検索結果 1,501 件

奥西, 将之 南太平洋海域調査研究報告 = Occasional papers 63 70-71, 2022-03-30

...またこの時摂餌している藻類は、PCR-DGGE法による解析の結果シオミドロ、ヒトエグサを摂餌していることが明らかになった。...

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Andrew F. Torres, Darryl Anthony M. Valino, Rachel Ravago-Gotanco Frontiers in Marine Science 8 2021-10-20

...Using polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis (PCR-DGGE) fingerprinting and sequencing of the zooxanthellae ITS2 region, we characterized endosymbiont diversity within four reef-building...

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Yuki Kawamura, Koji Mori, Seigo Amachi Journal of bioscience and bioengineering 132 (2), 154-160, 2021-08

DOI Web Site Web Site ほか1件 参考文献38件

Pavlos Makridis, Fotini Kokou, Christos Bournakas, Nikos Papandroulakis, Elena Sarropoulou Microorganisms 9 (1), 128-, 2021-01-08

...Microbial community richness as determined by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) showed an increase in bacterial diversity with fish development....

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早川 雄平, 油井 信弘, 藤井 克彦 廃棄物資源循環学会研究発表会講演集 32 (0), 205-, 2021

...また、PCR-DGGE法により水素生産菌叢と親菌叢の細菌メンバーを比較したところ、親菌叢では存在比が小さかった細菌が水素生産菌叢で優占種となっていることがわかった。</p>...

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立脇 祐哉, 肥後 昌男, 磯部 勝孝 土と微生物 75 (1), 23-31, 2021

...後作トウモロコシに感染するAM菌の群集構造に関して2017年度ではPCR-DGGE，2018年度ではアンプリコンシーケンスにより解析した。後作トウモロコシ根に感染するAM菌の種数(DGGEバンド数，OTU数)は耕起処理と冬作物管理の影響を受けなかった。...

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今井 剛, 前野 純一, 福島 聖人, 安井 美智, 鈴木 祐麻, 佐久間 啓, 人見 隆 土木学会論文集Ｇ（環境） 77 (7), III_111-III_120, 2021

<p>　本研究の目的は，硫化水素の発生抑制実験と電子放出菌の分子生物学的手法による菌叢解析を通して，導電性コンクリートを用いた電子伝達経路の提供による硫化水素の発生抑制に生物学的酸化が寄与していることの根拠を示すことである．硫化水素の発生抑制効果を示した導電性コンクリート供試体の経日的な菌叢変化をPCR-DGGE法および次世代シーケンサーによるメタゲノム解析により把握した結果，どちらの解析手法か…

DOI Web Site 参考文献22件

Masako Tsujimoto Noguchi, Haruka Nagase, Norihito Yamauchi, Genki Mimuro, Hiroshi Sakai, Akiko Furusawa, Shizue Miki, Shigenobu Yoshida Journal of Phytopathology 169 (3), 176-185, 2020-12-22

...Bacterial and fungal communities in these soils were analysed using polymerase chain reaction–denaturing gradient gel electrophoresis (PCR–DGGE), which indicated that a specific DGGE band with metrics...

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Agata Siedlecka, Mirela Wolf-Baca, Katarzyna Piekarska Water 12 (9), 2601-, 2020-09-17

...Bacterial consortia dwelling in bulk tap water were additionally compared by means of denaturating gradient gel electrophoresis (DGGE)....

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Kishneth Palaniveloo, Muhammad Azri Amran, Nur Azeyanti Norhashim, Nuradilla Mohamad-Fauzi, Fang Peng-Hui, Low Hui-Wen, Yap Kai-Lin, Looi Jiale, Melissa Goh Chian-Yee, Lai Jing-Yi, Baskaran Gunasekaran, Shariza Abdul Razak Processes 8 (6), 723-, 2020-06-22

...highlighted and the techniques used to determine the microbial community structure during composting such as biochemical identification, polymerase chain reaction denaturing gradient gel electrophoresis (PCR-DGGE...

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Lu Zhang, Mengxuan Shi, Meiling Tian, Xuehua Wang, Junfu Ji, Xiaojun Liao, Xiaosong Hu, Fang Chen Food Frontiers 1 (2), 200-204, 2020-06

...Accumulating methods appear to detect microbial population, including denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), high‐throughput sequencing, and quantitative real‐time polymerase chain reaction (qPCR...

DOI Web Site Web Site ほか1件 被引用文献1件

Derbalah, Aly, Uobe, Kazuko, 中谷, 暢丈, Yamazaki, Takeshi, Sakugawa, Hiroshi Research Journal of Environmental Sciences 14 (1), 5-17, 2020

Article

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TEIBA ISLAM, OKUNISHI SUGURU, YOSHIKAWA TAKESHI, IKENAGA MAKOTO, FOUAD EL BASUINI MOHAMMED, MAE S SANTANDER-DE LEON SHEILA, MAEDA HIROTO Ｂｉｏｃｏｎｔｒｏｌ　Ｓｃｉｅｎｃｅ 25 (2), 81-89, 2020

...Big size ciliates were identified as <i>Euplotes minuta</i> and <i>Cyclidium varibonneti</i>, while small size was identified as <i>Micrometopion nutans</i>, based on PCR-DGGE....

DOI Web Site PubMed 被引用文献1件 参考文献32件

TEIBA ISLAM, YOSHIKAWA TAKESHI, OKUNISHI SUGURU, IKENAGA MAKOTO, BASUINI MOHAMMED EL, MAEDA HIROTO Ｂｉｏｃｏｎｔｒｏｌ　Ｓｃｉｅｎｃｅ 25 (1), 25-33, 2020

...rDNA, and PCR-DGGE of <i>pufM</i>....

DOI Web Site PubMed 参考文献25件

Joana Montezano Marques, Jackeline Rossetti Mateus, Thais Freitas da Silva, Camila Rattes de Almeida Couto, Arie Fitzgerald Blank, Lucy Seldin Diversity 11 (12), 231-, 2019-12-03

...The total community DNA was extracted from the rhizosphere and analyzed by Polymerase Chain Reaction-Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (PCR-DGGE) and quantitative real-time PCR (qPCR), based on the...

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水谷, 智洋 長野県工業技術総合センター研究報告 = Research reports of Nagano Prefecture General Industrial Technology Center (14) 216-219, 2019-10

変性剤濃度勾配ゲル電気泳動法を用いて，県内産の野沢菜漬け及び味噌の菌叢を解析した。その結果，野沢菜漬けでは，発酵の主要微生物である乳酸菌以外の微生物も検出された。乳酸菌以外で検出された微生物は，海洋に存在していることが知られており，天日塩の使用により菌叢が変化することが示唆された。味噌では，スターターとして使用されている耐塩性酵母や耐塩性乳酸菌以外の微生物が検出された。品評会において特徴ありとさ…

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志村, 洋一郎, 高橋, 智子, 佐々木, 聡子, 稲元, 民夫, Shimura, Yoichiro, Takahashi, Satoko, Sasaki, Satoko, Inamoto, Tamio 秋田県立大学ウェブジャーナルB（研究成果部門） 6 13-19, 2019-09-30

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Hook Whitney, Plante Craig Plankton and Benthos Research 14 (3), 197-205, 2019-08-26

...Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) was used to identify a selection of isolated antibiotic-producing bacteria within whole-community environmental samples....

DOI Web Site Web Site 参考文献52件

渡辺 聡 日本食品科学工学会誌 66 (3), 67-73, 2019-03-15

...The microflora produced in each manufacturing step was analyzed by PCR-DGGE to identify hygiene-related bacteria and lactic acid bacteria....

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site ほか2件 参考文献4件

Ohtomo Ryo, Oka Norikuni, Morimoto Sho Ｍｉｃｒｏｂｅｓ　ａｎｄ　ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ 34 (4), 356-362, 2019

...Therefore, PCR-DGGE is useful as a quality control tool for maintaining culture collections of AM fungi.</p>...

DOI Web Site Web Site ほか1件 被引用文献1件 参考文献37件

桝田, 和彌, 青木, 萌, 寺澤, 沙希, 飯野, 久和, MASUDA, Kazuya, AOKI, Megumi, TERASAWA, Saki, IINO, Hisakazu 学苑 (938) 26-31, 2018-12-01

...DGGE profiles demonstrated that the total bacterial flora was stable and no significant changes were found due to storage conditions or periods....

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Bilge Alpaslan Kocamemi, Duygu Dityapak, Neslihan Semerci, Esra Keklik, Alper Akarsubası, Mert Kumru, Halil Kurt Water Science and Technology 78 (9), 1901-1915, 2018-10-19

...DGGE analyses revealed a drastic change in the microbial community (56%) with Anammox enrichment....

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高木 啓詞, 太田 俊也, 松村 英功, 望月 光明, 加藤 雄成, 勝亦 正浩 日本食品微生物学会雑誌 35 (3), 143-148, 2018-09-30

<p>耐熱性菌は，加熱殺菌後の食品を変敗する原因菌として注目しなければならない．一般的に耐熱性菌のスクリーニングは加熱処理したサンプルを培養する方法で行われることが多い．しかしながら，培養条件による偏りが生じるため，網羅的に検出できていない可能性がある．培養によらない生菌の菌叢解析方法としてEMA-PCR-DGGE法が知られている．</p><p>そこで，本研究では加熱処理したサンプルをEMA-P…

DOI Web Site Web Site ほか1件

Patrick Jung, Laura Briegel‐Williams, Michael Schermer, Burkhard Büdel MicrobiologyOpen 8 (5), e729-, 2018-09-21

...This study is the first of its kind revealing the efficiency of combining denaturing gradient gel electrophoresis (<jats:styled-content style="fixed-case">DGGE</jats:styled-content>), light microscopy...

DOI Web Site Web Site ほか1件 被引用文献1件

鈴木, 昌治, Suzuki, Masaharu 東京農業大学農学集報 63 (1), 1-9, 2018-06

...PCR-DGGE法により細菌相を調べた結果，生ごみ溶解槽と酸生成槽では微生物の機能がそれぞれ分離成立し，各槽の細菌間では共代謝していることが確認された。 エタノール固体発酵システムは，試料調製（水分調製），糖化発酵，蒸留の工程から構成される。乾燥生ごみにおいて糖化酵素の生産に適した麹菌として，麦味噌用のAspergillus oryzaeKBN650株を選出した。...

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Renpeng Du, Gang Song, Dan Zhao, Jian Sun, Wenxiang Ping, Jingping Ge International Journal of Food Science & Technology 53 (8), 1925-1931, 2018-04-02

.../jats:styled-content>) and polymerase chain reaction‐denaturing gradient gel electrophoresis (<jats:styled-content style="fixed-case">PCR</jats:styled-content>‐<jats:styled-content style="fixed-case">DGGE...

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西島 美由紀, 安 光得, 富田 順子, 喜友名 朝彦, 佐藤 嘉則, 木川 りか, 佐野 千絵, 宇田川 滋正, 建石 徹, 杉山 純多 保存科学 = Science for conservation 57 23-47, 2018-03-23

...method (PCR-DGGE)....

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Muro, Misato, Soga, Yoshihiko, Higuchi, Tomoko, Kataoka, Kota, Ekuni, Daisuke, Maeda, Yoshinobu, Morita, Manabu Folia Microbiologica 63 (5), 587-597, 2018-03-12

...Bacterial DNA samples obtained from the oral mucosa before and after HCT were subjected to PCR-DGGE. The trajectory of oral mucositis was evaluated....

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綾本, 碧尉, 西堀, 洋平, 宮下, 英明 ELCAS Journal 3 104-104, 2018-03

地衣類は藻類(フィコビオント)と菌類(ミコビオント)の共生体である. フィコビオントには, 緑藻類やシアノバクテリア(藍藻類)が知られており, 多くの地衣類は主に緑藻類と共生している. 従来, 地衣類に共生する藻類の同定は, 共生藻類の形態形質に基づいて行われてきた. これには専門的な知識・技術や時間が必要で, 多検体を網羅的に, また短時間に扱うことは容易ではない. …

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Li Wang, Benhua Zeng, Zhiwei Liu, Zhenlin Liao, Qingping Zhong, Lihui Gu, Hong Wei, Xiang Fang Journal of Food Science 83 (3), 864-873, 2018-02-10

...TP also significantly increased acetic acid and butyric acid levels in HFA mice. 16S rRNA V3 region Polymerase Chain Reaction‐Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (PCR‐DGGE) profiles showed that HFD...

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件

Yoshimoto Ayumi, Uebanso Takashi, Nakahashi Mutsumi, Shimohata Takaaki, Mawatari Kazuaki, Takahashi Akira Ｊｏｕｒｎａｌ　ｏｆ　Ｃｌｉｎｉｃａｌ　Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ　ａｎｄ　Ｎｕｔｒｉｔｉｏｎ 62 (2), 155-160, 2018

<p>Several environmental factors during the prenatal period transgenerationally affect the health of newborns in later life. Because low-dose antibiotics have been used for promoting the growth of …

DOI Web Site 医中誌 被引用文献2件 参考文献25件

Mourad Elhussein F, Sarhan Mohamed S, Daanaa Hassan-Sibroe A, Abdou Mennatullah, Morsi Ahmed T, Abdelfadeel Mohamed R, Elsawey Hend, Nemr Rahma, El-Tahan Mahmoud, Hamza Mervat A, Abbas Mohamed, Youssef Hanan H, Abdelhadi Abdelhadi A, Amer Wafaa M, Fayez Mohamed, Ruppel Silke, Hegazi Nabil A Ｍｉｃｒｏｂｅｓ　ａｎｄ　ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ 33 (1), 40-49, 2018

...This accurately reflected the endophytic community composition, in terms of diversity indices (S′, H′, and D′) based on PCR-DGGE, and clustered the plant culture media together with the qPCR root populations...

DOI Web Site Web Site ほか1件 被引用文献1件 参考文献41件

山本 直子, 小貫 浩平, 北村 義明, 荒木 裕子 日本調理科学会大会研究発表要旨集 30 (0), 85-, 2018

...PCR-DGGE法による各漬け床の細菌叢の解析では、市販甘酒床では熟成期間による菌叢の違いはなかったが、冷蔵保存したことにより菌叢にわずかな変化が見られた。手作り甘酒床では熟成期間4日間のものが他と比較して菌叢が大幅に異なることが確認されたが、それ以外は菌叢に大きな違いがなく、７日間熟成や熟成後の冷蔵保存により市販甘酒床の菌叢に近づいた。...

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堀尾 明宏, 後藤 淳, 李 富生, 青井 透, 宮里 直樹 土木学会論文集Ｇ（環境） 74 (7), III_1-III_7, 2018

現状，浄化槽(合併処理浄化槽)の8割近い施設は，窒素除去能力を有していない．そこで，本研究では浄化槽への窒素除去法の代替法の一方策として硫黄脱窒法を試みた．実験は，浄化槽やその排水路に適用しやすい開放水路型の形状として，横流れ式モデルを作成し，実試料を用いて硫黄脱窒性能と適用に向けての諸条件について検討した．その結果，浄化槽処理水でも効果的に脱窒効果が得られ，窒素除去型浄化槽と同様な処理性能が得…

DOI Web Site Web Site 参考文献2件

森本 晶, 新村 昭憲 北日本病害虫研究会報 2017 (68), 74-80, 2017-12-22

...の人工汚染圃場で定植時期をずらして2回実施した．3月に定植した試験1では，転炉スラグによって土壌pHを7.5～8.0に矯正することで発病が軽減され，併せてふすまを混和することでその効果がさらに高まった．4月に定植した試験2でも，試験1に比べやや効果は劣るものの同様の傾向が認められ，両資材の併用処理が本病の耕種的対策技術として有望であることが示された．また，各処理が土壌糸状菌相に及ぼす影響をPCR-DGGE...

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site

Karina Edith Motato, Christian Milani, Marco Ventura, Francia Elena Valencia, Patricia Ruas-Madiedo, Susana Delgado Food Microbiology 68 129-136, 2017-12

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Jatindra N. Bhakta, Susmita Lahiri, Feroze A. Bhuiyna, Md. Rokunuzzaaman, Kouhei Ohonishi, Kozo Iwasaki, Bana B. Jana Energy, Ecology and Environment 3 (2), 102-109, 2017-11-02

DOI PDF Web Site 被引用文献1件 参考文献48件

Yanjun Mao, Xie Quan, Huimin Zhao, Yaobin Zhang, Shuo Chen, Tao Liu Water Science and Technology 77 (1), 70-78, 2017-10-10

...PCR-DGGE and FISH results indicated that more nitrifiers and denitrifiers co-existed in the IFFAS system, promoting simultaneous nitrification and denitrification....

DOI PDF 被引用文献1件

Xu-Cong Lv, Ya-Jun Jiang, Jie Liu, Wei-Ling Guo, Zhi-Bin Liu, Wen Zhang, Ping-Fan Rao, Li Ni International Journal of Food Microbiology 255 58-65, 2017-08

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Uebanso, Takashi, Kano, Saki, Yoshimoto, Ayumi, Naito, Chisato, Shimohata, Takaaki, Mawatari, Kazuaki, Takahashi, Akira Nutrients 9 (7), 756-, 2017-07-14

The sugar alcohol xylitol inhibits the growth of some bacterial species including Streptococcus mutans. It is used as a food additive to prevent caries. We previously showed that 1.5–4.0 g/kg body …

DOI 機関リポジトリ Web Site 被引用文献3件 参考文献41件

Vesna Milanović, Andrea Osimani, Manuela Taccari, Cristiana Garofalo, Alessandro Butta, Francesca Clementi, Lucia Aquilanti Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology 44 (7), 997-1004, 2017-07-01

...fermenting dye vats with woad (Isatis tinctoria L.) prepared and maintained in a functional state for approximately 12 months was examined using a combination of culture-dependent and -independent PCR-DGGE...

DOI PDF PDF ほか1件 被引用文献2件

Uebanso, Takashi, Ohnishi, Ai, Kitayama, Reiko, Yoshimoto, Ayumi, Nakahashi, Mutsumi, Shimohata, Takaaki, Mawatari, Kazuaki, Takahashi, Akira Nutrients 9 (6), 560-, 2017-06-01

Non-caloric artificial sweeteners (NASs) provide sweet tastes to food without adding calories or glucose. NASs can be used as alternative sweeteners for controlling blood glucose levels and weight …

DOI 機関リポジトリ Web Site 被引用文献4件 参考文献38件

Zhanbei B. Liang, Donald J. Lee, Ismail M. Dweikat, David A. Wedin, Gary Y. Yuen, Rhae A. Drijber Soil Science Society of America Journal 81 (3), 526-536, 2017-05

...Roots were analyzed by nested polymerase chain reaction (PCR), denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) fingerprinting, cloning, and insert screening by DGGE, and sequencing of ribosomal DNA small‐subunit...

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件

Kiyoaki Muto, Kanto Nishikawa, Ryoma Kamikawa, Hideaki Miyashita Phycological Research 65 (2), 171-174, 2017-04

...<jats:styled-content style="fixed-case">PCR‐DGGE</jats:styled-content> followed by phylogenetic analyses of partial 18S r<jats:styled-content style="fixed-case">RNA</jats:styled-content> sequences revealed...

DOI Web Site Web Site 被引用文献2件 参考文献12件

Tengfei Liu, Tianzhu Jia, Jiangning Chen, Xiaoyu Liu, Minjie Zhao, Pengpeng Liu Brazilian Journal of Microbiology 48 (2), 246-250, 2017-04

DOI Web Site Web Site 被引用文献2件

Paula Huber, Nadia Diovisalvi, Marcela Ferraro, Sebastián Metz, Leonardo Lagomarsino, María Eugenia Llames, Marta Royo‐Llonch, José Bustingorry, Roberto Escaray, Silvia G. Acinas, Josep M. Gasol, Fernando Unrein Environmental Microbiology 19 (3), 1120-1133, 2017-02-03

...The temporal variation of picocyanobacteria morphotype composition was weakly correlated with the DGGE temporal pattern, and could be explained by the composition of the zooplankton assemblage....

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件

Athenia L Oldham, Mia K Steinberg, Kathleen E Duncan, Zakari Makama, Iwona Beech Journal of Industrial Microbiology and Biotechnology 44 (2), 167-180, 2017-02-01

...Dominant bacterial taxa from the two higher current SSCs were different from that of the low-current SSC as determined by DGGE and verified by Illumina DNA-seq analysis....

DOI PDF PDF ほか1件 被引用文献1件

Ahmed Faruk Umar, Fatimah Tahir, Ediga Bede Agbo Advances in Microbiology 07 (06), 480-486, 2017

DOI Web Site XML 被引用文献1件

Sugiyama Junta, Kiyuna Tomohiko, Nishijima Miyuki, An Kwang-Deuk, Nagatsuka Yuka, Tazato Nozomi, Handa Yutaka, Hata-Tomita Junko, Sato Yoshinori, Kigawa Rika, Sano Chie The Journal of General and Applied Microbiology 63 (2), 63-113, 2017

...In addition, we generated microbial community data from TT and KT samples using culture-independent methods (molecular biological methods, including PCR-DGGE, clone libraries, and pyrosequence analysis...

DOI Web Site PubMed 参考文献173件

遠藤 雅貴, 小林 達明, 高橋 輝昌, 永野 博彦 日本森林学会大会発表データベース 128 (0), 444-, 2017

...DGGEによる菌叢の予備解析では、有機物層においてナラとマツでバンドの発光の位置や輝度に相対的な違いがみられた。</p>...

DOI

N. NUÑAL SHARON, SANTANDER-DE LEON SHEILA MAE S., HONGYI WEI, REGAL ADEL AMER, YOSHIKAWA TAKESHI, OKUNISHI SUGURU, MAEDA HIROTO Ｂｉｏｃｏｎｔｒｏｌ　Ｓｃｉｅｎｃｅ 22 (4), 187-203, 2017

...Changes in the bacterial community were monitored by the PCR-DGGE (polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis) method targeting the 16S rDNA gene....

DOI Web Site PubMed 参考文献49件

Ewelina Szacawa, Monika Szymańska-Czerwińska, Krzysztof Niemczuk, Katarzyna Dudek, Grzegorz Woźniakowski, Dariusz Bednarek Journal of Veterinary Research 60 (4), 391-397, 2016-12-01

...PCR/DGGE analysis demonstrated the presence of bacteria belonging to the Mollicutes class in 79.1% of DNA isolates....

DOI Web Site XML 被引用文献1件

Chorng-Horng Lin, Chih-Hsiang Chuang, Wen-Hung Twan, Shu-Fen Chiou, Tit-Yee Wong, Jong-Kang Liu, Chyuan-yao Kao, Jimmy Kuo Canadian Journal of Microbiology 62 (12), 1021-1033, 2016-12

...The DNA sequences of 26 distinct bands extracted from DGGE gels and 269 sequences of the 16S rRNA gene from clone libraries were determined....

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件

Sakuntala Saijai, Akinori Ando, Ryuya Inukai, Makoto Shinohara, Jun Ogawa Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 80 (11), 2247-2254, 2016-11-01

...The change in microbial composition during the enrichment was investigated by PCR-DGGE analysis with a focus on prokaryote, ammonia-oxidizing bacteria, nitrite-oxidizing bacteria, and eukaryote cell types...

DOI PDF 被引用文献2件

Asiloglu, Rasit, Murase, Jun Soil Science and Plant Nutrition 62 (5-6), 440-446, 2016-10-24

The rhizosphere is one of the hot spots in soil ecosystems for a variety of microorganisms. In this study, we explored the seasonal change of the microeukaryotic community of a rice rhizosphere …

DOI 機関リポジトリ HANDLE ほか1件 被引用文献3件 参考文献36件

Shaojie Wang, Liyu Peng, Yixin Jiang, Petros Gikas, Baoning Zhu, Haijia Su Scientific Reports 6 (1), 34640-, 2016-10-06

...Polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis (PCR-DGGE) analysis revealed that the split-feeding strategy provided a higher bacterial diversity and more stable bacterial community...

DOI PDF Web Site 被引用文献1件

Fei Zhao, Haiquan Liu, Zhaohuan Zhang, Lili Xiao, Xiaohong Sun, Jing Xie, Yingjie Pan, Yong Zhao Food Control 68 139-144, 2016-10

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件

Rong Zhang, Xiaoli Dong, Meng Zhou, Yan Tu, Naifeng Zhang, Kaidong Deng, Qiyu Diao Animal Science Journal 88 (5), 755-762, 2016-09-14

...The DGGE fingerprint of the 16S ribosomal RNA gene was affected by the blended probiotics at 83 days of age....

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件

Alejandro Grajales, Juan Armando Sanchez Revista de la Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales 40 (155), 300-, 2016-07-03

...La identificación de zooxantelas se realizó mediante análisis de RFLPs (18S, SSU, rDNA, por sus siglas en inglés), DGGE y secuenciación de ADN (ITS2, rDNA)....

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件

Takenouchi, Yuriko, Iwasaki, Kazufumi, Murase, Jun FEMS Microbiology Ecology 92 (7), fiw104-fiw104, 2016-07

...DGGE fingerprinting of microeukaryotes demonstrated a shift in the community structure depending on the oxygen tension during growth....

機関リポジトリ HANDLE

Lucia Kraková, Katarína Šoltys, Jaroslav Budiš, Tomáš Grivalský, František Ďuriš, Domenico Pangallo, Tomáš Szemes Extremophiles 20 (5), 795-808, 2016-06-23

DOI PDF Web Site ほか1件 被引用文献1件

Lin Fu, Yunze Ruan, Chengyuan Tao, Rong Li, Qirong Shen Scientific Reports 6 (1), 2016-06-16

...DGGE profiles demonstrated that resilient community structure of culturable rhizobacteria with higher richness and diversity were observed in BIO treated soils....

DOI PDF Web Site 被引用文献1件

Mohamed S. Sarhan, Elhussein F. Mourad, Mervat A. Hamza, Hanan H. Youssef, Ann‐Christin Scherwinski, Mahmoud El‐Tahan, Mohamed Fayez, Silke Ruppel, Nabil A. Hegazi Physiologia Plantarum 157 (4), 403-413, 2016-06-06

...Combining various plant‐based culture media and incubation conditions enabled us to resolve unique denaturing gradient gel electrophoresis (<jats:styled-content style="fixed-case">DGGE</jats:styled-content...

DOI Web Site Web Site 被引用文献2件

Xueyan Zhou, Xiaosong Jiang, Chaowu Yang, Bingcun Ma, Changwei Lei, Changwen Xu, Anyun Zhang, Xin Yang, Qi Xiong, Peng Zhang, Shuai Men, Rong Xiang, Hongning Wang MicrobiologyOpen 5 (5), 753-762, 2016-05-02

...styled-content> gene based on polymerase chain reaction‐denaturing gradient gel electrophoresis (<jats:styled-content style="fixed-case">PCR</jats:styled-content>‐<jats:styled-content style="fixed-case">DGGE...

DOI Web Site Web Site ほか1件 被引用文献1件

Watanabe, Akari, Tamaki, Naofumi, Matsuyama, Miwa, Kokeguchi, Susumu New Microbiologica 39 (2), 143-145, 2016-04

...Conventional PCR and PCR-DGGE were shown to be potentially useful for monitoring of bacterial contamination in DUWLs....

機関リポジトリ

細谷 幸恵, 川崎 晋, CHANTHASOMBATH Thongsavath, BUNTONG Borarin, バリ モハメド・ラティフル, 稲津 康弘 食品総合研究所研究報告 = Report of National Food Research Institute 80 17-22, 2016-03-10

Pathogenic bacteria contaminating raw vegetables are known to pose a risk of foodborne illnesses. Recent studies showed that the contamination with these bacteria may originate from irrigation …

DOI 機関リポジトリ Web Site ほか1件

森本, 直樹 東京都農林総合研究センター研究報告 (11) 19-23, 2016-03

...Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE)により，乳房炎乳と健康乳から分離した細菌は，Staphylococcus aureus，Staphylococcus epidemidis，Escherichia coli，Klebsiella pneumonia，Streptococcus agalactiae，Streptococcus disgalactiae...

日本農学文献記事索引 Web Site

Josué Castro-Mejía, Maja Jakesevic, Łukasz Krych, Dennis S. Nielsen, Lars H. Hansen, Bodil C. Sondergaard, Peter H. Kvist, Axel K. Hansen, Thomas L. Holm Gastroenterology Research and Practice 2016 1-12, 2016

...GM was characterized through DGGE and 16S rRNA gene-amplicon high-throughput sequencing.<jats:italic>Results</jats:italic>....

DOI PDF XML 被引用文献1件

高見澤 一裕, 中村 浩平, 佐藤 健, 岩橋 均, 山田 博子 土と微生物 70 (2), 45-50, 2016

...PCR－DGGE method was also applied to predict existence of kerosene－degrading bacteria and to monitor microflora change before and after bioremediation....

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site

池永 誠, 川内 智裕, 境 雅夫 土と微生物 70 (1), 23-34, 2016

...選択的に増幅した細菌遺伝子のPCR産物をDGGE解析に供試した結果，新たに多数のバンドが検出され，植物の部位を問わず，分子生態学的手法によって植物共存細菌の多様性を正しく評価する事が可能となった。また，新たに見出されたバンドの近縁細菌を決定したところ，既知の細菌に対して相同性の低い配列も存在し，植物には未だ分離されてない細菌が生息している事が示唆された。...

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site 被引用文献1件

Lin Wan-Rou, Wang Pi-Han, Chen Wen-Cheng, Lai Chao-Ming, Winder Richard Scott Ｍｉｃｒｏｂｅｓ　ａｎｄ　ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ 31 (1), 19-26, 2016

...Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) profiles indicated that soil fungal communities significantly differed among plots with 0% (control), 25%, and 50% tree thinning in the first 21 months post-thinning...

DOI Web Site Web Site ほか1件 参考文献58件

Dong Dian-Tao, Yamamura Shigeki, Amachi Seigo Ｍｉｃｒｏｂｅｓ　ａｎｄ　ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ 31 (1), 41-48, 2016

The impact of arsenite (As[III]) on the bacterial community structure and diversity in soil was determined by incubating soil slurries with 50, 500, and 5,000 μM As(III). As(III) was oxidized to …

DOI Web Site Web Site ほか1件 参考文献42件

Liu Dongyan, Tago Kanako, Hayatsu Masahito, Tokida Takeshi, Sakai Hidemitsu, Nakamura Hirofumi, Usui Yasuhiro, Hasegawa Toshihiro, Asakawa Susumu Ｍｉｃｒｏｂｅｓ　ａｎｄ　ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ 31 (3), 349-356, 2016

...nitrogen fertilization (LN) on methanogenic archaeal and methane-oxidizing bacterial community structures in a free-air CO₂ enrichment (FACE) experimental paddy field were investigated by PCR-DGGE...

DOI Web Site Web Site ほか1件 被引用文献4件 参考文献42件

Yamaguchi Nobuyasu, Baba Takashi, Ichijo Tomoaki, Himezawa Yuka, Enoki Kanami, Saraya Makoto, Li Pin-Fang, Nasu Masao Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ　＆　Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ　Ｂｕｌｌｅｔｉｎ 39 (1), 68-77, 2016

...Several viable bacteria, including intestinal bacteria, were found in Asian dust samples by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE)....

DOI Web Site Web Site ほか2件 被引用文献4件 参考文献40件

Ikenaga Makoto, Tabuchi Masakazu, Kawauchi Tomohiro, Sakai Masao Ｍｉｃｒｏｂｅｓ　ａｎｄ　ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ 31 (3), 339-348, 2016

...A denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) analysis displayed patterns that reached an acceptable level for investigating the community structures of plant–associated fungi using the LNA technique...

DOI Web Site Web Site ほか1件 被引用文献2件 参考文献59件

Rokunuzzaman Md, Ueda Yumiko, Chen Li, Tanaka Sota, Ohnishi Kouhei Ｍｉｃｒｏｂｅｓ　ａｎｄ　ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ 31 (2), 160-164, 2016

...The DGGE band patterns of each soil were similar. Based on pyrosequencing data, the richness and diversity of bacterial species were slightly higher in paddy fields than in other soils....

DOI Web Site Web Site ほか1件 被引用文献1件 参考文献31件

Liang Huipeng, Zhang An, Wu Zhengyun, Cheng Shupin, Yu Wenping, Zhang Wenxue Food Science and Technology Research 22 (5), 595-604, 2016

...Fifteen bands from DGGE profiles of lactic acid bacteria (LAB) were identified and four genera were detected. <i>Alkalibacterium</i> and <i>Lactobacillus</i> were dominant in all IMCP....

DOI Web Site 参考文献51件

Liang Huipeng, Zhang An, Wu Zhengyun, Liu Chaolan, Zhang Wenxue Food Science and Technology Research 22 (4), 467-475, 2016

...community in the fermentation process of Chinese homemade <i>paocai</i> (CHP), which was a traditional fermented vegetable food in China, was analyzed firstly by PCR-denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE...

DOI Web Site 参考文献53件

福田 和正, 小川 みどり, 谷口 初美, 齋藤 光正 Journal of UOEH 38 (3), 223-232, 2016

<p>1970年代に16S rRNA遺伝子の塩基配列に基づく細菌の系統的な生物種分類法が提唱されて以来，微生物を検出するため，従来の培養法に加え，培養法に依存しない分子生物学的手法が考案されてきた．その開発と普及は微生物研究に革命的な進歩をもたらし，従来の培養法では検出できない細菌の研究に大きく寄与している．蛍光 <i>in situ</i> …

DOI 機関リポジトリ Web Site ほか3件 参考文献39件

Shimura Yoichiro, Shoji Nobuo, Tanikawa Taichiro, Obayashi Tomoaki, Honda Jun, Tanaka Miyuki, Sasaki Yukiko, Fukushima Jun, Inamoto Tamio The Journal of Poultry Science 53 (2), 165-172, 2016

To determine the influence of media composition on <i>Salmonella </i>exclusion of Nurmi-type cultures, two and four types of cultures in the first and second trial, respectively, were prepared from …

DOI Web Site Web Site 参考文献28件

立藤 綾子, 松藤 康司 廃棄物資源循環学会研究発表会講演集 27 (0), 417-, 2016

...本報告では土壌還元化の促進技術として提案している「堆肥覆土」適用の有効性について、PCR-DGGE解析により得られた堆肥覆土適用焼却灰の微生物叢を真砂土覆土適用焼却灰の微生物叢と比較することによって評価した。また、焼却残渣の土壌還元化を評価する微生物指標について検討した。...

DOI

Chang, Young Cheol, Reddy, M. Venkateswar, Umemoto, Honoka, Sato, Yuki, Kang, Mi Hye, Yajima, Yuka, Kikuchi, Shintaro PLOS ONE 10 (12), e0145057-, 2015-12-28

...Results of T-RFLP were coincident with the DGGE analysis....

DOI HANDLE Web Site 参考文献43件

Madhusmita Dehingia, Kanchal Thangjam devi, Narayan C. Talukdar, Rupjyoti Talukdar, Nageshwar Reddy, Sharmila S. Mande, Manab Deka, Mojibur R. Khan Scientific Reports 5 (1), 18563-, 2015-12-22

...Fecal bacterial diversity was studied in fifteen tribal populations representing four geographic regions (Assam, Telangana, Manipur and Sikkim) by DGGE followed by NGS analysis on Illumina MiSeq platform...

DOI PDF Web Site 被引用文献1件

Qing Zhang, Baiyila Wu, Naoki Nishino, Xianguo Wang, Zhu Yu Animal Science Journal 87 (3), 389-397, 2015-12-21

...needlegrass (LN) and Chinese leymus (CL) during ensiling and subsequent exposure to air, silages were sampled and analyzed using culture‐based techniques and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE...

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件

細野, 真司, 高橋, 圭二, 新垣, 裕子, 八木, 健 千葉県畜産総合研究センター研究報告 (15) 15-21, 2015-11

...各個体における、増体の良し悪しの分類と腸内細菌叢を解析する変性剤濃度勾配ゲル電気泳動(DGGE)法のバンドパターン分類の調査により、増体が良い個体は、離乳前から離乳後にかけて徐々にバンドパターンが変化していく傾向が認められた。逆に増体が悪い個体は、極端な変化をみせるか変化に乏しいかのどちらかであることが判明し、ほとんど変化のなかった個体は下痢症を呈していた。...

日本農学文献記事索引 Web Site

O. Auguet, M. Pijuan, J. Batista, C. M. Borrego, O. Gutierrez Applied and Environmental Microbiology 81 (20), 7271-7280, 2015-10-15

...., quantitative PCR [qPCR], denaturing gradient gel electrophoresis [DGGE], and 16S rRNA gene pyrotag sequencing)....

DOI Web Site 被引用文献1件

Wael S. El-Sayed, Salama A. Ouf, Abdel-Aleam H. Mohamed Frontiers in Microbiology 6 2015-10-06

DOI 被引用文献1件

小林,和輝, 村山,晃一, 青柳,秀紀 日本生物工学会大会講演要旨集 67 138-, 2015-09-25

NDLデジタルコレクション 医中誌

南,純一, 中谷,剛, 坂上,吉一, 森,美穂 日本生物工学会大会講演要旨集 67 305-, 2015-09-25

NDLデジタルコレクション 医中誌

長谷川,智弘, 斉藤,諒, 村山,晃一, 青柳,秀紀 日本生物工学会大会講演要旨集 67 139-, 2015-09-25

NDLデジタルコレクション 医中誌

Makoto Ikenaga, Masakazu Tabuchi, Takuya Oyama, Isao Akagi, Masao Sakai Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 79 (9), 1556-1566, 2015-09-02

...Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) analysis displayed additional bacterial DGGE bands, the amplicons of which were prepared using the LNA oligonucleotides....

DOI PDF 被引用文献5件

Toru Fukano, Mitsuhiro Gomi, Yukihiko Osaki, Masaaki Morikawa Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 79 (7), 1207-1215, 2015-07-03

...It was found that the PCR-DGGE band pattern of 16S rRNA gene was dramatically changed after the third day and was not further changed until three weeks....

DOI PDF 被引用文献1件

Jie Liu, Yaoyao Yu, Zhang Cai, Mark Bartlam, Yingying Wang World Journal of Microbiology and Biotechnology 31 (9), 1387-1395, 2015-06-17

DOI PDF Web Site ほか1件 被引用文献1件

Annika M. E. Noreen, Sebastian Schmidt‐Roach, Peter L. Harrison, Madeleine J. H. van Oppen Journal of Biogeography 42 (9), 1639-1650, 2015-06-08

...The identity of the <jats:italic>Symbiodinium</jats:italic> was determined using denaturing gradient gel electrophoresis (<jats:styled-content style="fixed-case">DGGE</jats:styled-content>) analysis of...

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件

Rasit Asiloglu, Hiroki Honjo, Norikuni Saka, Susumu Asakawa, Jun Murase Soil Science and Plant Nutrition 61 (5), 761-768, 2015-06-03

DOI Web Site 被引用文献5件 参考文献39件

末澤, 保彦, 岡崎, 賢治, 木村, 功 研究報告 (15) 25-29, 2015-06

...そこで，複数の遺伝子を同時に解析できるPCR-DGGE解析法によるZ. rouxii complexの分類方法の開発を行い，D1，D2領域，ITS1及びITS2配列を解析することにより，それらの区別が可能となった。...

日本農学文献記事索引

Adrien Vigneron, Stéphane L'Haridon, Anne Godfroy, Erwan G. Roussel, Barry A. Cragg, R. John Parkes, Laurent Toffin Applied and Environmental Microbiology 81 (10), 3451-3459, 2015-05-15

...Analyses of denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) fingerprinting and reverse-transcribed PCR-amplified 16S rRNA sequences retrieved from these enrichments revealed the presence of active methylotrophic...

DOI Web Site 被引用文献2件

C. Dong, X. Bai, H. Sheng, L. Jiao, H. Zhou, Z. Shao Biogeosciences 12 (7), 2163-2177, 2015-04-13

...abovementioned bacteria in addition to Hahella, Oleispira, Oceanobacter and Hyphomonas occurred alternately as predominant members in the enrichment cultures from different sediments based on IHTS and PCR-DGGE...

DOI PDF 被引用文献1件

Xia Hu, Ming Li, Hui Chen Scientific Reports 5 (1), 2015-02-12

...investigate the fungal community structure present in the galleries and guts of <jats:italic>D. armandi</jats:italic> at different developmental stages using PCR-denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE...

DOI PDF Web Site 被引用文献1件

Elizabeth A. Rettedal, Volker S. Brözel MicrobiologyOpen 4 (2), 208-219, 2015-02-04

...The 16S <jats:styled-content style="fixed-case">rRNA</jats:styled-content> gene pools were characterized by <jats:styled-content style="fixed-case">DGGE</jats:styled-content> and pyrosequencing, and the...

DOI Web Site Web Site ほか1件 被引用文献1件

Zeng Taotao, Li Dong, Zeng Huiping, Xie Shuibo, Qiu Wenxin, Liu Yingjiu, Zhang Jie Water Science and Technology 71 (5), 725-733, 2015-01-19

...Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and fluorescence in situ hybridization were used to investigate treatment effects on the microbial community....

DOI PDF 被引用文献1件

Jialin Li, David B. Nedwell, Jessica Beddow, Alex J. Dumbrell, Boyd A. McKew, Emma L. Thorpe, Corinne Whitby Applied and Environmental Microbiology 81 (1), 159-165, 2015-01

...<jats:named-content content-type="genus-species">Nitrosomonas</jats:named-content> spp. were detected along the estuary by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) band sequence analysis...

DOI Web Site 被引用文献2件

Dashti Narjes, Ali Nedaa, Eliyas Mohamed, Khanafer Majida, Sorkhoh Naser A., Radwan Samir S. Ｍｉｃｒｏｂｅｓ　ａｎｄ　ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ 30 (1), 70-75, 2015

...A PCR-DGGE-based sequencing analysis of <i>nifH</i> genes revealed the common occurrence of the corresponding genes among all the strains tested....

DOI Web Site PubMed 参考文献26件

Chen Jing, Xie Ping, Lin Juan, He Jun, Zeng Cheng, Chen Jun Ｔｈｅ　Ｊｏｕｒｎａｌ　ｏｆ　Ｔｏｘｉｃｏｌｏｇｉｃａｌ　Ｓｃｉｅｎｃｅｓ 40 (4), 485-494, 2015

...Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) was employed to profile the shifts of microbes after MC-LR treatment in the jejuno-ileum, caecum and colon....

DOI Web Site Web Site ほか2件 参考文献56件

大槻 隆司, 花形 麻美, 増田 隆仁, 宇井 定春 日本水処理生物学会誌 51 (2), 37-47, 2015

...培養経過の各要素の変化の調査、フロックサイズの観察、走査型電子顕微鏡観察、PCR－DGGEとクローンシークエンスによる微生物相解析の結果から、NOL4はAS中の微生物細胞を保護する効果を有するが微生物群の構成種比には大きな影響を与えていないことが示された。さらに、AS中より単離したフェノール資化細菌HM2株のフェノール分解能力はNOL4添加により活性化されていることが明らかとなった。...

DOI Web Site Web Site 参考文献22件

Kobayashi Yuki, Hodoki Yoshikuni, Ohbayashi Kako, Okuda Noboru, Nakano Shin-ichi Plankton and Benthos Research 10 (1), 34-44, 2015

...The sequencing analysis of DGGE bands detected microcystin-degrading bacteria belonging to the α-proteobacteria as one of the dominant bacterial phylogenetic groups when <i>Microcystis </i>was the dominant...

DOI Web Site 参考文献40件

磯部 由香, 苅田 修一, 大竹 美沙希, 真部 真里子, 小寺 真実, 久保 加織 一般社団法人日本家政学会研究発表要旨集 67 (0), 198-, 2015

...そこで、PCR-DGGE法により熟成過程の微生物叢の変化について解析を行った。また、呈味成分の変化についても合わせて分析した。【方法】塩漬けふな及び滋賀大学教育学部実験室にて漬け込んだふなずしを2－180日に取り出し分析に用いた。各試料からDNAを抽出し、PCR-DGGE法により微生物叢を分析した。一部のバンドについては16S-rRNA解析により同定した。...

DOI

對馬 誠也 土と微生物 69 (2), 75-79, 2015

....,2012)からの土壌DNA抽出技術の開発や,農林水産省委託プロジェクト(通称,eDNAプロジェクト)で開発されたPCR-DGGE標準化手法の開発は大きな役割を果たしたと考える。こうした成果により,土壌病害では土壌DNA解析を診断項目として活用する研究が進められ,たとえばPCR-DGGE手法を活用したハクサイ黄化病の診断マニュアルが作られた。...

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site

安元 純, 廣瀬（安元） 美奈, 久手堅 剛, 宮城 雄次, 大城 要平, 聖川 健斗, 細野 高啓, 嶋田 純, 中野 拓治 地下水学会誌 57 (2), 153-169, 2015

本研究では，沖縄本島南部地域の琉球石灰岩帯水層において，地下水水質データと硝酸中の窒素及び酸素同位体比（δ¹⁵N_NO<b>₃</b>，δ¹⁸O_NO<b>₃</b>）を測定することで脱窒ポイントを推定し，PCR法を組み合わせた変性剤濃度勾配ゲル電気泳動法（以下，PCR…

DOI 機関リポジトリ HANDLE ほか1件 参考文献40件

MARUI Junichiro, BOULOM Sayvisene, PANTHAVEE Wanchai, MOMMA Mari, KUSUMOTO Ken-Ichi, NAKAHARA Kazuhiko, SAITO Masayoshi Bioscience of Microbiota, Food and Health 34 (2), 45-52, 2015

A bacterial community analysis, using a culture-independent method (polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis), detected 17 species of bacteria including species of the …

DOI Web Site 被引用文献2件 参考文献18件

若井 暁, 藤井 創太郎, 政成 美沙, 宮永 一彦, 丹治 保典, 三本木 至宏 Ｚａｉｒｙｏ‐ｔｏ‐Ｋａｎｋｙｏ 64 (12), 540-544, 2015

...微生物が関与する金属の腐食現象を微生物腐食と呼ぶ．これまでに，石油タンク底水を用いて実験室レベルでの腐食再現試験に成功し，DGGE解析によって微生物群集構造の変化が起こっていることを明らかにしてきたが，群集構造の詳細と腐食現象の関連付けが出来ていなかった．そこで，本研究では，次世代シーケンサを用いてタンク底水および培養・腐食試験液中の微生物群集構造の詳細を明らかにし，腐食現象と微生物群集構造の関連付...

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件 参考文献10件

長瀬 陽香, 丹羽 理恵子, 松下 裕子, 池田 健太郎, 山岸 菜穂, 串田 篤彦, 岡田 浩明, 吉田 重信, 對馬 誠也 日本植物病理学会報 81 (1), 9-21, 2015

...ハクサイ黄化病の発病程度と土壌の生物性との関連性を明らかにするため，群馬県内の発病程度の異なる圃場の非根圏土壌を経時的に採取し，変性剤濃度勾配ゲル電気泳動（PCR-DGGE）を用いて土壌の細菌相，糸状菌相および一般線虫相のShannon-Wienerの多様性指数（<i>H'</i>）ならびに黄化病菌（<i>Verticillium dahliae</i>および<i>V. longisporum</i...

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site 被引用文献1件 参考文献12件

Aya Miura, Jotaro Urabe Freshwater Biology 60 (4), 673-685, 2014-11-28

...test this hypothesis, we examined composition and richness in the Natori River, Japan, using <jats:styled-content style="fixed-case">PCR</jats:styled-content>‐<jats:styled-content style="fixed-case">DGGE...

DOI Web Site Web Site 参考文献53件

Gabriela Martínez de la Escalera, Dermot Antoniades, Sylvia Bonilla, Claudia Piccini Molecular Ecology 23 (23), 5791-5802, 2014-11-21

...Samples corresponding to ~1846, 1852, 2000 and 2007 AD were selected to perform denaturing gradient gel electrophoresis (<jats:styled-content style="fixed-case">DGGE</jats:styled-content>) analysis of...

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件

入澤, 友啓, 野口, 治子, 辻井, 良政, 内野, 昌孝, 高野, 克己 日本食品保蔵科学会誌 40 (6), 285-290, 2014-11

...本研究ではPCR-DGGE法を応用し，複数のイネ科原材料を同時に検出する方法の確立を試みた。まずはイネ科植物を特異的に検出する標的遺伝子としてmatK遺伝子を選択し，matK 792F1GCとmatK 979R1のプライマー構築した。さらにDGGE法を用いることにより，6種イネ科原材料を一度に判別すことができることがわかった。...

日本農学文献記事索引 Web Site

Daisuke Tanaka, Yohei Terada, Takuya Nakashima, Akihiro Sakatoku, Shogo Nakamura Aerobiologia 31 (2), 143-157, 2014-10-28

DOI PDF Web Site ほか1件 被引用文献4件 参考文献54件

諸,人誌, 國頭,恭, 齋藤,龍司, 矢口,直輝, 大塚,重人, 長岡,一成 日本微生物生態学会講演要旨集 2014 80-, 2014-10-16

NDLデジタルコレクション

Hong Li, Rui Guan, Jinghua Sun, Benxiang Hou Journal of Periodontology 85 (10), 1442-1449, 2014-10

...DNA was extracted for polymerase chain reaction–based denaturing gradient gel electrophoresis (PCR‐DGGE), cloning, and sequence analysis....

DOI Web Site Web Site 被引用文献2件

Liqiang Zhang, Chongde Wu, Xiaofei Ding, Jia Zheng, Rongqing Zhou World Journal of Microbiology and Biotechnology 30 (12), 3055-3063, 2014-09-06

DOI PDF Web Site ほか1件 被引用文献3件

Baiyila Wu, Qing Zhang, Zhongkuan Liu, Zhu Yu, Naoki Nishino Grassland Science 60 (4), 247-251, 2014-09-03

...Bacterial community was determined by denaturing gradient gel electrophoresis (<jats:styled-content style="fixed-case">DGGE</jats:styled-content>)....

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件 参考文献12件

Soil Science and Plant Nutrition 60 (5), 746-748, 2014-09-03

DOI Web Site

入澤, 友啓, 辻井, 良政, 岡, 大貴, 野口, 治子, 内野, 昌孝, 高野, 克己 日本食品保蔵科学会誌 40 (5), 241-246, 2014-09

...さらにPCR-DGGE法を用いて変敗した米飯から遺伝子レベルでの細菌の検出を行った。その結果，培養法と同様にGeobacillus属細菌が検出された。...

日本農学文献記事索引 Web Site

Ágnes Bárány, Tibor Szili-Kovács, Gergely Krett, Anna Füzy, Károly Márialigeti, Andrea Borsodi Acta Microbiologica et Immunologica Hungarica 61 (3), 347-361, 2014-09-01

...The number of bands in DGGE gels was related to the metabolic activity, and positively correlated with soil humus content, but negatively with soil salt content....

DOI XML XML 被引用文献1件

Supatjaree Ruengsomwong, Yuki Korenori, Naoshige Sakamoto, Bhusita Wannissorn, Jiro Nakayama, Sunee Nitisinprasert Journal of Microbiology and Biotechnology 24 (8), 1026-1033, 2014-08-28

DOI 被引用文献2件

Chatchanit Arif, Camille Daniels, Till Bayer, Eulalia Banguera‐Hinestroza, Adrian Barbrook, Christopher J. Howe, Todd C. LaJeunesse, Christian R. Voolstra Molecular Ecology 23 (17), 4418-4433, 2014-08-18

...Pyrosequencing data were consistent with more traditional denaturing gradient gel electrophoresis (<jats:styled-content style="fixed-case">DGGE</jats:styled-content>) approaches to the screening of <jats...

DOI Web Site Web Site ほか1件 被引用文献3件

高橋,将人, 青柳,秀紀 日本生物工学会大会講演要旨集 66 248-, 2014-08-05

NDLデジタルコレクション

斉藤,諒, 村山,晃一, 今泉,卓三, 後藤,直美, 青柳,秀紀 日本生物工学会大会講演要旨集 66 248-, 2014-08-05

NDLデジタルコレクション

Xiaofei Ding, Chongde Wu, Jun Huang, Hui Li, Rongqing Zhou Food Research International 62 1047-1053, 2014-08

DOI Web Site Web Site 被引用文献4件

E. Nakakihara, R. Ikemoto-Yamamoto, R. Honda, S. Ohtsuki, M. Takano, Y. Suetsugu, H. Watanabe Water Science and Technology 70 (5), 819-827, 2014-07-02

...The Shannon index of DGGE profiles indicated that bacterial diversity increased with the addition of softened rice straw....

DOI PDF 被引用文献7件

入澤, 友啓, 野口, 治子, 内野, 昌孝, 高野, 克己 日本食品保蔵科学会誌 40 (4), 171-176, 2014-07

...これらの微生物叢についてPCR-DGGE法を用いて検討したところ，発酵中の微生物叢は，2-3種の一般細菌およびカビ・酵母と，約10種程度の種の乳酸菌により構成されていることが示唆された。また，屋外での発酵の前の一時貯蔵(前発酵)の段階で，多くの生菌が確認され，前発酵のPCR-DGGEパターンは発酵が進んでも比較的保存されていた。...

日本農学文献記事索引 Web Site

Xiao-Long Hu, Hai-Yan Wang, Qun Wu, Yan Xu Bioresource Technology 163 40-47, 2014-07

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件

Jorge Arreola‐Vargas, Felipe Alatriste‐Mondragón, Lourdes B. Celis, Elías Razo‐Flores, Alberto López‐López, Hugo O. Méndez‐Acosta Journal of Chemical Technology & Biotechnology 90 (6), 1062-1069, 2014-05-27

...Finally, <jats:styled-content style="fixed-case">PCR‐DGGE</jats:styled-content> analysis revealed that bacteria from <jats:italic>Clostridium</jats:italic> genus were the putative responsible for hydrogen...

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件

Lili Cheng, Weifeng Lin, Pan Li, Jianfei Huang, Lixin Luo International Journal of Food Science & Technology 49 (11), 2499-2505, 2014-05-16

...The <jats:styled-content style="fixed-case">PCR</jats:styled-content>‐denaturing gradient gel electrophoresis (<jats:styled-content style="fixed-case">DGGE</jats:styled-content>) profiles showed that four...

DOI Web Site 被引用文献1件

Yihong Li, Deepak Saxena, Zhou Chen, Gaoxia Liu, Willam R. Abrams, Joan A. Phelan, Robert G. Norman, Gene S. Fisch, Patricia M. Corby, Floyd Dewhirst, Bruce J. Paster, Alexis S. Kokaras, Daniel Malamud Journal of Clinical Microbiology 52 (5), 1400-1411, 2014-05

...Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), which compared the overall microbial profiles, showed distinct fingerprinting profiles for each group....

DOI Web Site 被引用文献1件

Zheng Ji, Xiaochang C. Wang, Limei Xu, Chongmiao Zhang, Naoyuki Funamizu, Satoshi Okabe, Daisuke Sano Food and Environmental Virology 6 (2), 99-109, 2014-04-09

DOI PDF Web Site ほか1件 被引用文献1件 参考文献48件

伊藤, 謙, 赤峰, 知奈美, 河田, 和, 志村, 洋一郎, 稲元, 民夫, 喜多, 一美 日本家禽学会誌 51 (1), 1-5, 2014-04

...盲腸内容物から総DNAを抽出し，細菌に普遍的に存在する16S rRNA遺伝子をPCR-DGGE(変性剤濃度勾配ゲル電気泳動)にて増幅・分離した。分離されたDNAバンドの光学強度を定量解析ソフトを用いて測定した。その結果，プロポリス残渣添加区における1本のバンドの光学強度が有意に低くなった。有意差の認められたDNAバンドの塩基配列を調べたところRuminococcaceae科と同定された。...

日本農学文献記事索引 Web Site

Kurachi, Kumiko, Hosokawa, Reia, Takahashi, Marina, Okuyama, Hidetoshi International Biodeterioration & Biodegradation 88 77-82, 2014-03

...PCR-denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) that targeted the V3 regions of 16S rRNA gene sequences showed that the DGGE band profiles of principal bacteria were significantly different between...

HANDLE

Yoichi Oba, Taiki Futagami, Seigo Amachi Journal of bioscience and bioengineering 117 (3), 310-317, 2014-03

DOI Web Site Web Site ほか1件 被引用文献3件 参考文献47件

Hang Lv, Xiao Si Su, Yu Ling Zhang Advanced Materials Research 889-890 1621-1624, 2014-02

...<jats:p>The sulfate reducing bacterium (SRB) diversity of all samples were analyzed by PCR-DGGE technology and the Shannon-Wiener indexes (1.004-3.665) of all the samples were calculated....

DOI PDF 被引用文献1件

Periyasamy Sivagurunathan, Biswarup Sen, Chiu-Yue Lin Journal of bioscience and bioengineering 117 (2), 222-228, 2014-02

DOI Web Site Web Site ほか1件 被引用文献5件 参考文献30件

J. F. Jiang, X. M. Song, J. L. Wu, Y. Q. Jiang Journal of Animal Physiology and Animal Nutrition 98 (6), 1039-1046, 2014-01-27

...Polymerase chain reaction denaturing gradient gel electrophoresis (<jats:styled-content style="fixed-case">PCR</jats:styled-content>‐<jats:styled-content style="fixed-case">DGGE</jats:styled-content>)...

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件

JD Grattepanche, LF Santoferrara, J Andrade, AM Oliverio, GB McManus, LA Katz Aquatic Microbial Ecology 71 (3), 211-221, 2014-01-23

DOI PDF 被引用文献1件

Mohd Zainudin, Mohd Huzairi, Hassan, Mohd Ali, Shah, Umi Kalsom Md, Abdullah, Norhani, Tokura, Mitsunori, Yasueda, Hisashi, 白井, 義人, Sakai, Kenji, Samsu Baharuddin, Azhari BioResources 9 (1), 316-335, 2014

...A drastic change in the bacterial community structure and diversity throughout the composting process was clearly observed using PCR-DGGE banding patterns....

機関リポジトリ HANDLE

J. Killer, S. Dubná, I. Sedláček, P. Švec International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 64 (Pt_1), 152-157, 2014-01-01

...A PCR–DGGE method could detect the sequence of the 16S rRNA gene of strain R4B<jats:sup>T</jats:sup> at different developmental stages of honeybees occurring in two different locations in the Czech Republic...

DOI Web Site 被引用文献3件

Fayyaz Ali Shah, Qaisar Mahmood, Mohammad Maroof Shah, Arshid Pervez, Saeed Ahmad Asad The Scientific World Journal 2014 1-21, 2014

...The molecular techniques such as DGGE (denaturing gradient gel electrophoresis) utilized for dynamic changes in microbial communities and FISH (fluorescent<jats:italic>in situ</jats:italic>hybridization...

DOI PDF XML 被引用文献1件

Gopalakrishnan Kumar, Chiu-Yue Lin The Scientific World Journal 2014 1-9, 2014

...PCR-DGGE analysis revealed that combination of celluloytic and fermentative bacteria were present in the hydrogen producing ASBR.</jats:p>...

DOI PDF XML 被引用文献1件

池田 順一, 福永 亜矢子, 須賀 有子, 伊藤 陽子 土と微生物 68 (2), 83-90, 2014

ドレンベッドにおいて,ペレット牛糞堆肥,イナワラおよび化成肥料NN604を組み合わせて施用する8通りの処理区を設け,コマツナを栽培した後,その土壌について,細菌および糸状菌の多様性を調べたところ,細菌・糸状菌とも資材・肥料の組合せに対してほぼ同様の傾向を示し,牛糞堆肥+イナワラ区,イナワラ+化成肥料区,牛糞堆肥+イナワラ+化成肥料区で多様性が高かった。また,微生物バイオマスの指標である抽出DNA…

DOI 日本農学文献記事索引 Web Site

Murase Jun, Takenouchi Yuriko, Iwasaki Kazufumi, Kimura Makoto Ｍｉｃｒｏｂｅｓ　ａｎｄ　ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ 29 (1), 74-81, 2014

...The eukaryotic microbial community composition, which was either present or potentially active in the soils, was analyzed using denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) targeting the 18S rRNA gene...

DOI Web Site Web Site ほか1件 被引用文献8件 参考文献38件

Ikenaga Makoto, Sakai Masao Ｍｉｃｒｏｂｅｓ　ａｎｄ　ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ 29 (3), 286-295, 2014

...Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) analysis revealed that conventional amplification without LNA oligonucleotides predominantly generated DGGE bands from mitochondria and plastid genes with...

DOI Web Site Web Site ほか1件 被引用文献6件 参考文献45件

肥後 昌男, 松田 侑也, 市田 美緒, 磯部 勝孝, 鳥越 洋一 日本土壌肥料学会講演要旨集 60 (0), 269-, 2014

DOI

Li Shengjie, Chen Tingtao, Dong Suqin, Xiong Yonghua, Wei Hua, Xu Feng Food Science and Technology Research 20 (2), 459-467, 2014

...To investigate the effect of RA on the changes of microbial diversity in animal intestinal tract, the viable cell count and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) method were used to monitor the...

DOI 参考文献34件

THAPA CHHETRI Rajan, SUZUKI Ichiro, FUJITA Takuya, TAKEDA Minoru, KOIZUMI Jun-ichi, FUJIKAWA Yoko, MINAMI Atushi, HAMASAKI Tatsuhide, SUGAHARA Masataka Journal of Water and Environment Technology 12 (2), 135-149, 2014

...PCR-based denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) of bacterial 16S ribosomal RNA (rRNA) genes represented at least 6 dominant signals and many weak signals....

DOI Web Site 参考文献25件

TSUSHIMA Ikuo, MICHINAKA Atsuko, MATSUHASHI Manabu, YAMASHITA Hiromasa, OKAMOTO Seiichiro Journal of Water and Environment Technology 12 (2), 191-199, 2014

Nitrous oxide, which has 310 times the greenhouse effect of carbon dioxide, is known to be emitted from wastewater treatment processes. However, the state of emissions at actual plants and the …

DOI Web Site 被引用文献4件 参考文献15件

Vasquez Juan Esteban, Nakasaki Kiyohiko 廃棄物資源循環学会研究発表会講演集 25 (0), 577-, 2014

...Samples of granule were taken periodically and DGGE analysis was conducted. The sequences of different bands were determined to identify the main bacteria and archaea communities....

DOI

鈴木 崇司, 多田 千佳 バイオマス科学会議発表論文集 9 (0), 174-175, 2014

...Methanogenic communities attached on the each carrier were analyzed using PCR-denaturing gradient gel electrophoresis (PCR-DGGE) analysis....

DOI

藤澤 倫彦 日本細菌学雑誌 69 (2), 331-348, 2014

健常なヒトや動物の腸内には多種多様な細菌が存在している。これら細菌の生態や機能についての検討を行うに当たっては精度の高い検索法を用いる必要がある。現在まで，これら腸内菌叢を検索するための非選択培地や種々の選択培地，ロールチューブ法，嫌気性グローブボックス，plate-in-bottle法といった腸内に優勢に存在する高度嫌気性細菌検出のための手段が開発されてきた。今日広く利用されているプレバイオテ…

DOI Web Site PubMed ほか1件 被引用文献1件 参考文献62件

渡邊 誠幸, 藤田 啓子, 中川 美幸, 岡田 比斗志 紙パ技協誌 68 (4), 440-446, 2014

...遺伝子解析（PCR―DGGE解析）から，他工場の排水を処理している配合汚泥中で，高性能汚泥由来の細菌は生存していることを確認できた。しかし，遺伝子解析は定量性が乏しいために配合汚泥の菌叢がどちらの汚泥に近いかを判断するのは困難である。そこで，汚泥の資化性が菌叢に影響されることを利用して，資化性解析（BIOLOG法）により菌叢の類似性を間接的かつ網羅的に定量することを試みた。...

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寺原 猛, 山口 貴大, 山田 勝久, 小林 竹志, 今田 千秋 海洋深層水研究 15 (1), 11-17, 2014

DOI Web Site

諸 人誌, 國頭 恭, 齋藤 龍司, 矢口 直輝, 大塚 重人, 長岡 一成 土と微生物 68 (2), 101-, 2014

DOI

Yamamoto Shuji, Suzuki Kei, Araki Yoko, Mochihara Hiroki, Hosokawa Tetsuya, Kubota Hiroko, Chiba Yusuke, Rubaba Owen, Tashiro Yosuke, Futamata Hiroyuki Ｍｉｃｒｏｂｅｓ　ａｎｄ　ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔｓ 29 (2), 145-153, 2014

...Multidimensional scaling analyses based on DGGE profiles revealed that bacterial communities in the organic waste-decomposing solution fluctuated and had no dynamic equilibrium....

DOI Web Site Web Site ほか1件 被引用文献5件 参考文献54件

WANG Shuai, GUO Lihong, SENEVIRATNE Chaminda Jayampath, HUANG Bo, HAN Jianmin, PENG Lei, LIU Xiaodi, ZHANG Chengfei Dental Materials Journal 33 (3), 325-331, 2014

...Results of DGGE analysis suggested that glass-ionomer cement was the best material of choice in terms of suppressing bacterial phylotypes in biofilms....

DOI Web Site PubMed ほか1件 参考文献31件

Kita Kazumi, R. Ken Ito, Akamine Chinami, Kawada Wataru, Shimura Yoichiro, Inamoto Tamio The Journal of Poultry Science 51 (3), 275-280, 2014

...To indentify the bacterial diversity, denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) was applied, and the optical intensity of DGGE bands was determined....

DOI Web Site Web Site 参考文献30件

金子 命, 保原 達, 岡本 英竜 日本森林学会大会発表データベース 125 (0), 367-, 2014

...そこで本研究では、エゾシカの植生撹乱が土壌微生物やそれらを取り巻く土壌環境に対してどのような影響を与えるのかを明らかにするため、土壌微生物群集構造をDNAで解析するPCR-DGGE法と土壌の各種化学分析を行うこととした。【方法】中島島内にて、2つの保護柵内外でサンプルを採取し、それらのサンプルを用いて各種化学分析、PCR-DGGEを行った。...

DOI

李 哲揆, 馬場 保徳, 福田 康弘, 多田 千佳, 中井 裕 バイオマス科学会議発表論文集 9 (0), 176-177, 2014

...Microbial communities analyzed by PCR-DGGE method showed that bacterial communities were not changed during the incubation period....

DOI

入澤 友啓, 野口 治子, 辻井 良政, 内野 昌孝, 髙野 克己 日本食品保蔵科学会誌 40 (6), 285-290, 2014

...For this, we used polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis (PCR-DGGE). The primer set was evaluated using agarose gel electrophoresis and DGGE....

DOI Web Site 参考文献1件

入澤 友啓, 辻井 良政, 岡 大貴, 野口 治子, 内野 昌孝, 髙野 克己 日本食品保蔵科学会誌 40 (5), 241-246, 2014

...Contaminating microorganisms in the cooked rice were identified by PCR using bacterial universal primers and <i>G. thermoleovorans</i> was only detected using PCR-DGGE....

DOI Web Site 参考文献8件

角川 幸治, 藤本 知也, 山田 裕亮, 辻本 直樹, 宮森 亮祐, 庄林 愛, 土屋 義信 美味技術学会誌 12 (2), 10-17, 2013-12-31

デンマークオリジナルサワー種を用いて日本国内で種継ぎを行い，デンマークオリジナルサワー種と日本で植え継いだサワー種に含まれる乳酸菌について，菌叢変化が起こるかどうか解析を行った。解析の結果，デンマークオリジナルサワー種は，小麦粉タイプ及びライ麦粉タイプのいずれについても<i>Lactobacillus sanfranciscensis</i> …

DOI Web Site

Danilo Ercolini, Erica Pontonio, Francesca De Filippis, Fabio Minervini, Antonietta La Storia, Marco Gobbetti, Raffaella Di Cagno Applied and Environmental Microbiology 79 (24), 7827-7836, 2013-12-15

...As shown by PCR-denaturing gradient gel electrophoresis (PCR-DGGE) analysis, <jats:named-content content-type="genus-species">Saccharomyces cerevisiae</jats:named-content> dominated...

DOI Web Site 被引用文献4件

松下,裕子, 包,智華, 久原,哲, 森本,晶, 長瀬,陽香, 吉田,重信, 對馬,誠也 日本微生物生態学会講演要旨集 108-, 2013-11-17

NDLデジタルコレクション

大久保,智司, 斎藤,健志, 濱本,昌一郎, 大西,純一, 小松,登志子 日本微生物生態学会講演要旨集 118-, 2013-11-17

NDLデジタルコレクション

佐藤,圭, 寺田,陽平, 酒徳,昭宏, 中村,省吾, 田中,大祐 日本微生物生態学会講演要旨集 120-, 2013-11-17

NDLデジタルコレクション

小野,翔太, 本田,一馬, 大村,大, 澤口,亜美, 坂本,一憲, 鮫島(齋藤),玲子, 安藤,昭一, 齋藤,明広 日本微生物生態学会講演要旨集 109-, 2013-11-17

NDLデジタルコレクション

鮫島(齋藤),玲子, 本田,一馬 日本微生物生態学会講演要旨集 105-, 2013-11-17

NDLデジタルコレクション

奥西,将之, 森田,康敬, 樋口,能士, 松田,知成, 前田,広大 日本微生物生態学会講演要旨集 86-, 2013-11-17

NDLデジタルコレクション

ASILOGLU,Rasit M., Murase,Jun 日本微生物生態学会講演要旨集 109-, 2013-11-17

NDLデジタルコレクション

Jia Zheng, Ru Liang, Liqiang Zhang, Chongde Wu, Rongqing Zhou, Xuepin Liao Food Research International 54 (1), 660-666, 2013-11

DOI Web Site Web Site 被引用文献2件

Marc Veillette, Luke D. Knibbs, Ariane Pelletier, Remi Charlebois, Pascale Blais Lecours, Congrong He, Lidia Morawska, Caroline Duchaine Applied and Environmental Microbiology 79 (20), 6331-6336, 2013-10-15

...Bacterial diversity was also analyzed using denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), image analysis, and band sequencing....

DOI Web Site 被引用文献1件

A.. Hayatdavoudi, N.. Chegenizadeh, A.. Chistoserdov, F.. Boukadi, R.. Bajpai Day 3 Wed, October 02, 2013 2013-09-30

...Electrophoresis of total DNA isolated from oil, (5) PCR amplification of 16S rRNA gene fragment from DNA isolated from oil, (6) Running gel on the PCR product, (7) Running Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE...

DOI PDF 被引用文献2件

Xiao-Fei Ding, Chong-De Wu, Li-Qiang Zhang, Jia Zheng, Rong-Qing Zhou World Journal of Microbiology and Biotechnology 30 (2), 605-612, 2013-09-13

DOI PDF Web Site ほか1件 被引用文献1件

Maki, Teruya, Kobayashi, Fumihisa, Yamada, Maromu, Hasegawa, Hiroshi, Iwasaka, Yasunobu Aerobiologia 29 (3), 341-354, 2013-09-01

...DGGE analysis revealed that the amended cultures were dominated by Bacillus subtilis, and the isolates obtained from the amended cultures were identical to B. subtilis....

DOI 機関リポジトリ 機関リポジトリ ほか3件 被引用文献3件 参考文献34件

Outi Priha, Mari Nyyssönen, Malin Bomberg, Arja Laitila, Jaakko Simell, Anu Kapanen, Riikka Juvonen Applied and Environmental Microbiology 79 (17), 5186-5196, 2013-09

...DGGE, on the other hand, included casting of gradient gels, and several rounds of rerunning, excising, and reamplification of bands were needed for successful sequencing....

DOI Web Site 被引用文献1件

Maryeimy Varon‐Lopez, Armando Cavalcante Franco Dias, Cristiane Cipolla Fasanella, Ademir Durrer, Itamar Soares Melo, Eiko Eurya Kuramae, Fernando Dini Andreote Environmental Microbiology 16 (3), 845-855, 2013-08-27

...The PCR‐DGGE patterns analysed by <jats:styled-content style="fixed-case">N</jats:styled-content>onmetric <jats:styled-content style="fixed-case">M</jats:styled-content>ultidimensional <jats:styled-content...

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件

Daniel J. Thornhill, Yu Xiang, D. Tye Pettay, Min Zhong, Scott R. Santos Molecular Ecology 22 (17), 4499-4515, 2013-08-27

...jats:styled-content style="fixed-case">RFLP</jats:styled-content>,<jats:italic> <jats:styled-content style="fixed-case">ITS</jats:styled-content>2</jats:italic>‐<jats:styled-content style="fixed-case">DGGE...

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件

高橋,将人, 青柳,秀紀 日本生物工学会大会講演要旨集 65 144-, 2013-08-25

NDLデジタルコレクション

山下(鮫島),結香, 渡部,貴志, 小板橋,基夫, 吉田,重信, 藤井,毅, 北本,宏子 日本生物工学会大会講演要旨集 65 214-, 2013-08-25

NDLデジタルコレクション

E. F. A. Mac Conell, P. G. S. Almeida, A. M. Zerbini, E. M. F. Brandt, J. C. Araújo, C. A. L. Chernicharo Water Science and Technology 68 (3), 650-657, 2013-08-01

...ammonia-oxidizing bacterial (AOB) population dynamics were examined in a new sponge-based trickling filter (TF) post-upflow anaerobic sludge blanket (UASB) reactor by denaturating gradient gel electrophoresis (DGGE...

DOI PDF 被引用文献1件

A. Prabhakar, A. H. Bishop World Journal of Microbiology and Biotechnology 30 (1), 153-161, 2013-07-17

DOI PDF Web Site ほか1件 被引用文献1件

Yeun Hong, Hee-Seok Yang, Jingmei Li, Seon-Kyeong Han, Hae-Choon Chang, Hae-Yeong Kim Journal of the Science of Food and Agriculture 94 (2), 296-300, 2013-07-17

DOI Web Site Web Site 被引用文献2件

Lilach Iasur-Kruh, Phyllis G. Weintraub, Netta Mozes-Daube, Wyatt E. Robinson, Steve J. Perlman, Einat Zchori-Fein Applied and Environmental Microbiology 79 (14), 4246-4252, 2013-07-15

...Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and pyrosequencing were used to survey the main symbionts of <jats:named-content xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" content-type="genus-species...

DOI Web Site 被引用文献1件

A. J. Park, J. Collins, P. A. Blennerhassett, J. E. Ghia, E. F. Verdu, P. Bercik, S. M. Collins Neurogastroenterology & Motility 25 (9), 733-, 2013-06-17

...Microbiota profiles were obtained using denaturing gradient gel electrophoresis (<jats:styled-content style="fixed-case">DGGE</jats:styled-content>)....

DOI Web Site Web Site ほか1件 被引用文献5件

R. M. Petri, T. Schwaiger, G. B. Penner, K. A. Beauchemin, R. J. Forster, J. J. McKinnon, T. A. McAllister Applied and Environmental Microbiology 79 (12), 3744-3755, 2013-06-15

...Using denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE), quantitative real-time PCR (qPCR), and pyrosequencing of the V3 hypervariable coding region of 16S rRNA, epimural bacterial communities of 8 cattle...

DOI Web Site 被引用文献2件

Johanna Laybourn‐Parry, Alexandre M. Anesio, Nanette Madan, Christin Säwström Freshwater Biology 58 (7), 1484-1493, 2013-04-28

...<jats:styled-content style="fixed-case">Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE)</jats:styled-content> analysis of the bacterial community was also undertaken to investigate the potential relationship...

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件

Kathleen Terpend, Sam Possemiers, David Daguet, Massimo Marzorati Environmental Microbiology Reports 5 (4), 595-603, 2013-04-17

...<jats:styled-content style="fixed-case">DGGE</jats:styled-content> and <jats:styled-content style="fixed-case">qPCR</jats:styled-content> analyses confirmed that the main modulation of the microbiota by...

DOI Web Site Web Site 被引用文献6件

Alberto Bressan, Kathryn L. Mulligan Environmental Microbiology Reports 5 (4), 499-505, 2013-04-15

...Through light microscopy observations, <jats:styled-content style="fixed-case">DGGE PCR</jats:styled-content> and <jats:styled-content style="fixed-case">FISH</jats:styled-content> analysis, we examined...

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Yun Hou, Zheng Ma, Shengzhang Dong, Yolanda H. Chen, Xiaoping Yu Current Microbiology 67 (3), 263-270, 2013-04-03

DOI PDF Web Site ほか1件 被引用文献1件

Hongtao Li, Xiuhong Xu, Huihai Chen, Ying Zhang, Jie Xu, Jing Wang, Xinying Lu Bioresource Technology 134 51-58, 2013-04

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件

Ingrid Bakke, Jorunn Skjermo, Tu Anh Vo, Olav Vadstein Environmental Microbiology Reports 5 (4), 537-548, 2013-03-14

...The microbial communities were investigated for water, live feed and individual larvae using a <jats:styled-content style="fixed-case">PCR</jats:styled-content>/<jats:styled-content style="fixed-case">DGGE...

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竹下, 美保子, 福原, 絵里子, 荒木, 雅登, 尾上, 武, 小山, 太 福岡県農業総合試験場研究報告 (32) 48-51, 2013-03

日本農学文献記事索引 Web Site

Paola Dolci, Simona Zenato, Rita Pramotton, Andrea Barmaz, Valentina Alessandria, Kalliopi Rantsiou, Luca Cocolin International Journal of Food Microbiology 162 (1), 8-12, 2013-03

DOI Web Site Web Site 被引用文献1件

Giuseppe D'Argenio, Rita Cariello, Concetta Tuccillo, Giovanna Mazzone, Alessandro Federico, Annalisa Funaro, Laura De Magistris, Enzo Grossi, Maria L. Callegari, Marilena Chirico, Nicola Caporaso, Marco Romano, Lorenzo Morelli, Carmela Loguercio Liver International 33 (5), 687-697, 2013-03

...<jats:styled-content style="fixed-case">DGGE</jats:styled-content> analysis of faecal samples revealed that <jats:styled-content style="fixed-case"><jats:roman>CCl</jats:roman></jats:styled-content><jats...

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