大規模な化合物データベースからの類似化合物探索手法

• 河村, 元

• 瀬尾, 茂人

• 竹中, 要一

• 松田, 秀雄

書誌事項

タイトル別名

• A Search Method for Similar Compounds in Very Large Compound Database

抄録

タンパク質,化合物データベース等を用いて創薬のための化合物探索を行う際には,複数の大規模な創薬関連データベースを探索しなければならない.しかしながら,データベースの容量が膨大であるため単純に検索すると組合せ爆発を起こす恐れがある.そこで,本研究では,複数の創薬関連データベースを用いて,ターゲットタンパク質から相互作用する化合物を,組合せ爆発を抑えながら探索する手法を提案する.具体的には,ターゲットタンパク質から相同なタンパク質集合を探索し,相互作用情報と化合物探索手法によって,相互作用する化合物を推定する.本手法を既知のタンパク質・タンパク質-化合物相互作用,化合物のデータベース群に対して評価実験を行い,有用性を示す.

収録刊行物

• 全国大会講演論文集

  全国大会講演論文集 第70回 (「情報爆発」時代に向けた新しいIT技術基盤), 233-234, 2008-03-13

キーワード

• 化合物
• データベース
• 化合物探索
• Random Forest
• proximity measure

詳細情報

• CRID: 1050292572116271872
• NII論文ID: 110006863964
• NII書誌ID: AN00349328
• Web Site: http://id.nii.ac.jp/1001/00138450/
• 本文言語コード: ja
• 資料種別: conference paper
• データソース種別:
  • IRDB
  • CiNii Articles