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次世代シークエンサー : 目的別アドバンストメソッド

菅野純夫, 鈴木穣監修

(細胞工学, 別冊)

学研メディカル秀潤社 , 学研マーケティング (発売), 2012.9

タイトル読み

ジセダイ シークエンサー : モクテキベツ アドバンスト メソッド

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注記

文献: 論末

収録内容

  • 次世代シークエンサーのシークエンシング原理 / 豊田敦, 藤山秋佐夫 [執筆]
  • NGS購入ガイド (必要なもの) / 近藤直人 [執筆]
  • データ解析のためのコンピュータ環境 / 笠原雅弘 [執筆]
  • 用語解説 / 金井昭教 [執筆]
  • パーソナルゲノムリシークエンス / 森下真一 [執筆]
  • ターゲットリシークエンシングの具体例 : 遺伝子診断応用を目指したHLAタイピング技術 / 細道一善, 井ノ上逸朗 [執筆]
  • 全エクソンリシークエンシング / 土原一哉, 松島洸達, 三牧幸代 [執筆]
  • RNA-seo (IncRNAも含めて) / 松本京子, 鈴木穣 [執筆]
  • 転写開始点データ解析 (TSS-360を中心に) / 山下理宇 [執筆]
  • 網羅的プロモーター解析 : イルミナシークエンサーを用いた非増幅CAGE法 / 伊藤昌可, Timo Lassmann, 河合純 [執筆]
  • ゲノムワイドなRNA分解測定 / 秋光僑佳 [執筆]
  • 次世代シークエンサーを用いた de novo RNA-segによる遺伝子配列・構造解析 / 伊藤武彦 [執筆]
  • 細菌ゲノム / 小椋義俊, 林哲也 [執筆]
  • 第二世代シークエンサーを用いた新規ゲノム配列決定 / 野口英樹, 豊田敦 [執筆]
  • ゲノム網羅的バイサルファイトシークエンス / 三浦史仁, 伊藤隆司 [執筆]
  • ChIP-seq解析 / 永江玄太, 油谷浩幸 [執筆]
  • 細菌叢の16Sとメタゲノム解析 / 服部正平, 大島健志朗, 須田亙 [執筆]
  • 次世代シークエンサーによるクロマチン構造解析 / 野村征太郎, 油谷浩幸 [執筆]
  • 3C-seo, CHIA-PETを用いた染色体の三次元構造解析 / 田中博志, 白髭克彦 [執筆]
  • NGSショートリード解析 (イルミナ編) / 池尾一穂, 吉武和敏, 藤井信之 [執筆]
  • 解析ツール (454編) / 小柳亮 [執筆]
  • 次世代シークエンサーのデータアーカイブとその周辺サービス / 児玉悠一 [ほか執筆]
  • 実戦的ヒトがんゲノム解析 / 柴田龍弘 [執筆]
  • ヒトの疾患ゲノム解析 / 三宅紀子, 松本直通 [執筆]
  • アレル間の発現不均衡解析モデルとしてのメダカトランスクリプトーム解析 / 村田泰彦, 三谷啓志 [執筆]
  • 非モデル植物におけるNGSを用いたゲノム統合解析 / 西山智明, 長谷部光泰 [執筆]

内容説明・目次

内容説明

プロトコルにないノウハウがここにある。NGS稼働までの準備からde novo/リシークエンス/エピジェネティクス/ヒト疾患ゲノム解析への応用まで。

目次

  • 第1章 準務・導入編
  • 第2章 ヒトゲノム(既知ゲノム)解析編
  • 第3章 遺伝子発現制御解析編
  • 第4章 新規ゲノム配列決定編
  • 第5章 エピジェネティクス解析編
  • 第6章 メタゲノム解析編
  • 第7章 ゲノム構造解析編
  • 第8章 データ解析ツール&保存編
  • 第9章 統合解析編

「BOOKデータベース」 より

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