複数の機能ドメインを持つタンパク質を対象とした相同性検索ツールMDHMMERの改良

• 松井藤五郎

• 鷲見晃一

抄録

筆者らは，これまで，プロファイルHMMに基づく相同性検索ツールHMMERを複数の機能ドメインに拡張したMDHMMERを開発してきた．MDHMMERは，複数の機能ドメインを持つタンパク質を検索できる点で優れているが，従来のHMMERに比べて検索精度が下がるという問題が生じていた．本論文では，この原因について述べ，これを解決する方法を示す．また，改良したツールによる実験結果を示す．

収録刊行物

• 第75回全国大会講演論文集

  第75回全国大会講演論文集 2013 (1), 547-548, 2013-03-06

キーワード

• コンピュータと人間社会

詳細情報

• CRID: 1050011097159723008
• NII論文ID: 170000092183
• NII書誌ID: AN00349328
• Web Site: http://id.nii.ac.jp/1001/00112175/
• 本文言語コード: ja
• 資料種別: conference paper
• データソース種別:
  • IRDB
  • CiNii Articles