検索結果 19 件

Bae Young Choi, Hanul Kim, Donghwan Shim, Sunghoon Jang, Yasuyo Yamaoka, Seungjun Shin, Takashi Yamano, Masataka Kajikawa, EonSeon Jin, Hideya Fukuzawa, Youngsook Lee The Plant Cell 34 (2), 910-926, 2021-12-10

...BLZ8 directly regulated the expression of the three target genes and required bZIP2 as a dimerization partner in activating CAH8 and HLA3....

DOI PDF PDF 被引用文献1件 参考文献74件

Sheng Chang, Dai Fengzhi 人工生命とロボットに関する国際会議予稿集 26 596-599, 2021-01-21

...For example, in bzip2, BWT is used to preprocess the original data, then the same characters in the original data are close to each other, which improves the compression rate....

DOI

Kirill Kryukov, Mahoko Takahashi Ueda, So Nakagawa, Tadashi Imanishi Bioinformatics 35 (19), 3826-3828, 2019-02-25

...We compared our format with DNA compressors: DELIMINATE and MFCompress, and with general purpose compressors: gzip, bzip2, xz, brotli and zstd....

DOI PDF 被引用文献3件 参考文献6件

Takahiro, Okumura, Yoshihiro, Oyama 情報処理学会論文誌 58 (2), 2017-02-15

...We measured the compression ratio of three grammar compression methods (SEQUITUR, Re-Pair, and Byte Pair Encoding (BPE)) and three well-known compressors (gzip, bzip2, and xz)....

情報処理学会

大山 恵弘, Okumura Takahiro, Oyama Yoshihiro Journal of information processing (25) 229-233, 2017-02

...We measured the compression ratio of three grammar compression methods (SEQUITUR, Re-Pair, and Byte Pair Encoding (BPE)) and three well-known compressors (gzip, bzip2, and xz)....

機関リポジトリ 機関リポジトリ

Okumura Takahiro, Oyama Yoshihiro Journal of Information Processing 25 (0), 229-233, 2017

...We measured the compression ratio of three grammar compression methods (SEQUITUR, Re-Pair, and Byte Pair Encoding (BPE)) and three well-known compressors (gzip, bzip2, and xz)....

DOI 機関リポジトリ HANDLE ほか1件 参考文献10件

横田 圭祐, 梅津 信幸, 乾 正知 精密工学会学術講演会講演論文集 2016A (0), 445-446, 2016

機械部品の製造において、加工前のコンピュータシミュレーションが問題点の確認のために一般的に行われ、高解像度のモデルを正確に記録するために膨大なデータ量を必要とする。この解決のために、2Dウェーブレットを用いて形状データの圧縮と同時に誤差を限定するアルゴリズムを提案する。解像度512×512の形状データに対し指定誤差10μm以下かつ、平均0.025秒で平均90.4%を削減した。

DOI

Marius Nicolae, Sudipta Pathak, Sanguthevar Rajasekaran Bioinformatics 31 (20), 3276-3281, 2015-06-20

...We have compared our algorithm with other state of the art big data compression algorithms namely gzip, bzip2, fastqz (Bonfield and Mahoney, 2013), fqzcomp (Bonfield and Mahoney, 2013), Quip (Jones et ...

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Bin Zhou, Hai Jin, Ran Zheng International Journal of Distributed Sensor Networks 11 (6), 795353-, 2015-06-01

...Compared with LZSS and BZIP2 on the traditional serial CPU platforms, the compression speed of PMLZSS increases about 16 times while, for BZIP2, the compression speed increases about 12 times when the...

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高橋, 圭一, 戒田, 高康 ソフトウェアエンジニアリングシンポジウム2014論文集 2014 188-189, 2014-08-25

...．実験結果より，bzip2 の圧縮率と T-複雑度および T-情報量には負の相関があり，bzip2 と T-平均情報量の相関係数は 0.64 と近い傾向があることがわかった．...

情報処理学会

細川拓也, ThomasZeugmann 第76回全国大会講演論文集 2014 (1), 407-408, 2014-03-11

...正規情報距離の計算はgzipやbzip2などの汎用の圧縮ソフトウェアを用いて近似する手法が一般的である。一方、今回のようなケースではツイートを単語ごとに分割することで、各ユーザに対して単語の集合を要素とする組合せ集合を定義することができる。...

情報処理学会

Jagna Chmielowska-Bąk, Isabelle Lefèvre, Stanley Lutts, Agata Kulik, Joanna Deckert Acta Societatis Botanicorum Poloniae 83 (3), 201-207, 2014

...The affected genes encode mitogen-activated protein kinase kinase2 (MAPKK2), nitrate reductase and DOF1 and bZIP2 transcription factors....

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Faraz Hach, Ibrahim Numanagić, Can Alkan, S Cenk Sahinalp Bioinformatics 28 (23), 3051-3057, 2012-10-09

...</jats:p> <jats:p>Availability: Our algorithm, SCALCE (Sequence Compression Algorithm using Locally Consistent Encoding), is implemented in C++ with both gzip and bzip2 compression options...

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Monzoorul Haque Mohammed, Anirban Dutta, Tungadri Bose, Sudha Chadaram, Sharmila S. Mande Bioinformatics 28 (19), 2527-2529, 2012-07-25

...Validation results indicate relatively higher compression efficiency of DELIMINATE when compared with popular general purpose compression algorithms, namely, gzip, bzip2 and lzma....

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Anthony J. Cox, Markus J. Bauer, Tobias Jakobi, Giovanna Rosone Bioinformatics 28 (11), 1415-1419, 2012-05-03

...</jats:p> <jats:p>This is &gt;4 times smaller than the size achieved by a standard BWT-based compressor (bzip2) on the untrimmed reads, but an important further advantage of our approach...

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Kenny Daily, Paul Rigor, Scott Christley, Xiaohui Xie, Pierre Baldi BMC Bioinformatics 11 (1), 514-, 2010-10-14

...Our algorithms fair well against general purpose compression programs such as gzip, bzip2 and 7zip; timing results show that our algorithms are consistently faster than the best general purpose compression...

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石原, 正道, 佐藤, 静香 情報処理学会論文誌 49 (12), 4016-4024, 2008-12-15

本研究では和文小説の著者別分類において正規圧縮距離（NCD）を用いた距離行列法が有効であるか調べた．距離行列のみでは文章間の関係が確定しないため，非加重平均結合法（UPGMA法）・近隣結合法（NJ法）・古典的多次元尺度構成法（MDS法）により文章間の関係を推定することを試みた．これらの方法が有用であるか判断するために，ある和文から順次改編を行い作成した文章群に対しNCDを適用して距離行列を作成し…

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Sean Rul, Hans Vandierendonck, Koen De Bosschere ACM SIGARCH Computer Architecture News 35 (1), 55-62, 2007-03

...</jats:p> <jats:p>We apply our framework on the SPECcpu2000 bzip2 benchmark, achieving a speedup of 3.74 of the compression part and a global speedup of 2.45 on a quad processor system....

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T S Juan, D R Wilson, M D Wilde, G J Darlington Proceedings of the National Academy of Sciences 90 (7), 2584-2588, 1993-04

...A sequence comparison reveals two CCAAT/enhancer binding protein (C/EBP) consensus sequences, basic DNA binding region and leucine zippers 1 and 2 (bZIP1 and bZIP2), within this region....

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