検索結果 249 件

藤野 健, 山口 勝司, 横山 稔之, 濵中 俊哉, 原薗 陛正, 鎌田 寛彬, 小林 航, 伊原 徳子, 内山 憲太郎, 松本 麻子, 伊津野 彩子, 津村 義彦, 豊田 敦, 重信 秀治, 森口 喜成, 上野 真義, 笠原 雅弘 日本森林学会大会発表データベース 134 (0), 371-, 2023-05-30

...Don) はゲノムサイズが約 11 Gbp と巨大であり、ゲノム中に占める反復配列の割合も多いことから長らくゲノム配列の決定が困難であった。我々は 3 度の自殖を経たスギの 1 個体（国東3 S3-3）から抽出した長鎖 DNA をもとに PacBio HiFi ライブラリを作成し <i>de novo</i> アセンブリすることで合計 9.1 Gbp から成る 2,651 個のコンティグを得た。...

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瀬戸 順次, 和田 崇之, 村瀬 良朗, 三瓶 美香, 下村 佳子, 細谷 真紀子, 水田 克巳, 御手洗 聡, 阿彦 忠之 感染症学雑誌 97 (1), 6-17, 2023-01-20

...</p><p>方法：2009～2020年の山形県における反復配列多型（VNTR）分析に基づいた網羅的な結核分子疫学調査結果により見出されたクラスターのうち，2020年の結核患者8人を含む8クラスター（19人）を対象に結核菌ゲノム比較を実施し，保健所の実地疫学調査結果と併せて評価した．...

DOI Web Site 医中誌 参考文献24件

末永 光 化学と生物 61 (1), 12-14, 2023-01-01

DOI Web Site 参考文献5件

木戸口 正典 日本耳鼻咽喉科頭頸部外科学会会報 125 (11), 1538-1541, 2022-11-20

...鼻茸を伴う慢性副鼻腔炎や好酸球性副鼻腔炎において, 鼻腔における一酸化窒素の主な合成酵素である誘導型 NOS(inducible Nitric Oxide Synthase, iNOS: 遺伝子名 <i>NOS2</i>) に注目し分析したところ, <i>NOS2</i> プロモーター領域における反復配列の反復回数が少ないほど鼻茸を伴う慢性副鼻腔炎や好酸球性副鼻腔炎の術後再発を来しやすいことを確認した...

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鈴木 春音, James R.P. Worth, 戸丸 信弘 日本森林学会大会発表データベース 133 (0), 381-, 2022-05-30

<p>異なる2種間における葉緑体DNAハプロタイプの共有は、祖先多型による不完全な系統仕分け、あるいは過去または現在の種間交雑という2つの仮説によって説明されてきた。垂直的にはブナより低い標高にイヌブナが分布するが、境界付近では同所的に分布する。茶臼山自然園アテビ平小鳥の森（長野県下伊那郡売木村）にはブナとイヌブナが同所的に分布し、葉緑体DNAハプロタイプを共有していることがわかっている。本研究…

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植田, 早紀, 水谷, 亮介, 多田, 寿和子, 久保, 有司, 山下, 泰生, 田中, 利幸, 窪田, 健康, 森末, 文徳, 村上, 恭子 香川県農業試験場研究報告 (73) 1-13, 2022-03

...香川県育成品種「香オリ3号」「香オリ5号」，既存62品種および香川県育成124系統の計188品種・系統は，6種類のSSR(単純反復配列：Simple Sequence Repeat)マーカーにより124種類の多型に分類された。3....

日本農学文献記事索引 Web Site

西山, 学即 福島県立医科大学総合科学教育研究センター紀要 10 1-9, 2021-12-15

type:Text

機関リポジトリ

伊藤 新太, 藤原 歩, 安川 洋生 日本科学教育学会研究会研究報告 35 (2), 39-42, 2020-12-12

...ネグレリアフォーレリ；ヒトの脳に侵入することがある病原性アメーバ）のmtDNA（ミトコンドリアDNA；本生物種の場合，約50000塩基の環状DNA）の塩基配列のうち3件について，汎用のワープロソフトとネット上のフリーソフトで解析した．その結果，これらのmtDNAのAT含量は74.8%であり，相互によく似ていることが分かった．また，約400塩基のほぼ同じ配列が2回反復している領域が在ることが分かった．同様の反復配列...

DOI 機関リポジトリ

竹下 美保, 浦川 優作, 菅原 宏美, 二川 摩周, 兼田 宗英, 冨田 尚裕, 田村 和朗 松江市立病院医学雑誌 24 (1), 18-25, 2020

...近年，大腸がんにおけるミスマッチ修復遺伝子異常に起因するマイクロサテライト不安定性（MSI）の発がん経路が注目されている．わが国のMSI検査は主に1塩基から2塩基の反復マーカーが使用されいるが，複製エラーは1塩基から2塩基反復配列のみならず数塩基の反復配列で生じていることもあり，数塩基配列を検索する新しいバイオマーカーとしてEMASTが注目されるようになってきた．本研究は，大腸がんにおけるEMAST...

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角谷 徹仁 日本毒性学会学術年会 47.1 (0), S7-4-, 2020

...<p>植物や脊椎動物のゲノム中には、トランスポゾンなどの反復配列が多く分布し、これらは、さまざまな経路で宿主の表現型に影響する。トランスポゾンの転移は潜在的に有害であるため、その大部分はDNAメチル化などのエピジェネティックな機構で抑制されている。一方、この抑制に対抗してトランスポゾンが増殖する機構については、ほとんどわかっていない。...

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竹下　 美保, 田村 和朗 松江市立病院医学雑誌 24 (1), 1-5, 2020

...のみならず1塩基から数塩基で生じることがある．そのため4塩基反復配列の複製エラーを検索するElevated Microsatellite Alterations at Selected Tetranucleotide repeats（EMAST）が新しいバイオマーカーとして注目されている．本稿では，大腸がんにおけるMMR遺伝子とMSIについてEMASTを中心に解説する．...

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川本 芳, 直井 洋司, 萩原 光, 白鳥 大佑, 池田 文隆, 相澤 敬吾, 白井 啓, 岡野 美佐夫, 近藤 竜明, 田中 洋之 霊長類研究　Supplement 36 (0), 27-27, 2020

...今回は、この領域の3’端部分で新たに発見した２塩基（CA）配列をモチーフにする反復配列の多型について報告する。この多型は九州, 四国, 中国地方のサルでは反復が０回もしくは１回と少ないが, 屋久島では例外的に４回になっていた。一方、紀伊半島を含む近畿以東のサルでは０回から最大６回までの著しい多型を示し、その分布には地域性が認められた。...

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松田 慶士, 千葉 宣孝, 杉田 篤紀, 馬渡 貴之, 水落 美紀, 野村 悠里, 渡邉 和宏, 齋藤 豪, 櫻井 淳, 木下 浩作 日本救急医学会関東地方会雑誌 40 (3), 229-233, 2019-12-31

...遺伝学的検査で, ミオトニンプロテインキナーゼ (DMPK) 遺伝子のCTG反復配列を約600リピート認めたため, 筋強直性ジストロフィー1型と確定診断した。筋強直性ジストロフィーは多彩な症状を示し, 場合によっては意識消失し死に至ることもある疾患である。意識消失発作は, 救急診療で多く遭遇するが, 本症例のような比較的稀な疾患が隠れている場合があることも念頭に置くべきと考える。</p>...

DOI 医中誌

橘 裕司, 馮 萌, 柳 哲雄, Putaporntip Chaturong, Pattanawong Urassaya, 程 訓佳, Jongwutiwes Somchai 霊長類研究　Supplement 35 (0), 65-65, 2019-07-01

...18S rRNA遺伝子には株間で差がなかったが，tRNA関連反復配列の６座位を解析したところ，24株は14のDNA型に分けられた。系統樹解析の結果は地理的分布の違いをよく反映しており，株間の遺伝的距離と地理的距離には有意な相関が認められた。腸管寄生アメーバのDNA多型解析から，宿主の移動や拡散についても推定できると考えられる。</p>...

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中村 慎崇, 下野 義人, 岩瀬 剛二, 大藪 崇司, 北出 雄生, 木下 晃彦, 小長谷 啓介, 山中 高史 日本森林学会大会発表データベース 130 (0), 462-, 2019-05-27

<p><i>Tuber</i>属菌は経済的に重要な子実体（トリュフ）を形成する外生菌根菌だが、日本に生育する本属菌の生態的な知見は未だ乏しい。本研究では日本産黒トリュフの一種であるアジアクロセイヨウショウロ（<i>T. himalayense</i>）の子実体を5年5ヶ月にわたり採集し、これらの標本に基づいて本菌の時間的・空間的な遺伝的動態を調査した。京都府内の発生地に4.0×8.0 …

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藤野 健, 山口 勝司, 鈴木 創, 魏 甫錦, 内山 憲太郎, 小澤 太郎, 尾納 隆大, 伊藤 勇太, 重信 秀治, 笠原 雅弘 日本森林学会大会発表データベース 130 (0), 718-, 2019-05-27

...反復配列の問題を解決し、より長いゲノム配列を得るためのいくつかの戦略をシークエンシング技術およびソフトウェアの面から紹介し、スギゲノム配列の決定のための道筋を示したい。</p>...

DOI

霊長類研究所年報 49 126-133, 2019

2018-C-1 サルの脅威刺激検出に関する研究

HANDLE

寺本 英敏 日本シルク学会誌 27 (0), 133-137, 2019

<p>　　Incorporation of an unnatural amino acid bearing an azido group, 4-azido-L-phenylalanine, into the non-repetitive regions of silk fibroin has enabled its facile modification using azido groups …

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前田 伸司, 藤原 永年, 山本 三郎, 瀧井 猛将 感染症学雑誌 92 (5), 705-709, 2018-09-20

DOI Web Site Web Site ほか1件 参考文献8件

大沢, 勇統, 東, 銀史, 高橋, 篤, 大星, 直樹 第80回全国大会講演論文集 2018 (1), 937-938, 2018-03-13

...しかし, 参照配列との僅かな違いや, ゲノム中の反復配列などの存在によって生じるマッピング結果のエラーは, 一塩基多型の誤検出の原因となる可能性が懸念される. 本研究では, BWA, Bowtie2を使用した一塩基多型解析において誤検出が疑われるもののうち, 遺伝子型のエラーが生じている一塩基多型に着目し, これらのエラーに対する解析精度向上のための指針を検討する....

情報処理学会

菊地 利明 感染と抗菌薬 21 (1), 42-45, 2018-03-10

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小林 久人, AMOUR Julie Brind’, ALBERT Julien Richard, 白根 健次郎, 坂下 陽彦, 神尾 明日香, KARIMI Mohammad M, LEFEBVRE Louis, 河野 友宏, LORINCZ Matthew C 日本繁殖生物学会　講演要旨集 111 (0), OR1-26-OR1-26, 2018

...特に齧歯類特異的反復配列MT（Mouse Transcript）キメラ型転写物はマウス，ラットのCpGアイランドメチル化確立に強く貢献していることが示唆された。また，雌核発生胚のDNAメチローム解析により，LTRキメラ型転写物に誘導された卵子由来メチル化の多くは，少なくとも胚盤胞期胚まで維持されることが示された。...

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中村 篤祥 人工知能学会研究会資料 人工知能基本問題研究会 103 (0), 09-, 2017-03-08

DOI Web Site

加藤 信, 佐山 貴司, 髙田 吉丈, 湯本 節三, 石本 政男, 島村 聡, 平田 香里, 菊池 彰夫 農研機構研究報告 東北農業研究センター = Bulletin of the NARO, Agricultural Research for Tohoku Region 119 89-106, 2017-03

...本研究では抵抗性遺伝子近傍から複数の単純反復配列（SSR）マーカーセットを選定し、DNAシーケンサーのフラグメント解析により複数マーカーを同時に解析することでマーカー選抜を効率化し、戻し交配により「リュウホウ」及び「おおすず」を反復親として、各々、SCN及びSMV抵抗性を導入した系統「東北173号」、SMV及びSbDV抵抗性を導入した系統「東北174号」等を開発した。...

DOI 機関リポジトリ

橘 裕司, GUAN Yue, FENG Meng, CAI Junlong, MIN Xiangyang, ZHOU Xingyu, XU Qing, TAN Ning, CHENG Xunjia 霊長類研究　Supplement 33 (0), 41-41, 2017

...更にtRNA関連の反復配列について6つの座位で解析したところ，5つの座位では6株間で完全に一致したが，座位A-LではEM4, EM38, EM50に複数の配列が検出され，多型性が認められた。一方，中国のアカゲザル由来株との比較では，6座位すべてで違いが認められ，これらの多型は地理的分布の違いを反映していた。今後，宿主の移動や拡散，進化と寄生アメーバの多型化との関係を明らかにしたい。</p>...

DOI

岡山 孔平, 田村 美帆, 渡辺 敦史 日本森林学会大会発表データベース 128 (0), 364-, 2017

...一般に葉緑体ゲノムは環状構造であり、大きく分けて2つの逆位反復配列(IR)領域・LSC(large single copy)領域・SSC(small single copy)領域の４区画から構成されている。針葉樹の葉緑体ゲノムではIR構造の一部が大きく欠損しているため、ゲノム構造に劇的な変化が生じている。...

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古賀 章彦, 平井 啓久 霊長類研究　Supplement 33 (0), 42-42, 2017

...Aotidaeが他の科と分岐した後に，セントロメア反復配列の変異型が生じ，これが増幅。本来のセントロメア反復配列は機能を喪失。） [6] オマキザル属のCapA配列（約1500塩基対。Cebus属がSaimirti属などと分岐した後に出現して増幅。染色体の腕の中間部に大きなブロックを形成。）</p>...

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升屋 勇人, 真鍋 理一郎, 大熊 盛也, 遠藤 力也 日本森林学会大会発表データベース 128 (0), 670-, 2017

...ゲノム中2.5%が反復配列であった。また、DrugBank databaseに基づき1686個のドラッグターゲットとなる遺伝子を特定した。本成果は基礎知見の拡充のみならず、新たな防除手法開発や、抵抗性育種などにつながると予想される。</p>...

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小林, 広記, 下田, 清子, 北野, 和子, 小林, 良清, 関口, 真紀 信州公衆衛生雑誌 11 (1), 58-59, 2016-08

...要旨：佐久保健福祉事務所（佐久保健所）では、初発患者の発生から2 年以上経過後、同一集団内で2人目の患者の発生が認められた2つの結核事例に遭遇し、各事例の患者2 人の関連性をそれぞれ推定するため、分子疫学的手法のひとつである結核菌縦列反復配列多型（VNTR）解析を実施した。...

機関リポジトリ HANDLE

平井, 啓久, 古賀, 章彦, Masumoto, Hiroshi, Koga, Akihiko Scientific Reports 6 2016-06-13

Centromere protein B, which is involved in centromere formation, binds to centromeric repetitive DNA by recognizing a nucleotide motif called the CENP-B box. Humans have large numbers of CENP-B …

HANDLE

中村 文音, 大野 善隆, 横山 真吾, 江川 達郎, 鈴木 美穂, 鬼村 知子, 伊藤 理香, 後藤 勝正 理学療法学Supplement 2015 (0), 0624-, 2016

...このMBNL1はCUG配列を認識することから，CUG反復配列を含む特定の塩基配列が増加すると，それに捕捉されて本来のスプライシング機能を果たせなくなる。DMマウスでは，筋核内へのMBNL1蓄積量が増加することにより，筋タンパク合成低下や分解促進などが惹起され，骨格筋萎縮が発症すると考えられている。しかし，加齢に伴う骨格筋萎縮におけるMBNL1の挙動に関しては不明な点が多い。...

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小林 久人, 小池 佐, 坂下 陽彦, 田中 啓介, 隈本 宗一郎, 河野 友宏 日本繁殖生物学会　講演要旨集 109 (0), P-56-P-56, 2016

...また，反復配列共通配列のデータベースが充実している生物種であれば，非モデル動物の細胞での研究にも貢献することが期待される。</p>...

DOI

小林 記緒, 岡江 寛明, 樋浦 仁, 千葉 初音, 白形 芳樹, 原 健士朗, 有馬 隆博, 種村 健太郎 日本繁殖生物学会　講演要旨集 109 (0), AW-3-AW-3, 2016

...【結果と考察】加齢に伴い，長鎖散在反復配列（LINE）のメチル化レベルは上昇したが，18wと68wのゲノム全体のメチル化レベルに大きな差はなかった。興味深いことに，8wの精子形成関連遺伝子群のプロモーター領域と母性インプリント調節領域において，18wと68wに比べて5–10%の有意に高いメチル化レベルを示した。...

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安戸, 方邦, 佐藤, 昇 新潟医学会雑誌 129 (12), 719-727, 2015-12

...ポリグルタミン(polyQ)病は, 遺伝性の神経変性疾患の一種であり, 各遺伝子中にあるグルタミンをコードするCAG反復配列の伸長によって引き起こされることが知られている. 神経毒性を引き起こす機序については不明な点も多いが, 一部にプログラムされた細胞死と同様の分子メカニズムが作用することが指摘されている....

機関リポジトリ HANDLE Web Site ほか1件

井嶋 博, 南山 泰宏, 来山 顕久 和歌山大学教育学部紀要. 自然科学 65 15-19, 2015-02-27

DOI 機関リポジトリ Web Site

壷井 和幸, 吉川 卓宏, 東 幸太, 安部 武生, 荻田 千愛, 横山 雄一, 古川 哲也, 丸岡 桃, 田村 誠朗, 齋藤 篤史, 西岡 亜紀, 関口 昌弘, 東 直人, 北野 将康, 角田 慎一郎, 松井 聖, 佐野 統 日本臨床免疫学会会誌 38 (4), 381b-381b, 2015

...PSL）30mg/dayより治療開始となり，シクロスポリン（CyA）追加となったが，症状改善は乏しく，体幹部の振るえも増悪認めたため，2014.12月に当科受診し，2015.1月に精査目的で入院となった．入院時，上肢・体幹部・頭部の安静時振戦，女性化乳房，筋原酵素の上昇があり，変性疾患も疑い，当院神経内科評価の下，SBMAが疑われた．家族歴からは，母方のおじにSBMAの既往があり，AR遺伝子CAG反復配列解析...

DOI Web Site PubMed ほか1件

古賀 章彦, 平井 啓久 霊長類研究　Supplement 31 (0), 57-57, 2015

...ただし、ヨザルのゲノムには、セントロメア反復配列であるアルファサテライトDNAも大量に存在し、こちらが凝集の主体である可能性を排除するには至っていない。とはいえ比較のために調べた昼行性のマーモセットとタマリンでは、アルファサテライトDNAは凝集していない。以上の結果を合わせて考えると、OwlRepが業種の主体である可能性は大きいといえる。...

DOI

小林 久人, 小池 佐, 坂下 陽彦, 田中 啓介, 河野 友宏 日本繁殖生物学会　講演要旨集 108 (0), OR1-26-OR1-26, 2015

...また，反復配列共通配列のデータベースが充実している生物種であれば，非モデル動物の細胞での研究にも貢献することが期待される。...

DOI

志浦 寛相, 阿部 訓也 日本毒性学会学術年会 42.1 (0), S19-6-, 2015

...<br>　現在は多コピーの反復配列に適用している段階だが、より低コピーの配列の検出も可能と考えており、究極的には発現制御領域のDNAメチル化とそれに対応する遺伝子発現、タンパク質局在を１細胞レベルで検出できる類例の無い技術へ発展可能と思われ、多細胞体中の特定細胞のエピゲノムダイナミクス解析のための重要な手法の一つになることが期待される。...

DOI

濱崎 伸彦, 上坂 将弘, 阿形 清和, 中島 欽一, 今村 拓也 日本繁殖生物学会　講演要旨集 108 (0), OR1-25-OR1-25, 2015

...これらの可変領域には反復配列であるLTRのMERVKファミリー属する配列が多く含まれていた。配偶子クロマチン環境が受精後のDNAメチル化ダイナミクスを規定する可能性を探索したところ，例えば，父方由来ゲノム中の二細胞期DNA脱メチル化高感受性領域，及び，真逆である高度メチル化維持領域は，精子において既に特徴的なクロマチン環境下にあることが明らかとなった。...

DOI

陰山 大輔 蚕糸・昆虫バイオテック = Sanshi-konchu biotec 83 (3), 243-249, 2014-12

....，2006)，ゲノムサイズは，1.08～1.7Mbpと小さく，トランスポゾンや反復配列を多く含む(Wu et al.，2004; Werren et al.，2008)。Wolbachiaが持つこのような反復配列の中には，アンキリンリピートと呼ばれるタンパク質同士の相互作用にかかわる配列が多く存在する。...

日本農学文献記事索引

奥村, 太郎, 尾崎, 司, 一瀬, 白帝 山形大学紀要. 医学 : 山形医学 = Bulletin of the Yamagata University. Medical science : Yamagata medical journal 32 (1), 17-28, 2014-02-15

論文(Article)

機関リポジトリ 医中誌

田中 朋之, 中川 真梨子, 佐野 まどか, 安井 康夫 作物研究 59 (0), 31-35, 2014

...ソバは深刻なアレルギー反応を起こす場合があり,そのアレルゲンを低減化することが強く求められている.主要アレルゲンの一つである13Sグロブリンには,0-6回反復した挿入配列を持つ様々なサブニットが存在し,反復挿入配列を持たないサブユニットのα鎖はトリプシン難消化性である.本研究では,"反復配列を持たない13Sグロブリンサブユニット(以下,0回反復サブユニット)"を低減化したソバ個体を育成するために,有効...

DOI Web Site

古賀 章彦, プラコンチープ オーン, チャイブラセルチ ナンペ, 平井 百合子, 平井 啓久 霊長類研究　Supplement 30 (0), 48-49, 2014

...そのDNA成分は、187 bpを単位とする大規模な縦列反復配列である。この反復配列は切れやすいと推測される形状をなしている。この切れやすさが染色体変異の原因である可能性を、本演題で提示する。<br>この反復配列をOwlRepとよぶ。OwlRepはつぎのような特性をもつ。(1) 染色体の端部に大量に存在し、染色体の内部には小規模にしかみられない。...

DOI

北村 裕介, 井原 敏博 分析化学 62 (9), 793-810, 2013

...遺伝情報を読み取るシステムを構築した．希土類金属イオン捕捉部位としてEDTAを，光増感部位として1,10-フェナントロリン（phen）を別々のODN末端に修飾し，標的DNA上で両構造が近接するように一対のプローブを設計した．これらプローブと標的存在下，Tb(III)やEu(III)を添加すると，両イオンに特徴的な発光が得られた．またこれらの発光は標的配列上の点変異に依存した．次に，ルテニウム錯体を用い，反復配列...

DOI 機関リポジトリ HANDLE ほか3件 参考文献72件

古賀 章彦, プラコン チオーン, シクルナト コンソン, 平井 百合子, 平井 啓久 霊長類研究　Supplement 29 (0), 98-, 2013

... アルファサテライト DNA は，霊長類のセントロメアの主要な構成成分となっている反復配列である．前演題の目的での反復配列解析から，ヨザルには２種類のアルファサテライト DNA があることが判明した．コピー数は同程度であり，２種類がヨザルのゲノムに共存していることになる．この状況に至った過程を推測した．...

DOI

新着論文レビュー 1-, 2013

DOI

瀬戸 順次, 阿彦 忠之, 和田 崇之, 長谷 篤, 山田 敬子 結核 88 (6), 535-542, 2013

<p>〔目的〕国内の結核低蔓延地域において結核菌VNTR分析を広範に実施し，低蔓延下の結核対策における同分析の有用性を明らかにする。〔方法〕2009～2011年に山形県内で新規登録された菌陽性肺結核患者266人中184人（69.2%）から分離された結核菌の24領域VNTR分析を実施した。VNTRパターンが23領域以上一致した菌株を同一クラスタと定義し，各クラスタの由来患者間の関連性の有無を実地疫…

DOI Web Site 医中誌 被引用文献1件 参考文献11件

平野 貴, 西村 翔太, 渡邊 敏夫, 高須賀 晶子, 半澤 惠, 杉本 喜憲 日本畜産学会報 84 (3), 319-325, 2013

...現実的ではない．しかし，リシーケンシングにDNAプールを用いることで，各アリルをカバーする配列データ数からマイナーアリル頻度（MAF）を予測し，その多型性の評価が可能となる．我々は，黒毛和種ゲノム解析に有効なMAFが高いSNPを大量に含むデータベースを作成するために，黒毛和種52頭の全ゲノムリシーケンシングをDNAプールによって行い，予測MAFが0.05以上のSNPsを網羅的に探索した．その結果，反復配列領域外...

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site 被引用文献1件 参考文献22件

寺田 祥子, 平井 百合子, 平井 啓久, 古賀 章彦 霊長類研究　Supplement 29 (0), 242-, 2013

... アルファサテライト DNAは，霊長類のセントロメアで主成分となる反復配列である．ヒトのアルファサテライト DNAは 2量体～ 15量体といった高次構造をとることが知られている．この高次構造はチンパンジー・ゴリラ・オランウータン等の大型類人猿にも存在する．ただし，ヒトほど複雑ではない．これらのヒト科とおよそ 1400万年前に分岐したとされるテナガザル科に関しては，探索はなされているものの高次構造が未...

DOI

石黒 聖也, 佐藤 裕, 貴島 祐治 日本草地学会誌 59 (1), 60-63, 2013

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site 参考文献6件

小柳 香奈子, 劉 瑞芳, 陳 孫禄, 水野 美登利, 貴島 祐治 日本草地学会誌 59 (1), 55-59, 2013

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site 参考文献16件

大西, 志全 北海道立総合研究機構農業試験場報告 (133) 1-40, 2012-10

...5)CHS遺伝子の逆位反復配列であるGmIRCHSを有し低温着色抵抗性が弱い「トヨムスメ」と，GmIRCHSの対立遺伝子で逆位反復構造をとらないGmASCHSを有し低温着色抵抗性が強い「トヨハルカ」との間で作成した組換え自殖系統(RILs)について，GmIRCHS座の遺伝子型と低温着色抵抗性との関連を調査した。...

日本農学文献記事索引 Web Site

中野, 美奈子, 上條, 敦子, 唐木, 里織, 橋場, 礼奈, 前角, 和勇, 牛山, 剛, 中村, 恵子, 西垣, 明子, 鳥海, 宏 信州公衆衛生雑誌 7 (1), 48-49, 2012-08

...複数系統感染の可能性もあったため、正確な疫学像を把握するため、VNTR（Valiable Numbers of Tandem Repeats：反復配列多系分析）法を用いた分子疫学調査を実施した。接触者健診の正確な評価を行う上でVNTR法が有効であった。...

機関リポジトリ HANDLE 医中誌

佐藤 しのぶ, 森 久美子, 遠藤 浩, 兒玉 正明, 土生 学, 西原 達次, 冨永 和宏, 竹中 繁織 分析化学 61 (3), 243-250, 2012

...テロメラーゼは<ruby><rb>癌</rb><rt>がん</rt></ruby>のマーカーとして期待されている．テロメラーゼ活性の測定法として現在実用化されているテロメラーゼ反復配列増幅プロトコル（TRAP）法ではポリメラーゼ連鎖反応（PCR）とゲル電気泳動が必要である．著者らはPCRを必要としない簡便な検出法として電気化学的テロメラーゼ活性測定法を考案した．テロメラーゼの基質となるTSプライマー...

DOI Web Site Web Site ほか1件 参考文献31件

古賀 章彦, 原 暢, JAHAN Israt, 平井 百合子, 平井 啓久 霊長類研究　Supplement 28 (0), 49-, 2012

...内部（VNTR; variable number of tandem repeat）は 30-50 bp の単位が縦列に連なった反復配列である。ヒトのゲノムには SVA 因子は約 2,800 コピーあり、染色体の全域に散在する。VNTR 領域の長さがコピーごとに異なり、因子の長さの平均は約 0.8 kb、最大は約 2.3 kb である。...

DOI

金田 正弘, 渡辺 伸也, 平尾 雄二, 赤木 悟史, 原口 清輝, Tamas SOMFAI, 武田 久美子, 内山 京子 日本繁殖生物学会　講演要旨集 105 (0), 1038-, 2012

...存在する反復配列art2について解析を行った。...

DOI

福田 央, 周 延, 三上 重明 日本醸造協会誌 107 (1), 57-67, 2012

...清酒酵母を識別するために，長鎖末端反復配列（LTR）の領域100ヶ所を対象にPCR反応を試みた。その結果，<i>YDRWdelta</i>25，<i>YELWdelta</i>5，<i>YLRWdelta</i>20，<i>YGRWdelta</i>21，及び<i>YPLWdelta</i>7のLTR領域由来の5組のプライマーにより増幅DNA断片に差が認められた。...

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site ほか1件 参考文献38件

平井 啓久, 原 暢, 平井 百合子, 古賀 章彦 霊長類研究　Supplement 28 (0), 50-, 2012

...アルファサテライトＤＮＡは、霊長類のセントロメアの主成分となっている反復配列であり、171 bp の単位が連続している。チンパンジーのヘテロクロマチンの主成分とは異なる反復配列である。チンパンジーとヒトに加え、シアマンとシロテテナガザルの組でも、染色体端部の大規模ヘテロクロマチンの起源や機能の解明の研究が可能となった。...

DOI

堀居 拓郎, 柳澤 永吉, 森田 純代, 木村 美香, 畑田 出穂 日本繁殖生物学会　講演要旨集 105 (0), 1068-, 2012

...【方法】C57BL/6Jマウス由来受精卵を異なる酸素圧条件下（大気酸素圧あるいは低酸素圧5％O2）で４日間培養して得た胚盤胞期胚および子宮から直接採取した胚盤胞期胚（Vivo群）を用いて， COBRA法とバイサルファイトシーケンシング法により，ゲノム全体の反復配列（major & minor satellite, IAP-LTR）およびインプリント遺伝子（H19, Snrpn, Igf2r）のDNA...

DOI

Azuma, Yoshinao Memoirs of the Faculty of Biology-Oriented Science and Technology of Kinki University (27) 7-28, 2011-03-01

...酢酸菌のマイクロサテライの伸長・短縮は20世代くらいで1反復配列程度を示した。酢酸菌が有する易変異性を利用し通常では生育不可能な高温(42℃)で増殖が可能となる菌株の育種を試みた。40℃ での長期の培養の末、42℃ で増殖する株の獲得に成功した。その育種株の高温耐性形質が遺伝することを確認の後、全ゲノムDNA配列を次世代シークエンサーによって決定した。...

機関リポジトリ

古賀章彦, 平井 百合子, 平井 啓久 霊長類研究　Supplement 27 (0), 45-45, 2011

...これを考慮すると、「チンパンジーでは StSat 反復配列があるために、隣接する領域での非相同染色体間組換え頻度は、ヒトより低い」ことが可能性として考えられる。...

DOI

小笠原 慧, 石黒 聖也, 江澤 光江, 貴島 祐治 日本育種学会・日本作物学会北海道談話会会報 52 (0), 41-42, 2011

DOI

氏家 和広, 奥泉 久人, 高野 誠, 石丸 健 日本作物学会紀事 80 (4), 441-447, 2011

...本研究では，遺伝的多様性に富む8品種の子実用ソルガムを用いて，栄養成長期初期の光合成関連形質における品種間差異を解析した．材料の持つ遺伝的多様性を明らかにするために，15箇所の単純反復配列の差を利用して遺伝子型多型解析を行った．その結果，用いた品種は3つの大きなグループに分類された．日本と韓国で収集された3品種は同一のグループに属したが，アフリカ4カ国で収集された5品種は異なる3つのグループに分類された...

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site ほか1件 参考文献30件

今本 成樹, 渡邊 將人, 射場 満, 今本 三香子, 梅山 一大 動物臨床医学 20 (1), 1-5, 2011

...<br>　毛色に関与する遺伝子の一つである<i>SILV</i>（<i>Pmel17</i>）遺伝子に対して短い分散型核内反復配列（short interspersed nuclear element；SINE）挿入が起こることで大理石模様の個性的な毛色を作り出す。一方で眼疾患，難聴等の身体的異常をしばしば引き起こす毛色であることも知られている。...

DOI 医中誌 参考文献25件

大濱 武, 山崎 朋人 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2011 (0), 0230-0230, 2011

...<br> RNAi抑制効果が低下したクラミドモナスの株では、逆位反復配列中のCpG特異的にメチル化が蓄積しており、またpromoterと逆位反復配列領域のヒストンH3修飾は抑制的(H3K9me1)なものであった。この事から、RNAi効果の減衰はsilencerに対する転写抑制が原因であることがわかる。...

DOI

平井 啓久, 平井 百合子, 古賀 章彦, 鵜殿 俊史 霊長類研究　Supplement 27 (0), 44-44, 2011

...この領域のＤＮＡの主たる成分のひとつに、32 bp を単位とする縦列反復配列があり、StSat （subterminal satellite） 反復配列と呼ばれる。挿入メカニズムはまだ不明だが、ゲノム内の分散は減数分裂のブーケステージの染色体端部対合における、非相同染色体間の組換えによるものが、メカニズムのひとつと推測している。その推測を検証する目的で、先ず、染色体上の存在様式を明らかにした。...

DOI

塚本 淳, 白石 一乗, 児玉 靖司 日本放射線影響学会大会講演要旨集 2011 (0), 219-219, 2011

...【緒言】 テロメアは、真核生物の染色体末端に存在する反復配列とそれに結合するタンパク質からなる複合体であり、ループ構造を形成して染色体安定化に寄与している。テロメアはDNA複製に伴って短縮し、ループ構造を保てなくなると末端同士が融合し、染色体不安定化を招くと予想される。テロメアFISH法は、細胞ごと、あるいは染色体ごとのテロメアサイズの比較が可能であり、テロメア不安定化の解析に威力を発揮する。...

DOI 医中誌

金田 正弘, 渡辺 伸也, 赤木 悟史, 原口 清輝, SOMFAI Tamas, 稲葉 泰志, 下司 雅也, 永井 卓 日本繁殖生物学会　講演要旨集 104 (0), 1085-1085, 2011

...<BR>【方法】体細胞クローン雌牛4頭より血液（末梢白血球, PBL）および1頭あたり20個の卵子をOPU（Ovum-Pick Up）で回収し、DNAを抽出しバイサルファイトシーケンス法を用いて、反復配列領域におけるDNAメチル化状態を解析した。...

DOI

浦崎, 直也, 首藤, 亜耶乃, 儀間, 直哉, 太郎良, 和彦 沖縄県農業研究センター研究報告 = Bulletin of the Okinawa Prefectural Agricultural Research Center (4) 6-11, 2010-06

目的とする遺伝子の周辺に存在する多型を検出する方法を開発した。本法は、simple sequence repeatプライマーと目的遺伝子に特異的なプライマーを用いるPCRと目的遺伝子をプローブに用いるサザンハイブリダイゼーションより構成される（PSP法）。沖縄県農業研究センター育成のキク系統のDihydroflavonol …

日本農学文献記事索引 Web Site

石本, 政男 Gamma field symposia (47) 13-18, 2010-05

...私たちの研究グループでは、国内で開発されたSSR(simple sequence repeat: 単純反復配列)マーカーとSTS(Sequence Tagged Site)マーカーを米国農務省で開発されたSSRマーカーとともに3つの分離集団を用いて解析し、1つの連鎖地図に統合した。この統合連鎖地図には総計1,811個のPCRマーカーが含まれ、平均して1.4cMに1個のマーカーが位置づけられている。...

日本農学文献記事索引

飯田 聡子, 小檜山 篤志, 緒方 武比古, 村上 明男 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2010 (0), 0569-0569, 2010

...例えば渦鞭毛藻<I>Alexandrium tamarense</I>の<I>psbA</I>は全長1041塩基であり、20塩基の逆方向反復配列を含む残りの”非コード領域“と共に5.7kbのミニサークル構造をもつ。我々は、この<I>A. tamarense</I>のミニサークルゲノムに、通常型<I>psbA</I>とともに低頻度だが存在する4種類の<I>psbA</I>バリアントを発見した。...

DOI

牛田 博, 南 佳ほり, 川上 享弘, 茶野 徳弘, 岡部 英俊, 岡田 裕作, 岡本 圭生 日本泌尿器科学会雑誌 101 (2), 518-, 2010

DOI Web Site 医中誌

山本, 直幸, 小島, 孝敏, 大島, 一修, 落合, 寿成 肉用牛研究会報 (87) 29-36, 2009-06

...その遺伝子（MUC1）は、第2エキソンに縦列反復配列（VNTR）領域を持つ。そこで、黒毛和種雌牛のMUC1の第2エキソンに存在するVNTR領域の構造解析を行うとともに、MUC1-VNTR型と乳ムチンの機能性との関係を明らかにするために、自然哺乳により乳を摂取している哺乳初期の子牛発育性を指標として機能性の評価を試みた。...

日本農学文献記事索引 参考文献22件

藤郷 誠 東北農業研究センター研究報告 = Bulletin of TOHOKU Agricultural Research Center 110 199-224, 2009-03-01

In an attempt to generate soybean plants resistant to Soybean dwarf virus (SbDV), which causes serious damage to soybean production in northern Japan, we transformed a construct containing inverted …

DOI 機関リポジトリ 日本農学文献記事索引 ほか1件

原田, 久也 Gamma field symposia (46) 1-5, 2009-01

...ダイズのゲノムサイズは比較的大きく(1.12×10 9bp)、ゲノムの約半分は高度反復配列で構成され、非反復領域の90%以上は2コピー以上存在する複雑なゲノムを持っている。染色体数(n=20)で、近縁のインゲンマメ属やササゲ属に比較して極めて多い。これらのゲノムの特徴により、ダイズのゲノム研究は主要作物の中では遅れていた。...

日本農学文献記事索引

高橋 和裕, 木村 信熙, 田中 実, 大久保 武 日本畜産学会報 80 (4), 429-435, 2009

...本研究では黒毛和種の成長ホルモン受容体（GHR）遺伝子のプロモーター領域に見いだされたLINE-1多型と黒毛和種肥育牛の枝肉形質との関連について香川県内で肥育された348頭の枝肉評価の成績を元に解析を行った．遺伝子頻度はLINE-1反復配列を有するL型0.529，LINE-1反復配列を欠失するS型0.471であった．遺伝子型と枝肉形質との関連については，胸最長筋面積およびバラ厚についてはL型ホモ（LL...

DOI Web Site 医中誌 被引用文献1件 参考文献40件

風間 裕介, 河野 重行 ＰＬＡＮＴ　ＭＯＲＰＨＯＬＯＧＹ 21 (1), 71-77, 2009

...fluorescent <I>in situ</I> hybiridization (FISH)による性染色体の構造解析が容易である．性染色体は1対の常染色体から進化したとされる．性決定に関わる遺伝子の周囲で徐々に組換えが抑制され非組換え領域が誕生した．一方，偽常染色体領域(PAR)と呼ばれる組換えを起こす領域は減数分裂期に性染色体を対合させ，均等に分配する役割をもつ．私たちは，ヒロハノマンテマの染色体末端の反復配列...

DOI 参考文献28件

楠 真吾, 野村 港二 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2009 (0), 1003-1003, 2009

...二次構造予測プログラムmfoldによって解析したところ、1A1660-1000は逆方向反復配列を持っていることが明らかとなった。このMITE様配列1A1660-1000はイネ全染色体にわたって存在し、その部位は合計11613箇所であった。MITEには1000以上のコピー数を持つものも多いが、1A1660-1000のようにコピー数の多いMITEの例は多くない。...

DOI

松山 知樹 化学と生物 47 (3), 169-175, 2009

...栄養繁殖作物では，枝変わりなどの小さい変異で優良形質を得ることができる反面，品種・産地判別や権利保護のためにはDNAレベルの新しいトレーサビリティー手法の開発が必要な状況にある．これに対応すべく，物理的変異原処理後，形態・形質に変異のない個体を選抜し，ゲノムDNA中の反復配列から変異領域を見いだすことで品種内識別に資する「DNAマーク」の作成を行なった．ここでは，この一連のスキームを「DNAマーキング...

DOI Web Site 被引用文献3件 参考文献16件

向川 純, 三宅 啓文, 吉田 勲, 保坂 三継, 矢野 一好 化学生物総合管理 5 (1), 15-23, 2009

...そのうちデータベース化が容易で、手技的に簡単なVNTR法について、さらに多くの多重反復配列領域について菌株間での分解能などを検討した結果を基に、実際の集団感染事例より分離された菌株の解析結果をRFLP法と比較検討したので報告する。...

DOI

大澤 真木子, 猪子 香代, 武藤 順子 脳と発達 41 (3), 163-170, 2009

...第19染色体長腕のmyotonin protein kinase遺伝子 (DMPK) の3' 側非翻訳領域の不安定CTG三塩基反復配列が50回以上に伸長していることによる. 先天型MyD (CMyD) では, 多くは母がMyDである. CMyDは年齢により症状は変化するが, 幼児期・学童期には知的障害が問題であり, WISC-IIIでは言語性より動作性検査が低い....

DOI 医中誌 参考文献48件

大塚 靖, Saeung Atiporn, 高岡 宏行, Choochote Wej 日本衛生動物学会全国大会要旨抄録集 61 (0), 51-51, 2009

...の存在によるものであり，グループにより３～10の反復配列を持っている．また反復配列は配列の違いによりいくつかに分類され，その並び方のパターンもグループにより異なっていた．ミトコンドリアのCOI, COII配列やITS2の反復配列以外の部分との比較によりこれら５つのグループの反復配列の分化を検討してみる．...

DOI

千代田 将大, 石崎 公庸, 大和 勝幸, 河内 孝之 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2009 (0), 0284-0284, 2009

...また、逆位反復配列（IR）と小単一コピー（SSC）領域の境界において、rRNAオペロンの転写方向とは逆向きにIR内へ進行してきた複製フォークの蓄積と、それに伴う相同組換え中間体を見出した。複製フォークが蓄積している領域を薬剤耐性遺伝子で置換した組換え型ptDNAでは、複製フォークの蓄積とそれに伴う相同組換え中間体が消失した。...

DOI

平井 啓久, 宮部 貴子, PERWITASARI-FARAJALLAH D., PAMUNGKAS J. 霊長類研究　Supplement 25 (0), 19-19, 2009

...その内部構造を分子レベルで解剖したところ，テロメア，ヒト内在性レトロウィルス，ならびにサブターミナルサテライト（ss DNA）などの反復配列から構成されていることが明らかになった（Hirai et al. 2005）。我々は配列の特性からその領域をRCROと命名した。...

DOI

高力 宙, 石毛 久子, 与語 圭一郎, 高坂 哲也 日本繁殖生物学会　講演要旨集 102 (0), 1012-1012, 2009

...LGR8はリラキシン受容体LGR7と同様、N末細胞外ドメインにLDLaとロイシンに富む10回反復配列（LRRs）を有し、それに続く7回膜貫通領域とC末端の細胞内ドメインからなり、N末細胞外ドメインはリガンドとの結合に関与することが示唆されている。最近、LGR7には変異体（splice variants）が見出され、受容体機能に影響を及ぼすことが指摘されている。...

DOI

藤島, 成, 乾, 浩己, 綿谷, 正弘 近畿大学医学雑誌 33 (4), 283-289, 2008-12-01

...TS遺伝子には5'-非翻訳領域(UTR)の28塩基反復配列多型(3R，2R)と， 3'-UTRで6塩基(bp)の欠失を認める遺伝子多型(-6bp) および欠失を認めない(＋6bp)遺伝子多型が存在する.リンパ節転移陽性乳癌49例を対象に正常組織および腫瘍組織におけるTS遺伝子多型とTS発現を解析し，それらの関連性を検討した.TS遺伝子5'-UTRの遺伝子多型が正常組織で3R/3Rは8例， 2R/3R...

機関リポジトリ 医中誌

Hasegawa, Mari, Sekikawa, Akiko, Tanno, Fuminori, Itoh, Kimiko 新潟大学農学部研究報告 61 (1), 41-45, 2008-09

The Wx gene encodes a granule-bound starch synthase I (GBSSI) that plays a key role in the amylose synthesis. Previous study showed that introduction of Wx transgene into null-mutant wx rice …

機関リポジトリ HANDLE

長谷川, 真理, 関川, 晶子, 丹野, 史典, 伊藤, 紀美子 新潟大学農学部研究報告 = Bulletin of the Faculty of Agriculture, Niigata University 61 (1), 41-45, 2008-09

...この原因は、外来遺伝子が多コピー導入されたことにより、反復配列誘導性ジーンサイレンシングが起きたためである。この不安定な表現型の出現を解決するために、バイナリーベクターpWABを構築し、アグロバクテリウム法によりwx欠損変異体に導入した。得られた形質転換イネ、WAB／wx系統では低コピー数の外来遺伝子が確認され、胚乳において高アミロース型であり、その胚乳形質は安定に次世代に遺伝した。...

日本農学文献記事索引

植田, 信太郎, 五條堀, 淳 霊長類研究所年報 38 93-93, 2008-08-31

HANDLE

加藤, 博己, 河野, 善衛, 高橋, 佳江, 甲田, 俊夫, 岸本, 学, 三谷, 匡, 松本, 和也, 佐伯, 和弘, 細井, 美彦, 入谷, 明 近畿大学先端技術総合研究所紀要 (13) 61-70, 2008-03-01

...IAP は、その両端にLong Terminal Repeat（LTR）と呼ばれる、強力な転写プロモーター活性やエンハンサー活性を持つ、長い末端反復配列を持つ（Dewannieux et al., 2004）。...

機関リポジトリ Web Site

前田 伸司, 村瀬 良朗, 御手洗 聡, 菅原 勇, 加藤 誠也 結核 83 (10), 673-678, 2008

[Purpose] The discriminatory power of each locus in variable numbers of tandem repeats (VNTR) analyses was evaluated for development of the genotyping method of Mycobacterium tuberculosis (TB) in …

DOI Web Site 医中誌 被引用文献10件 参考文献8件

岸本 晃彦, 小野 雪夫, 村川 克二, 石橋 整, Wakamatsu Ai, 兼堀 恵一, Nomura Nobuo, Isogai Takao, 養王田 正文, Sugano Sumio ＣＢＩジャーナル 8 (1), 1-13, 2008

In the Full-length Human cDNA Sequencing Project, 30,160 cDNA were sequenced. Among them, our group performed sequencing of 3,588 cDNAs, mainly using the primer walking method. The sequences …

DOI Web Site 参考文献19件

千代田 将大, 石崎 公庸, 大和 勝幸, 河内 孝之 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2008 (0), 0226-0226, 2008

...逆位反復配列中の23S rRNA遺伝子付近が一本鎖DNAに富んだ領域であることが示唆されたため、その近傍領域の複製中間体DNAの構造をアガロースゲル二次元電気泳動によって解析した。小単一コピー領域から進行する複製フォークが逆位反復配列との境界付近で停止した複製中間体DNAが見出された。...

DOI

浅水 恵理香, 福岡 浩之, 小野 章子, 渡邊 安希子, 笹本 茂美, 和田 津由子, 金子 貴一, 田畑 哲之 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2008 (0), 0329-0329, 2008

...このBAC-by-BACに加えて、全ゲノムを対象としたショットガンシークエンスの蓄積を、末端配列に高反復配列をもたないBACを混合して作製したライブラリーを材料に進めている。これまでに120万リード、総延長860 Mbを蓄積した。Tomato Gene Indexを用いた相同性検索により、58%のunigeneを含んでいることが分かった。...

DOI

井上-村山 美穂, 井上 英治, 渡邊 邦夫, 村山 裕一 霊長類研究　Supplement 24 (0), 64-64, 2008

...個体データが蓄積されている、霊長類研究所放飼場の若桜と嵐山、京都の嵐山E群、および幸島の主群とM群の、5集団のオス、計42個体で、monoamine oxidase A（<i>MAOA</i>）とB（<i>MAOB</i>）、androgen receptor（<i>AR</i>）、early growth response 3（<i>EGR3</i>）などの遺伝子の反復配列多型領域をPCR増幅して...

DOI

小平 美江子, 梁 治子, 高橋 規郎, 鎌田 直子, 古川 恭治, 中島 裕夫, 野村 大成, 中村 典 日本放射線影響学会大会講演要旨集 2008 (0), 264-264, 2008

...マイクロサテライトは多数の少数塩基が縦列に並んだ反復配列であるが、生殖細胞での反復数の突然変異率が高いことが知られている。今回、原爆放射線の継世代影響を調べるために、40のマイクロサテライト遺伝子座を選び、線量の高い原爆被爆者家族の子供66人(両親が被爆者である子供は4人)、線量の少ない家族の子供63人について、突然変異の検索をおこなった。...

DOI 医中誌

吉野 学, 安中 敏光, 小島 禎, 池戸 正成 感染症学雑誌 82 (3), 168-176, 2008

...マイコプラズマ肺炎の起因菌<I>Mycoplasma pneumoniae</I>のゲノム内に存在する反復配列SDC1を標的としたLAMPプライマーを設計し, 臨床検体からの診断法の確立を目的として, 特異性および感度に関する検討を行った.設計した<I>M. pneumoniae</I>用LAMPは65℃の等温条件下で, 試験したすべての<I>M. pneumoniae</I>に対し, 60分以内に...

DOI Web Site PubMed ほか1件 被引用文献7件 参考文献21件

深田 大介, 花田 隆昌, 多田 清絵, 森本 素子, 佐々田 比呂志, 佐藤 英明, 小林 仁 日本繁殖生物学会　講演要旨集 101 (0), 552-552, 2008

...FISHに用いた標識プローブは，Y染色体特異的配列（BC1.2.）およびX染色体特異的反復配列（JA884576）からPCR法により作成し，それぞれCy3およびFITCによるデュアルカラーFISHで性染色体を検出した。LCM前の性染色体の染色は，ｍRNAの分解を減らすために10分以内で染色する必要があることから，標本の変成とハイブリ時間を中心に検討した。...

DOI

加藤 史子, 谷口 郁也, 物部 真奈美, 江間 かおり, 廣野 久子, 山本（前田） 万里 日本食品科学工学会誌 55 (2), 49-55, 2008

チャの発現遺伝情報をもとに設計したSSRマーカー44種類の中から，品種識別に利用可能なマーカーを6種類選抜し，国内の主要なチャ41品種の遺伝子型を調べた．その結果，選抜したマーカーにより検出されたフラグメントは4～13種類と高い多型性を示し，最少2種類のマーカーの組み合わせにより今回調査したすべての品種を識別できることがわかった．さらに，異品種混入茶を模擬して「べにふうき」に「かなやみどり」を所…

DOI Web Site 被引用文献3件 参考文献17件

朝野 尚樹, 小曽納 雅則, 野口 健, 伴 義之 育種学研究 10 (2), 63-69, 2008

...本研究において、品種識別に利用したSSRは、2〜6塩基を単位とした反復配列であり、ゲノム中に多数散在している。一般的に共優性であり、反復単位の繰り返し数の変異性が高く、アリル数が多いため、一つのSSRマーカーで複数の品種の識別が可能であり複数のSSRマーカーを用いることにより品種識別能力が非常に高くなる。...

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site ほか1件 参考文献14件

蝦名, 真澄, 幸喜, 香織, 霍田, 真一 試験研究報告 (44) 103-112, 2007-08

...再現性が高く、実験操作も簡便であることから牧草類にも利用が広がっている単純反復配列(Simple sequence repeat; SSR)マーカーをギニアグラスで開発した。開発には品種‘ナツカゼ'のゲノムDNAを用いた濃縮ライブラリー法および未熟花穂由来mRNAを利用した発現配列タグ(Expressed sequence tag; EST)法を用いた。...

日本農学文献記事索引

蝦名, 真澄, 幸喜, 香織, 奥村, 健治, 稲福, 政史 試験研究報告 (44) 103-106, 2007-08

...開発した単純反復配列(SSR)マーカーにより，ギニアグラス品種および遺伝資源の系統関係について検討したところ結果は以下のとおりであった。1. アポミクシスであるギニアグラスにSSRマーカーによって確認できる幅広い遺伝的変異が認められた。2. ケニアの系統は系統樹内のすべてのグループに散在し，最も幅広い遺伝的変異が認められた。3....

日本農学文献記事索引

服部 尚生, 田中 玲子, 知花 博治, 神戸 俊夫 日本医真菌学会総会プログラム・抄録集 51 (0), 63-63, 2007

...<I>C. albicans</I>の反復配列であるRPSは内部反復配列ALT（172bp）により構成される。この領域内のALTユニット反復回数は各RPSで異なり、さらにユニットの配列にも違いがみられる。今回、RPS領域のALTユニットの特徴を利用した<I>C. albicans</I>のgenotypingについて検討した。...

DOI

土生 芳樹, Olivier Mathieu, Paszkowski Jerzy 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2007 (0), 796-796, 2007

...シロイヌナズナのMOM1はゲノム中の一部の反復配列や外来性遺伝子の転写型サイレンシングに必須の因子だが、既知の標的遺伝子のすべてが多コピーで存在していたため、詳細な機構解析は困難だった。今回、内在性シングルコピー領域の転写抑制にもMOM1が関与していることが明らかになり、詳細な解析が可能になった。...

DOI Web Site

久野 裕, 佐藤 修正, 笹本 茂美, 和田 津由子, 原田 久也, 田畑 哲之 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2007 (0), 950-950, 2007

...また、ダイズの染色体数は2n=40で、非反復配列の多くが2コピー以上存在することから、4倍体由来の2倍体であると考えられている。ダイズのゲノム解析は、そのゲノムの大きさや複雑さのため、他の主要作物に比べて遅れている。<br>我々は、マメ科植物を対象としたゲノム解析の一環として、ダイズの連鎖地図作製を行っている。...

DOI

大和 勝幸, 八巻 新, 土本 卓, 福澤 秀哉, 河内 孝之 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2007 (0), 953-953, 2007

...しかし、DNMT触媒ドメインをもつこと、<I>DRE</I>のコピー間で相同性が見られない約3 kbの領域 (UCR, unconserved region) が存在すること、3' LTRが別の反復配列LTR 2に挟まれている等、これまでのレトロトランスポゾンにはない特徴的な構造を有していた。...

DOI

角谷 徹仁 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2007 (0), S029-S029, 2007

...植物のゲノムにおいては、メチル化されたシトシンの大部分はトランスポゾンなどの反復配列に分布する。シロイヌナズナのマイクロアレイを用いた最近の報告でも、この傾向が確認されている（Lippman et al, Nature 430, 471-; Zhang et al, Cell 126, 1189-）。...

DOI

星野 敦, 崔 丁斗, 朴 慶一, 朴 仁淑, 飯田 滋 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2007 (0), 544-544, 2007

...他のDNA型トランスポゾンと異なり末端逆反復配列を持たず、自律性因子は複製開始タンパク質のnuclease/ligaseドメインとDNAヘリケース・ドメインを持つRep/Hel転移酵素をコードすると予測されている。さらに植物のヘリトロンは、複製タンパク質AのサブユニットであるRPA70に類似したRPA転移酵素もコードする。...

DOI

石原 弘, 田中 泉, 田中 美香, 石渡 明子, 槫松 文子, 佐藤 明子, 鈴木 桂子, 太田 有紀, 鬼頭 靖司 日本放射線影響学会大会講演要旨集 2007 (0), 161-161, 2007

...IAPのようなゲノム内の反復配列に由来する不完全RNAから完全長のcDNAが逆転写されてゆくレトロトランスポジションの分子機構については研究が殆どなされていない。我々はIAP RNAの逆転写過程およびその放射線影響を解析するために、独自開発したライン化細胞を使用した逆転写レポーター遺伝子システムを基盤として、トランスジェニックマウスを樹立し、逆転写の解析を行った。 　...

DOI 医中誌

渡辺 嘉人, 高萩 真彦, 中森 泰三, 坂内 忠明, 久保田 善久 日本放射線影響学会大会講演要旨集 2007 (0), 85-85, 2007

...通常の反復配列の突然変異では1-2反復分の小さな変化が大部分であり、今回観察された大きな変化は特異であった。...

DOI

星野 洪郎, 清水 宣明, 大上 厚志, 田中 淳, SAHA Narayan M, 品川 雅彦, 大槻 貴博, 森 隆久, Hoque Ariful, Islam Salequl, 浜田 信行, 小林 泰彦, 和田 成一, 舟山 知夫, 鳴海 一成 日本放射線影響学会大会講演要旨集 2007 (0), 346-346, 2007

重粒子線照射によるがん治療では、X線照射には見られない優れた治療効果が報告されているが、多くの実験系では各種放射線の生物学的効果には著明な差が認められていない。しかし、重粒子線照射により、細胞形質の特異的変化が起きていることが予想される。この点を解明するため、ウイルス感受性を主な指標として解析を行った。<BR> （１） 重粒子線照射細胞のHIV-1感受性亢進 …

DOI 医中誌

星野 敦, 木下 哲 化学と生物 45 (2), 119-125, 2007

DOI Web Site 参考文献30件

佐々木 卓, 藤本 龍, 西尾 剛 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2007 (0), 798-798, 2007

...マイクロアレイ解析によって、シロイヌナズナの<I>DDM1</I>がトランスポゾンや縦列反復配列のメチル化に関与することが示されている。...

DOI

山本 雅子, 浅田 裕, 筒井 友和, 池田 亮, 山口 淳二 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2007 (0), 595-595, 2007

...このRNAiシステムでは，pOpOff2ベクターに<i>CAD1</i>のコード領域500bpとその逆向き反復配列がヘアピン構造を形成させ、内生<i>CAD1</i>のサイレンシングを引き起こすものである。上記コンストラクトを導入した植物ではDEXを塗布した部位にのみ局所的にRNAiを誘導することができる。...

DOI

山口 勝司, 小野 明美, 定塚（久富） 恵世, 寺田 理枝, 飯田 滋 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2007 (0), 299-299, 2007

...シロイヌナズナの変異体では、セントロメア付近やトランスポゾンなどの高次反復配列を中心にDNAのメチル化が低下し、世代を重ねるにつれて特定部位のメチル化と関連したepialleleが出現することもよく知られており、DNAのメチル化状態の維持に重要な機能を果たしていると考えられている。...

DOI

田中 泉, 田中 美香, 石渡 明子, 槫松 文子, 佐藤 明子, 鈴木 桂子, 石原 弘 日本放射線影響学会大会講演要旨集 2007 (0), 160-160, 2007

...レトロトランスポゾンIntracisternal A-particle (IAP) DNA element は二つのLTRに挟まれたgag-pol遺伝子を所持するユニットであり、反復配列として正常マウスゲノムに数千コピー含まれている。...

DOI 医中誌

板倉,学, 伊沢,剛, 鮫島,玲子, 三井,久幸, 南澤,究 日本微生物生態学会講演要旨集 118-, 2006-10-27

NDLデジタルコレクション

丸川 活司, 吉田 繁, 伊藤 智雄 検査と技術 34 (9), 831-835, 2006-09-01

DOI 医中誌

和田, 康彦, 重森, 卓人 佐賀大学農学部彙報 (91) 37-43, 2006-03

...そこで、Genbank塩基配列データベース中のブタおよびウシのゲノム配列から反復配列を網羅的に検索し、反復配列クラスごとの存在割合とコンセンサス配列からの塩基置換率の分布を調べた。その結果、ブタを除いて哺乳動物ゲノム中の反復配列ではLINEが最も多く存在しており、LINEは全ゲノム配列中の14-21％を占めていた。...

機関リポジトリ 日本農学文献記事索引 Web Site

鈴木, 孝仁, 岩口, 伸一, 西村, 和子, 横山, 耕治 千葉大学真菌医学研究センター報告 9 75-75, 2006-03

type:text

機関リポジトリ

鈴木,孝仁, 岩口,伸一, 西村,和子, 横山,耕治 千葉大学真菌医学研究センター報告 10 84-, 2006

type:text

機関リポジトリ

高須 陽子, 山田 弘生, 坪内 紘三 蚕糸・昆虫バイオテック 75 (2), 133-139, 2006

...また，このβシート構造は，セリシンMおよびPの分子内に存在する38アミノ酸残基からなるセリンリッチな反復配列に起因すると考えられた。<br>...

DOI Web Site 被引用文献2件 参考文献25件

知花 博治, 三上 襄 日本医真菌学会雑誌 47 (3), 129-134, 2006

...<i>Candida albicans</i> のゲノムにはMRS (major repeated sequence) を中心とする数種類の反復配列が含まれている. 2004年に<i>C. albicans</i> の全ゲノム配列が発表されたが, MRSが主な原因となりassembleとfinishingを困難にし, 現在でも染色体ごとに1本に編集されたゲノム配列の報告には至っていない....

DOI Web Site PubMed ほか1件 参考文献63件

齋藤 大地, 小塚 直樹, 鳥井 智太郎, 井上 和広, 三島 令子, 内田 雅之, 菊池 真 理学療法学Supplement 2005 (0), B0212-B0212, 2006

...<BR>　CDMは、第19染色体長腕にある3塩基対反復配列数が増加しており、これに発症年齢・重症度は関連するとされている。親から子に伝わった場合のリピート数が増加する（anticipation効果）傾向にあり、本2症例も母親はDM患者である。...

DOI 医中誌

嶋村 正樹, 富澤 健一 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2006 (0), 654-654, 2006

...存在した．色素体ゲノムを，その配列中に1ケ所の認識部位をもつ制限酵素で消化すると，環状ゲノムの消化に由来すると考えられる単量体サイズの線状分子だけでなく，線状ゲノムの消化に由来すると考えられる特定の大きさの分子が生じた．このことは，線状ゲノムが，試料調製の際に環状ゲノムがランダムに切断されることによって生じたのではなく，特定の末端配列をもつことを示している．制限酵素分断パターンを解析した結果は，逆位反復配列...

DOI

児玉 靖司, 渡邉 早苗, 有吉 健太郎, 白石 一乗, 縄田 寿克, 渡邉 正己 日本放射線影響学会大会講演要旨集 2006 (0), 248-248, 2006

...テロメアは、(TTAGGG)というグアニンリッチな反復配列で構成されることから、活性酸素種による攻撃の標的になりやすいと推定される。そこで本研究は、テロメアに放射線誘発損傷が蓄積する可能性を探るために、テロメアFISH染色によるシグナル異常の出現頻度について解析した。...

DOI

田中 泉, 田中 美香, 石渡 明子, 松島 裕美子, 近森 穣, 鈴木 桂子, 石原 弘 日本放射線影響学会大会講演要旨集 2006 (0), 257-257, 2006

...レトロトランスポゾンIntracisternal A-particle (IAP) DNA element は二つのLTRに挟まれた<i>gag-pol</i>遺伝子を所持するユニットであり、反復配列として正常マウスゲノムに数千コピー含まれている。...

DOI

山田, 誠, 盧, 忠恩, 倉田, 裕介, 松永, ゆかり, 新関, 稔 弘前大学農学生命科学部学術報告 (8) 17-23, 2005-12-26

...また，メチレーションパターンの変化や反復配列の増大なども報告図4. DNA メチレ－ションパターンの解析。レーン1-6 : Hpa II（メチレイションに感受性）で処理。レーン7-12 : Msp I（メチレイションに非感受性）で処理。プローブはC970 クローンを使用した。...

機関リポジトリ 日本農学文献記事索引 HANDLE ほか1件

船附 稚子 北海道農業研究センター研究報告 (183) 1-45, 2005-11

...「Glenlea」のLMW-GS遺伝子(GLEN42K)と「KS831957」のKANS2は「春のあけぼの」のHARU48Kや「ホロシリコムギ」のHORO1より短い反復配列を持っており、既知のLMW-GS遺伝子には見られない15のグルタミン(Q)からなるモチーフを持つことから、新規のLMW-GS遺伝子であると考えられた。10....

日本農学文献記事索引

佐藤, 由紀子, 長谷, 純崇, 萱嶋, 泰成, 村部, 直之, 沢田, 佳一郎 慶應義塾大学日吉紀要. 自然科学 38 25-40, 2005-09

type:text

機関リポジトリ Web Site 被引用文献2件

菊池 真, 小塚 直樹, 舘 延忠, 内田 英二, 仙石 泰仁, 堀本 佳誉, 武田 秀勝 総合リハビリテーション 33 (2), 167-173, 2005-02-10

DOI

角谷 徹仁 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2005 (0), S31-S31, 2005

...DNAメチル化の標的となるのは、多くの場合、トランスポゾン等の反復配列である。シロイヌナズナのDNA低メチル化突然変異体で誘発される発生異常を遺伝解析することから始まった私達のアプローチについてお話する。...

DOI

井上-村山 美穂, 鵜殿 俊史, 中井 映里, 岩月 裕美, HONG Kyung-Won, 松沢 哲郎, 竹中 修, 早坂 郁夫, 伊藤 愼一, 村山 裕一 霊長類研究　Supplement 21 (0), 81-81, 2005

...i>DAT1</I>）の3’非翻訳領域、セロトニントランスポーター遺伝子（<I>5HTT</I>）のイントロン領域、アンドロゲン受容体遺伝子のエキソン領域のグルタミン反復（<i>ARQ</i>）とグリシン反復（<i>ARG</i>）、エストロゲン受容体α遺伝子（<I>ERa</I>）のプロモーター領域、エストロゲン受容体β遺伝子（<I>ERb</I>）のイントロン領域の、6遺伝子7領域で、それぞれ反復配列数...

DOI

岩口 伸一, 鈴木 孝仁 日本医真菌学会総会プログラム・抄録集 49 (0), 65-65, 2005

...Ura<SUP>+</SUP> 株が生育できない 5-FOA 培地で培養すると、<I>hisG</I> 直列反復配列間での組換えが生じる。　染色体 R から 7 上の RB2 領域に <I>URA</I> ブラスターが挿入された株を 5-FOA 培地で培養して <I>hisG</I> 反復配列間の組換えを誘導し、RB2 領域内での組換えが染色体再編成を誘導するかについて調べた。...

DOI 医中誌

金子 貴一, 佐藤 修正, 中村 保一, 田畑 哲之 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2005 (0), 447-447, 2005

...今回、このデータを基に予備的な解析をおこない、その結果から、ゲノムの平均GC含量が約41％であること、高頻度に出現する反復配列がゲノムに存在することを明らかにした。今後は、ゲノム配列解析完了に向けて配列データの蓄積を進めるとともに、遺伝子単離や機能解析に向けて共同研究を含めたさまざまな可能性を探ってゆきたい。...

DOI

紀 嘉浩, 笹川 昇, 石浦 章一 日経サイエンス 34 (9), 58-65, 2004-09

1990年代初頭に，一群の実に奇妙な疾患の原因が明らかになった。これらの疾患は症状はさまざまだが，ある共通点があった。

PDF Web Site 被引用文献1件

川西, 由紀, 品田, 博史, 久保, 友彦, 三上, 哲夫 てん菜研究会報 = Proceedings of the Sugar Beet Research Association (45) 9-13, 2004-05

...さらに、FR4-31のミトコンドリアゲノム中に、三種類の反復配列が見つかった。このうち、rrn26(26SrRNA)遺伝子を含んだRepeat 1のみが、他のテンサイ細胞質と共通な反復配列で、残りの種は二FR4-31に固有であった。しかも、他のテンサイミトコンドリアゲノムとは異なり、 Repeat 1を介した組み換え産物が認められなかった。...

日本農学文献記事索引

大江 夏子, 田原 誠, 山下 裕樹, 丸谷 優, 蔵之内 利和 育種学研究 6 (4), 169-177, 2004

...ゲノム挿入部位を，葉から抽出したDNAを用い，蒸切干し用新品種候補を含む12品種についてS-SAP（Sequence-Specific Amplification Polymorphism）法により分析した結果，多数の複製配列の挿入と挿入部位の品種間の多型が検出された．品種間で違いが見られた <i>Rtsp-1</i>挿入部位の塩基配列を調べ，挿入を受けた宿主側の配列と<i>Rtsp-1</i>の末端反復配列間...

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site ほか1件 被引用文献6件 参考文献35件

山本 達男, 種池 郁恵, 中川 沙織, 岩倉 信弘 日本化学療法学会雑誌 52 (11), 635-653, 2004

In the United States, children are reported to have died of community-acquired methycillin-resistant <I>Staphylococcus aureus</I> (CA-MRSA) infection between 1997 and 1999. During The same period, …

DOI 医中誌 被引用文献9件 参考文献83件

坂本 敏夫, 堀口 法臣, 石田 健一郎, 和田 敬四郎 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2004 (0), 653-653, 2004

...ラン藻のゲノム中に見られる反復配列をプライマーとして用いたRAPD(random amplified polymorphic DNA)解析によって増幅されたDNAのバンドパターンは、金沢型では採集地が異なっても同一であったのに対して、大阪型では一致しなかった。この結果は、金沢型は遺伝的に均一であるのに対して、大阪型はさらに細分化されることを示唆する。...

DOI

井上-村山 美穂, 日比野 絵美, 松沢 哲郎, 平田 聡, 竹中 修, 早坂 郁夫, 伊藤 愼一, 村山 裕一 霊長類研究　Supplement 20 (0), 69-69, 2004

...ドーパミンD4受容体（<i>DRD4</i>）のイントロン領域、ドーパミントランスポーター（<i>DAT1</i>）の3’非翻訳領域、セロトニントランスポーター（<i>5HTT</i>）のイントロン領域、モノアミンオキシダーゼA（<i>MAOA</i>）のプロモーター領域、アンドロゲン受容体（<i>AR</i>）のエキソン領域の5遺伝子で、それぞれ反復配列数の異なる2、2、4、2、8種類のアレルが見...

DOI

鳥海 和也, 塚原 琢磨, 小笠原 絵美, 花井 亮 生物物理 44 (supplement), S138-, 2004

DOI Web Site

山本 俊哉 植生史研究 12 (1), 47-52, 2004

...クリ品種「筑波」のゲノミックDNAを用いて，(AG) / (CT)の反復配列をターゲットとして，マグネットビーズによる濃縮法によりSSRマーカーを作成した。...

DOI Web Site

鈴森,薫 日本産科婦人科學會雜誌 55 (2), 130-, 2003-02-01

...同期細胞における染色体分析が可能で精子や初期胚の染色体分析にも応用できる.2.単一遺伝子病 単一遺伝子病の中で責任遺伝子が判明している疾患は3,000程度である.遺伝子hunterの時代は21世紀になっても終わっていない.多くの単一遺伝子病で遺伝子解析が行われ,病気の重症度や予後との関係が精力的に解明された.これらMendelの遺伝法則に従う単一遺伝子病から,Mendelの法則では説明できない3塩基反覆配列伸長型遺伝病...

NDLデジタルコレクション NDLデジタルコレクション 医中誌 参考文献23件

嶋田 透, 北川 正成, 三田 和英 日本蚕糸学会 学術講演会 講演要旨集 2003 (0), 95-95, 2003

...得られた配列データをPFPフィルター(Paracel社)に通し，ベクターの配列や既知のカイコ反復配列と100bp以上一致する配列などをマスクした。その過程で，mariner様配列が848リード，BMC1が 481リードなどと，多数の反復配列が検出された。...

DOI

土生 芳樹 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2003 (0), S47-S47, 2003

...シロイヌナズナの<I>mom1</I>変異体では、転写型ジーンサイレンシングを受けている外来性多コピー導入遺伝子やセントロメア近傍に存在する反復配列からの転写活性化が見られるが、<I>ddm1</I>や<I>met1</I>変異体とは異なり、ゲノム全体のDNAメチレーションの低下は見られず、形態的異常も観察されない。...

DOI

井内 陽子, 太田 裕理子, 錦見 盛光 ビタミン 77 (11), 617-618, 2003

DOI 医中誌

藤原 晴彦 日本蚕糸学会 学術講演会 講演要旨集 2003 (0), 4-4, 2003

...カイコ表皮タンパク質BmCPG1はGGYGGという特徴的な反復配列構造を含み、外表皮の構成成分として脱皮期に特異的に発現する。この構造は表皮タンパク質以外にも、卵殻タンパク質、セメントタンパク質、植物の細胞壁成分や哺乳類のケラチンなど硬いタンパク質に広く保存されている。したがって、GGYGG構造がタンパク質の硬化と関係していると予測された。...

DOI

大山 莞爾, 大和 勝幸, 石崎 公庸, 岡田 祥子, 藤澤 雅樹, 中山 繁樹, 藤下 まり子, 坂東 倫行, 蓮見 明子, 坂田 亮子, 西尾 朋久, 淀谷 幸平, 坂東 弘樹 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2003 (0), 18-18, 2003

...ゼニゴケY染色体は約10 Mbと見積もられ、Y染色体特異的反復配列が蓄積している領域YR1（約4 Mb）と、その他の領域YR2（約6 Mb）に大別できる。YR1については、制限酵素切断パターンの異なる25個の代表PACクローン及び470-kbのコンティグ正味の配列情報を得た。...

DOI

大沢 勇久, 土本 卓, 津田 賢一, 山崎 健一, 大坪 久子, 大坪 栄一 日本植物生理学会年会およびシンポジウム　講演要旨集 2003 (0), 283-283, 2003

...<I>p-SINE1</I>はイネゲノムに多コピー数存在する大きさ122 bpの散在性反復配列であり、転写産物が逆転写されることによって転移するレトロポゾンSINEであると考えられている。我々はノーザン解析によりイネの培養細胞で<I>p-SINE1</I>が転写されていることを見出した。転写産物の両端を決定したところ、ゲノムにおける<I>p-SINE1</I>配列の両端と一致していた。...

DOI

近江戸 伸子 育種学研究 5 (4), 183-191, 2003

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site ほか1件 参考文献37件

皆川, 真規, 渡邊, 智之, 南谷, 幹史, 高橋, 良仁, 安田, 敏行, 河野, 陽一 千葉医学雑誌 = Chiba medical journal 78 (1), 65-65, 2002-02-01

type:text

機関リポジトリ 医中誌

藤本 良一, 鎌田 伸之, 横山 和博, 瀧 雅行, 友成 真弓, 堤 聡, 山之内 浩司, 長山 勝 日本口腔粘膜学会雑誌 8 (1), 1-8, 2002

...染色体の末端はテロメアと呼ばれ, TTAGGG という6塩基を単位とする長い反復配列からなる。テロメアは細胞が分裂する度に短縮していくが, テロメラーゼはその短縮を補う酵素であり, 細胞の老化, 不死化に関与しているとされている。...

DOI 被引用文献13件

大塚 靖, 高岡 宏行 日本衛生動物学会全国大会要旨抄録集 54 (0), 25-25, 2002

...FeilaiはSINEの特徴であるtRNA相同領域と非tRNA相同領域、さらに末端にGAAの反復配列を持ち、約280塩基からなる。また両端には挿入時にできたと思われる10塩基ほどの繰り返し配列を持つものもあり、ゲノム上に多数のコピーが存在している。...

DOI

安河内 祐二, 馬場 浩太郎, 野畑 順子, 三田 和英 日本蚕糸学会 学術講演会 講演要旨集 jsss72 (0), 148-148, 2002

...多コピー配列等の影響によりコンティグ構築が混乱するのを避けるために、ゲノム上に散在するBm1反復配列間の領域を増幅するようなプライマーを用いて、BACクローンのPCRによるFingerprintingを行い、明らかに連続性があると考えられるクローン群について上述の方法でSTSを設定して、多型があればマッピングしている。...

DOI

江尻 由希, 南久松 眞子, 藤本 浩文, 山内 恵美子, 野畑 順子, 三田 和英, 橋戸 和夫, 土田 耕三, 普後 一, 高田 直子, 前川 秀彰 日本蚕糸学会 学術講演会 講演要旨集 jsss72 (0), 83-83, 2002

...カイコ(Bombyx mori)ゲノム中のrDNA領域は240コピーの反復配列からなり、一部にR1BmやR2Bmといった転位因子様配列が部位特異的に挿入されている。このrDNA反復配列領域において、R1BmやR2Bmが存在する領域では、周囲の反復配列とは異なる染色体構造を有しているのではないかと推察し、rDNAクラスター内にR1BmとR2Bmがどのように分布しているか観察した。...

DOI

行弘 研司, 瀬筒 秀樹, 伊藤 雅信, 清水 亨一, 盧 時甲, 鐘 伯雄, 伴野 豊 日本蚕糸学会 学術講演会 講演要旨集 jsss72 (0), 81-81, 2002

...このうち4つは反復配列を内在し、両種間で構造及びサイズに著しい変異が観察され、さらに、カイコの系統間においても変異に富んでいた。例えばアラニンtRNA遺伝子の両端に存在する介在配列にはTAを単位とする反復部分があり、カイコとクワコでは反復数が異なっていた。...

DOI

高橋 道佳, 小池 淑子, 味村 正博, 嶋田 透, 三田 和英 日本蚕糸学会 学術講演会 講演要旨集 jsss72 (0), 36-36, 2002

...今回は特にZ染色体上に存在するBmper遺伝子付近の約200kbpを調査した結果, この領域は転移因子由来の反復配列が多いことが判明し, ショットガンデータの30%以上に達した。それに対し構造遺伝子と推定される配列は少なく, Bmper遺伝子の他にgamma1-COP遺伝子および寄生性センチュウの遺伝子と類似の遺伝子の2つが見い出されたのみで, 遺伝子密度が低かった。...

DOI

齊藤, 美奈子 北海道立農業試験場報告 (100) 1-62, 2001-09

...欠失領域のジャンクション近傍の塩基配列をみると、いくつかの分離株に4～16塩基の一部不完全な反復配列が認められ、また、欠失のジャンクションの集中している領域があったが、他の変異には顕著な特徴が認められなかった。変異の生じるメカニズムとして、コピーチョイスが考えられる。　...

日本農学文献記事索引 Web Site

山本 真紀 日本女性科学者の会学術誌 1 (1), 18-21, 2001-03-31

<p>植物DNAファイバーの標本に対して蛍光in situハイブリダイゼーション（FISH）法による高解像度マッピングを行った。タルホコムギのDNAファイバー上へ18S・5.8S・26SリボソームRNA遺伝子（rDNA）をプローブとしたFISHを行ったところ，同遺伝子領域の連続したシグナルを最長2.0Mbまで追跡することができた．5SrDNAのプローブを用いた場合は，300kb～1200kbの範…

DOI Web Site

柴田 洋 ＰＬＡＮＴ　ＭＯＲＰＨＯＬＯＧＹ 13 (1), 61-68, 2001

Summary: There are many repetitive sequences in the genomes of higher plants. The significance of repetitive sequences and their role in evolution are not clear. I analyzed tandemly arranged …

DOI

中嶌, 輝子, 大村, 三男, 森口, 卓哉, 遠藤, 朋子 静岡県柑橘試験場研究報告 (29) 1-6, 2000-03

日本農学文献記事索引

河野 いつみ, 竹内 善信, 島野 公利, 佐々木 卓治, 矢野 昌裕 育種学研究 2 (4), 197-203, 2000

DNA polymorphism among 15 <I>japonica</I> varieties, which includes 10 local varieties and 5 improved varieties, and 2 <I>indica</I> varieties were investigated by restriction fragment length …

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site ほか1件 被引用文献20件 参考文献31件

河本 夏雄, THIBERT CHANTAL, BOULO VIVIANE, FANG QUN, BURNS JANE C., COUBLE PIERRE 日本蚕糸学雑誌 69 (1), 55-61, 2000

Gene transfer systems for producing transgenic animals have been investigated using different types of vectors. In this report, we tested pseudotyped retroviral particles for their ability to …

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site 参考文献23件

國井 基行, 長野 宏則, 貴島 祐治, 佐野 芳雄 日本育種学会・日本作物学会北海道談話会会報 41 (0), 17-18, 2000

DOI

川口 善治, 金森 昌彦, 石原 裕和, 長田 龍介, 木村 友厚 日本腰痛学会雑誌 6 (1), 6-12, 2000

...アグリカン遺伝子(AG)の多型性が腰椎椎間板変性およびヘルニア発症のリスクになり得るかを検討した．64名の20歳代女性を対象とし，腰椎MRIにて椎間板変性とヘルニアを検討した．AGの多型は，末梢血からgenomic DNAを抽出し，コンドロイチン硫酸鎖結合部で反復配列(VNTR)の多型が存在する領域をPCR法で増幅後，電気泳動を行い分析した．AGの多型は，VNTRの最も少ないアレル18から最も多い29...

DOI Web Site 医中誌 参考文献5件

高木, 基裕 水産大学校研究報告 47 (4), 151-252, 1999-03

コレクション : 国立国会図書館デジタルコレクション > 電子書籍・電子雑誌 > 独立行政法人

機関リポジトリ 日本農学文献記事索引 Web Site 被引用文献2件

田知本 正夫 石川県農業短期大学農業資源研究所報告 6 (0), 61-66, 1999

...PCR反応には国内外のレンゲ根粒菌5菌株を供試しSPH I(ランダムプライマー,nifHDK(窒素固定遺伝子nifの一部),およびERIC IRとERIC2(腸内細菌の遺伝子間反復配列の両端)のプラプライマーセットを用いた。いずれのプライマーでもPCRによってDNAの断片が増幅され,中国産と日本産のレンゲ根粒菌はそれぞれ類似のバンドパターンを示し両グループの識別は容易であった。...

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site

URASHIMA Alfredo S., 橋本 容子, DON Le D., 草場 基章, 土佐 幸雄, 中屋敷 均, 眞山 滋志 日本植物病理学会報 65 (4), 429-436, 1999

We have identified a family of dispersed repetitive DNA sequences in the genome of a <i>Magnaporthe grisea</i> isolate from finger millet (<i>Eleusine coracana</i>). Southern blot analyses showed …

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site 被引用文献10件 参考文献44件

原田 直樹, 阿部 京子, 東野 昌彦, 幡谷 功, 柏村 賀子, 池田 敏郎, 牛垣 由美子, 永田 行博, 新川 詔夫 臨床検査 42 (8), 939-944, 1998-08-15

DOI

赤井,潤, 木村,彰方, 畑,隆一郎 Connective tissue 30 (2), 134-, 1998-06-05

NDLデジタルコレクション 医中誌

和田 芳郎, 松岡 太郎, 今井 克美, 谷池 雅子, 真野 利之, 小野 次朗, 岡田 伸太郎, 近藤 郁子 脳と発達 30 (6), 543-548, 1998

We report here a case of an 11-year-old boy with juvenile type of dentatorubral-pallidoluysian atrophy (DRPLA). His psychomotor development has been delayed since infancy and cerebellar ataxia was …

DOI PubMed 医中誌 被引用文献3件 参考文献13件

堀木 真由美, 森島 淳之, 山縣 英久, 楽木 宏実, 池上 博司, 三木 哲郎, 荻原 俊男 日本老年医学会雑誌 35 (2), 136-138, 1998

A 70-year-old man, with mild-type myotonic dystrophy (MyD) diagnosed by molecular genetic analysis when he was 68 years old, complained of worsening intermittent claudication during the past 2 …

DOI PubMed 医中誌 被引用文献2件 参考文献11件

金森 裕之, 露無 慎二 日本植物病理学会報 64 (5), 462-470, 1998

Three DNA regions in <i>Xanthomonas campestris</i> pv. <i>citri</i> which were homologous to the <i>avrBs3</i> gene family commonly found in <i>Xanthomonas</i> spp. were cloned and their nucleotide …

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site 被引用文献3件 参考文献17件

Sato Yutaka, Yamamoto Yasuhito, Kizaki Harutoshi 歯科基礎医学会雑誌 40 (5), 506-514, 1998

Integration vectors have been used as genetic tools for mutagenesis in a number of organisms. We introduced random mutation into <I>Streptococcus mutans</I> with one of the vectors pVA891, and …

DOI

大貫 正俊, 花田 薫 日本植物病理学会報 64 (2), 116-120, 1998

...また,IR中の反復配列(iteron)の配置からAbMVはサブグループIII,西半球型,TbLCVおよびSPLCVはサブグループIII,東半球型のジェミニウイルスであることが判明した。...

DOI Web Site 被引用文献3件 参考文献20件

シャルマ アルン, 尾崎 武司, 池上 正人 日本植物病理学会報 64 (3), 187-190, 1998

...IR中にはTLCVに特徴的な反復配列ATTGGTACCAが存在し,その配置は他の旧世界型ジェミニウイルスと似ていた。...

DOI Web Site 参考文献21件

中川 善之 日本医真菌学会雑誌 38 (4), 279-283, 1997

In the yeast <i>Candida albicans</i> karyotype variation among strains such as change in specific chromosome size or in the number of chromosomes is frequently observed. We have found one repetitive …

DOI 医中誌 参考文献13件

小沢 浩, 武田 麻千子, 佐々木 征行, 須貝 研司, 橋本 俊顕, 本間 哲夫 脳と発達 29 (4), 303-309, 1997

We reported a 13-year-old boy with juvenile Huntington disease diagnosed by DNA analysis. Symptoms started with dysarthria at 6 years of age, which was followed by progressive dysgraphia and gait …

DOI PubMed 医中誌 参考文献15件

光森 健二, 寺井 章人, 小川 修, 岡 裕也, 山田 仁, 岡田 裕作, 吉田 修 日本泌尿器科学会雑誌 88 (2), 281-, 1997

DOI Web Site 医中誌

鈴木 信弘 ウイルス 47 (2), 145-154, 1997

...それぞれのセグメントは両末端の保存配列, 保存配列に隣接する逆反復配列をもっている。S1-S11は単一のORFを, 一方, S12は3つのORFを保有する。予想される翻訳産物が感染イネおよび感染ヨコバイ中に同定された。...

DOI Web Site PubMed ほか1件 被引用文献1件 参考文献57件

檜山 桂子, 檜山 英三, 石岡 伸一, 山木戸 道郎 日本内科学会雑誌 86 (1), 95-99, 1997

...ヒト染色体の末端を構成するテロメア反復配列は,遺伝子と異なり何のタンパクもコードしていないが,細胞の増殖,内部遺伝子の発現,染色体安定性の重要な鍵を握っている.ヒト細胞の無限増殖には,分裂の度に欠落してゆくこの反復配列を延長する酵素テロメラーゼが必須と考えられ,原発性肺癌でも小細胞癌全例,非小細胞癌の8割で検出される.この活性を指標とした肺癌細胞の存在診断・悪性度の判定,活性抑制による腫瘍増殖阻止などへの...

DOI Web Site PubMed ほか1件 被引用文献2件 参考文献5件

田村, 俊樹, 神田, 俊男, 常山, 泉, 村路, 雅彦, 行弘, 研司, 安河内, 祐二 蚕糸・昆虫農業技術研究所研究報告 (16) 31-40, 1996-03

日本農学文献記事索引 Web Site

南沢 究, 伊沢 剛, 三上 朋子, 坂井 満, 市毛 秀則 日本土壌肥料学会講演要旨集 42 (0), 52-, 1996

DOI

伊沢 剛, 三上 朋子, 坂井 満, 南沢 究 日本土壌肥料学会講演要旨集 42 (0), 52-, 1996

DOI

天津 朗典, 田村 隆弘, 吉田 正己, 手塚 正 皮膚 38 (5), 520-525, 1996

Bilateral herpes zoster developed on the trunk of a 9-year-old-boy with a history of chickenpox vaccination. He had received the vaccine at about 3 years of age and subsequently had suffered natural …

DOI

吉岡 啓子, 花田 薫, 野田 千代一, 大澤 勝次 日本植物病理学会報 62 (4), 422-424, 1996

...この2残基は,翻訳後のCP切断部位の近傍にあり,反復配列であった。同じ配列が,ダイズモザイクウイルスの米国分離株にみられ,この株との類縁性が示唆された。塩基配列を上記の分離株と比較したところ,CP遺伝子部分で約92∼93%, 3'非翻訳領域で92∼98%の相同性であった。...

DOI Web Site 参考文献11件

加来 久敏, 平八重 一之, 落合 弘和, 兼松 聡子, 野田 孝人, 土屋 健一, 日比 忠明 日本植物病理学会報 62 (1), 53-56, 1996

...イネ白葉枯病菌由来の高頻度反復配列を含むpJEL101をプローブとして,各代表菌株の全DNAを各種制限酵素で切断した断片についてサザンブロット解析を行った結果,いずれの制限酵素を用いても各代表菌株は固有のRFLPパターンを示し,相互の重複は認められなかった。また,同じレースに属する日本産とインドネシア産菌株は互いに相同な場合と異なる場合とがみられた。...

DOI Web Site 被引用文献1件 参考文献11件

藤邑, 俊克, Fujimura, Toshikatsu 東京医科大学雑誌 53 (5), 652-663, 1995-09-01

機関リポジトリ 医中誌 参考文献32件

園田, 昌司, 山田, 哲治, 内藤, 親彦 The Japanese journal of genetics 70 (2), 167-177, 1995-04

記事分類: 生物学--生態--動物

日本農学文献記事索引 Web Site 被引用文献1件 参考文献24件

園田, 昌司, 山田, 哲治, 内藤, 親彦 The Japanese journal of genetics 70 (1), 7-16, 1995-02

記事分類: 生物学--生態--植物

日本農学文献記事索引 Web Site 被引用文献4件 参考文献14件

Carraway K.L., Fregien N., 伊藤 ユキ Ｔｒｅｎｄｓ　ｉｎ　Ｇｌｙｃｏｓｃｉｅｎｃｅ　ａｎｄ　Ｇｌｙｃｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ 7 (33), 31-44, 1995

Mucins are highly <i>O</i>-glycosylated glycoproteins implicated in the protection of cells from extracellular agents. Two general classes of mucins have been described: secreted and membrane. Most, …

DOI 被引用文献9件 参考文献84件

南沢 究, 伊沢 剛 日本土壌肥料学会講演要旨集 41 (0), 57-, 1995

DOI

通堂 満, 森口 寿徳, 中山 弘, 田澤 煕, 井上 雅美, 河 敬世 臨床血液 36 (3), 218-223, 1995

...このクロナリティの検討で，IL-2刺激後の染色体分析では45X, -Yの異常を認め，さらにEBウイルス終末反復配列のサザン解析で単一構造であったことから，顆粒リンパ球の単クローン性増殖が示された。EBウイルス感染とNK型顆粒リンパ球増多症もしくはNK細胞白血病の強い関連が示唆される。...

DOI PubMed 医中誌 被引用文献1件 参考文献16件

堀田 光生, 土屋 健一, 加来 久敏, 平八重 一之, 日比 忠明 日本植物病理学会報 61 (5), 485-488, 1995

...フィリピン産イネ白葉枯病菌PXO61株(レース1)およびPXO63-6株(レース2)からニトロソグアニジン処理によって誘発された各種病原性変異株について,イネ白葉枯病菌由来の高頻度反復配列を含むプラスミドpJEL101をプローブとしてRFLP解析を行い,親株および他レース(1∼5)との比較を行った。...

DOI

伊沢 剛, 南沢 究, 服部 勉 日本土壌肥料学会講演要旨集 41 (0), 48-, 1995

DOI

Sonoda Shoji, Yamada Tetsuji, Naito Tikahiko, Nakasuji Fusao 遺伝学雑誌 70 (4), 533-542, 1995

Distribution of a family of tandemly repetitive sequences in <i>Hemitaxonus japonicus</i> (pYS family) was investigated among eight sawfly species and host races in the genus <i>Hemitaxonus</i>. …

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site ほか2件 被引用文献1件 参考文献22件

原澤 亮, 浅田 起代蔵, 加藤 郁之進 Ｔｈｅ　Ｊｏｕｒｎａｌ　ｏｆ　Ｖｅｔｅｒｉｎａｒｙ　Ｍｅｄｉｃａｌ　Ｓｃｉｅｎｃｅ 57 (3), 557-558, 1995

We have isolated a novel repetitive DNA element from Mycoplasma hyopneumoniae strain VPP11, the entire structure of which is distinct from those of prokaryotic transposons, insertion sequences or …

DOI Web Site PubMed

中川 善之 日本細菌学雑誌 50 (3), 671-685, 1995

...また,我々をはじめとする幾つかの研究室で取り上げられている<i>C.albicans</i>ゲノム内の反復配列群についても言及する。...

DOI Web Site PubMed ほか1件 被引用文献2件 参考文献100件