ディスク上に蓄積された幾何学的サフィックス木は,蛋白質立体構造データベースに対する高速な類似検索のための索引構造として利用可能である.しかしながら,蛋白質立体構造データベースの大規模化により,その索引構造の構築に多くの時間を費やすだけではなく,索引構造を用いた類似検索に要する時間にも影響を与える.本論文では,並列化による高速処理を実現するために,幾何学的サフィックス木の構築および幾何学的サフィック …

    電子情報通信学会技術研究報告 = IEICE technical report : 信学技報 114(105), 123-130, 2014-06-25

  • Performance Evaluation of Parallel Processing for Geometric Suffix Tree  [in Japanese]

    Takahashi Yoshifumi , Tamura Keiichi , Kuroki Susumu , Kitakami Hajime

    ディスク上に蓄積された幾何学的サフィックス木は,蛋白質立体構造データベースに対する高速な類似検索のための索引構造として利用可能である.しかしながら,蛋白質立体構造データベースの大規模化により,その索引構造の構築に多くの時間を費やすだけではなく,索引構造を用いた類似検索に要する時間にも影響を与える.本論文では,並列化による高速処理を実現するために,幾何学的サフィックス木の構築および幾何学的サフィック …

    IEICE technical report. Neurocomputing 114(104), 123-130, 2014-06-25

  • Performance Evaluation of Parallel Processing for Geometric Suffix Tree  [in Japanese]

    Yoshifumi Takahashi , Keiichi Tamura , Susumu Kuroki , Hajime Kitakami

    ディスク上に蓄積された幾何学的サフィックス木は,蛋白質立体構造データベースに対する高速な類似検索のための索引構造として利用可能である.しかしながら,蛋白質立体構造データベースの大規模化により,その索引構造の構築に多くの時間を費やすだけではなく,索引構造を用いた類似検索に要する時間にも影響を与える.本論文では,並列化による高速処理を実現するために,幾何学的サフィックス木の構築および幾何学的サフィック …

    IPSJ SIG Notes 2014-MPS-98(21), 1-8, 2014-06-18

  • Performance Evaluation of Parallel Processing for Geometric Suffix Tree  [in Japanese]

    Yoshifumi Takahashi , Keiichi Tamura , Susumu Kuroki , Hajime Kitakami

    ディスク上に蓄積された幾何学的サフィックス木は,蛋白質立体構造データベースに対する高速な類似検索のための索引構造として利用可能である.しかしながら,蛋白質立体構造データベースの大規模化により,その索引構造の構築に多くの時間を費やすだけではなく,索引構造を用いた類似検索に要する時間にも影響を与える.本論文では,並列化による高速処理を実現するために,幾何学的サフィックス木の構築および幾何学的サフィック …

    IPSJ SIG technical reports 2014-BIO-38(21), 1-8, 2014-06-18

  • Location-based Burst Detection Considering Spatiotemporal Densities  [in Japanese]

    事崎 翔太 , 田村 慶一 , 北上 始

    IEEE SMC Hiroshima Chapter Young Researchers' Workshop proceedings = IEEE SMC Hiroshima Chapter若手研究会講演論文集, 77-80, 2014

    IR 

  • Parallel Processing for Density-based Clustering Algorithm on a Muti-core CPU  [in Japanese]

    三崎 浩平 , 田村 慶一 , 北上 始

    IEEE SMC Hiroshima Chapter Young Researchers' Workshop proceedings = IEEE SMC Hiroshima Chapter若手研究会講演論文集, 33-36, 2014

    IR 

  • High-speed Similar Structure Search Method Using Geometrical Suffix Trees  [in Japanese]

    高橋 誉文 , 田村 慶一 , 黒木 進 , 北上 始

    本論文では,大規模の蛋白質立体構造データベースに対する高速な類似構造検索を実現するために,従来の幾何学的サフィックス木の問題点を解決する方式を提案する.具体的には,提案手法は,大容量の幾何学的サフィックス木のノードが格納されたデータページのやりとりをするバッファ管理法,類似構造検索の高速化ための隠れ配列法より構成されている.データページのやりとりをするバッファ管理法については,木の上位レベルのノー …

    情報処理学会論文誌データベース(TOD) 6(5), 62-70, 2013-12-27

    IPSJ 

  • Heuristic Using Modified EO for CMO Problem  [in Japanese]

    中田 章宏 , 田村 慶一 , 北上 始 , 高橋 誉文

    蛋白質の類似構造を抽出する手法として蛋白質立体構造アラインメントがある.蛋白質立体構造アラインメントは構造的な類似性を使い,比較する蛋白質どうしの残基間の対応関係を求める.蛋白質立体構造アラインメントを組合せ最適化問題として定式化したのがCMO(Contact Map Overlap)問題である.CMO問題はコンタクトマップと呼ばれるグラフについて,頂点間のアラインメントにより保存される共通コンタ …

    情報処理学会論文誌数理モデル化と応用(TOM) 6(3), 87-99, 2013-12-27

    IPSJ 

  • Summarizing the Results of a Keyword Search on Tweets with Web-Images  [in Japanese]

    田村 真吾 , 田村 慶一 , 北上 始

    IEEE SMC Hiroshima Chapter Young Researchers' Workshop proceedings = IEEE SMC Hiroshima Chapter若手研究会講演論文集, 91-94, 2013

    IR 

  • Density-based Clustering Considering Document Similarity for Extracting Local Topics  [in Japanese]

    酒井 達弘 , 田村 慶一 , 北上 始

    IEEE SMC Hiroshima Chapter Young Researchers' Workshop proceedings = IEEE SMC Hiroshima Chapter若手研究会講演論文集, 17-20, 2013

    IR 

  • Parallel Processing of Distance-based Outlier Detection on Multi-core CPU  [in Japanese]

    奥 淳基 , 田村 慶一 , 北上 始

    IEEE SMC Hiroshima Chapter Young Researchers' Workshop proceedings = IEEE SMC Hiroshima Chapter若手研究会講演論文集, 13-16, 2013

    IR 

  • Protein Structure Alignment using MEO and Its Performance Evaluation  [in Japanese]

    中田 章宏 , 田村 慶一 , 北上 始

    IEEE SMC Hiroshima Chapter Young Researchers' Workshop proceedings = IEEE SMC Hiroshima Chapter若手研究会講演論文集, 73-76, 2013

    IR 

  • A Study on Location-based Burst Detection Considering Membership  [in Japanese]

    事崎 翔太 , 田村 慶一 , 北上 始

    IEEE SMC Hiroshima Chapter Young Researchers' Workshop proceedings = IEEE SMC Hiroshima Chapter若手研究会講演論文集, 29-32, 2013

    IR 

  • Burst Detection Method for Document Stream on Multi-core CPU  [in Japanese]

    平原 海詞 , 田村 慶一 , 北上 始 [他] , 田村 真吾

    Online documents on the social media sites are represented as a document stream, because the documents have a temporal order. This has resulted in numerous studies on extracting a frequent phenomenon …

    IEEE SMC Hiroshima Chapter Young Researchers' Workshop proceedings = IEEE SMC Hiroshima Chapter若手研究会講演論文集, 59-62, 2012

    IR 

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